RNA–Protein interactions for RNA: YKR104W

YKR104W, Transcript of Putative transporter of the MRP subfamily, yeast

Gene YKR104W, Length 921 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YKR104W	YKR104W	MRD1	Q06106	887 aa	Known RBP	5.12	□□□□□ -1.59
YKR104W	YKR104W	SEC39	Q12745	709 aa		5.12	□□□□□ -1.59
YKR104W	YKR104W	RPL3	P14126	387 aa	Known RBP	5.11	□□□□□ -1.59
YKR104W	YKR104W	COQ3	P27680	312 aa		5.11	□□□□□ -1.59
YKR104W	YKR104W	IME2	P32581	645 aa		5.11	□□□□□ -1.59
YKR104W	YKR104W	LTV1	P34078	463 aa		5.11	□□□□□ -1.59
YKR104W	YKR104W	SEF1	P34228	1148 aa		5.11	□□□□□ -1.59
YKR104W	YKR104W	HEL1	P36113	551 aa		5.11	□□□□□ -1.59
YKR104W	YKR104W	WSS1	P38838	269 aa		5.11	□□□□□ -1.59
YKR104W	YKR104W	BUD16	P39988	312 aa		5.11	□□□□□ -1.59
YKR104W	YKR104W	OSW5	P40219	148 aa		5.11	□□□□□ -1.59
YKR104W	YKR104W	YIL024C	P40543	189 aa		5.11	□□□□□ -1.59
YKR104W	YKR104W	PET130	P47065	347 aa		5.11	□□□□□ -1.59
YKR104W	YKR104W	MNP1	P53163	194 aa	Predicted RBP	5.11	□□□□□ -1.59
YKR104W	YKR104W	YGR111W	P53265	400 aa		5.11	□□□□□ -1.59
YKR104W	YKR104W	COP1	P53622	1201 aa	Known RBP	5.11	□□□□□ -1.59
YKR104W	YKR104W	RQC1	Q05468	723 aa	Known RBP	5.11	□□□□□ -1.59
YKR104W	YKR104W	MMR1	Q06324	491 aa		5.11	□□□□□ -1.59
YKR104W	YKR104W	CDC45	Q08032	650 aa		5.11	□□□□□ -1.59
YKR104W	YKR104W	DCI1	Q08558	271 aa		5.11	□□□□□ -1.59
YKR104W	YKR104W	SPE4	Q12455	300 aa		5.11	□□□□□ -1.59
YKR104W	YKR104W	RRP36	Q12481	300 aa	Predicted RBP	5.11	□□□□□ -1.59
YKR104W	YKR104W	GAL80	P04387	435 aa		5.1	□□□□□ -1.59
YKR104W	YKR104W	EST1	P17214	699 aa	Predicted RBP	5.1	□□□□□ -1.59
YKR104W	YKR104W	CLC1	P17891	233 aa		5.1	□□□□□ -1.59
YKR104W	YKR104W	MAK32	P23060	363 aa		5.1	□□□□□ -1.59
YKR104W	YKR104W	URK1	P27515	501 aa		5.1	□□□□□ -1.59
YKR104W	YKR104W	SYN8	P31377	255 aa		5.1	□□□□□ -1.59
YKR104W	YKR104W	CMC1	P36064	111 aa		5.1	□□□□□ -1.59
YKR104W	YKR104W	VPS41	P38959	992 aa		5.1	□□□□□ -1.59
YKR104W	YKR104W	YMR124W	P39523	943 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
YKR104W	YKR104W	SGN1	P40561	250 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.1	□□□□□ -1.59	not detected
YKR104W	YKR104W	DLD2	P46681	530 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
YKR104W	YKR104W	LYS4	P49367	693 aa	Predicted RBP	5.1	□□□□□ -1.59
YKR104W	YKR104W	ERV25	P54837	211 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
YKR104W	YKR104W	SNU56	Q03782	492 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
YKR104W	YKR104W	DON1	Q05610	365 aa		5.1	□□□□□ -1.59
YKR104W	YKR104W	YLH47	Q06493	454 aa		5.1	□□□□□ -1.59
YKR104W	YKR104W	YDL242W	Q07746	117 aa		5.1	□□□□□ -1.59
YKR104W	YKR104W	YOR389W	Q08912	624 aa		5.1	□□□□□ -1.59
YKR104W	YKR104W	RTC5	Q12108	567 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
YKR104W	YKR104W	PSY3	Q12318	242 aa		5.1	□□□□□ -1.59
YKR104W	YKR104W	AVL9	Q12500	764 aa		5.1	□□□□□ -1.59
YKR104W	YKR104W	RPL6B	P05739	176 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
YKR104W	YKR104W	VMA16	P23968	213 aa		5.09	□□□□□ -1.59
YKR104W	YKR104W	NIP1	P32497	812 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
YKR104W	YKR104W	SRB5	P32585	307 aa		5.09	□□□□□ -1.59
YKR104W	YKR104W	SUR1	P33300	382 aa		5.09	□□□□□ -1.59
YKR104W	YKR104W	PMT1	P33775	817 aa		5.09	□□□□□ -1.59
YKR104W	YKR104W	ADH5	P38113	351 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
YKR104W	YKR104W	RRT2	P38332	387 aa		5.09	□□□□□ -1.59
