RNA–Protein interactions for RNA: YHR104W

GRE3, Transcript of Aldose reductase, yeast

Gene GRE3, Length 984 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
GRE3	YHR104W	YJL043W	P47053	257 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GRE3	YHR104W	MDE1	P47095	244 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GRE3	YHR104W	STB4	P50104	949 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GRE3	YHR104W	ORC5	P50874	479 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GRE3	YHR104W	MSC1	Q03104	513 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GRE3