YKR104W	YKR104W	VPS45	P38932	577 aa		5.09	□□□□□ -1.59
YKR104W	YKR104W	SAP1	P39955	897 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
YKR104W	YKR104W	SEC24	P40482	926 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
YKR104W	YKR104W	HXT14	P42833	540 aa		5.09	□□□□□ -1.59
YKR104W	YKR104W	FET5	P43561	622 aa		5.09	□□□□□ -1.59
YKR104W	YKR104W	CTK2	P46962	323 aa		5.09	□□□□□ -1.59
YKR104W	YKR104W	STR3	P53101	465 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
YKR104W	YKR104W	YGL036W	P53185	909 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
YKR104W	YKR104W	RPA49	Q01080	415 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
YKR104W	YKR104W	RPL6A	Q02326	176 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
YKR104W	YKR104W	MGR3	Q04472	501 aa		5.09	□□□□□ -1.59
YKR104W	YKR104W	PHO92	Q06390	306 aa		5.09	□□□□□ -1.59
YKR104W	YKR104W	HER1	Q12276	1246 aa		5.09	□□□□□ -1.59
YKR104W	YKR104W	ISN1	Q99312	450 aa		5.09	□□□□□ -1.59
YKR104W	YKR104W	ARD1	P07347	238 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
YKR104W	YKR104W	LRE1	P25579	583 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
YKR104W	YKR104W	PPQ1	P32945	549 aa		5.08	□□□□□ -1.6
YKR104W	YKR104W	GDT1	P38301	280 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
YKR104W	YKR104W	IMD2	P38697	523 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
YKR104W	YKR104W	YHR131C	P38835	850 aa		5.08	□□□□□ -1.6
YKR104W	YKR104W	STB2	P46679	850 aa		5.08	□□□□□ -1.6
YKR104W	YKR104W	IMD3	P50095	523 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
YKR104W	YKR104W	TWF1	P53250	332 aa		5.08	□□□□□ -1.6
YKR104W	YKR104W	ARP5	P53946	755 aa		5.08	□□□□□ -1.6
YKR104W	YKR104W	VTA1	Q06263	330 aa		5.08	□□□□□ -1.6
YKR104W	YKR104W	ATG23	Q06671	453 aa		5.08	□□□□□ -1.6
YKR104W	YKR104W	PML1	Q07930	204 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
YKR104W	YKR104W	FMP40	Q08968	688 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
YKR104W	YKR104W	PDR5	P33302	1511 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
YKR104W	YKR104W	RTC1	Q08281	1341 aa		5.07	□□□□□ -1.6
YKR104W	YKR104W	OM45	P16547	393 aa		5.07	□□□□□ -1.6
YKR104W	YKR104W	PDE1	P22434	369 aa		5.07	□□□□□ -1.6
YKR104W	YKR104W	RPF2	P36160	344 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
YKR104W	YKR104W	ARO9	P38840	513 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
YKR104W	YKR104W	CCT6	P39079	546 aa		5.07	□□□□□ -1.6
YKR104W	YKR104W	YIL089W	P40500	205 aa		5.07	□□□□□ -1.6
YKR104W	YKR104W	NAS2	P40555	220 aa		5.07	□□□□□ -1.6
YKR104W	YKR104W	CIN1	P40987	1014 aa		5.07	□□□□□ -1.6
YKR104W	YKR104W	SHE4	P51534	789 aa		5.07	□□□□□ -1.6
YKR104W	YKR104W	ALT2	P52892	507 aa		5.07	□□□□□ -1.6
YKR104W	YKR104W	SHE10	P53075	577 aa		5.07	□□□□□ -1.6
YKR104W	YKR104W	PDR16	P53860	351 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
YKR104W	YKR104W	ALF1	P53904	254 aa		5.07	□□□□□ -1.6
YKR104W	YKR104W	RNH1	Q04740	348 aa		5.07	□□□□□ -1.6
YKR104W	YKR104W	SOV1	Q04748	898 aa		5.07	□□□□□ -1.6
YKR104W	YKR104W	YML053C	Q04978	212 aa		5.07	□□□□□ -1.6
YKR104W	YKR104W	DBP9	Q06218	594 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
YKR104W	YKR104W	NOP6	Q07623	225 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
YKR104W	YKR104W	VPS54	Q12071	889 aa		5.07	□□□□□ -1.6

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 112 ms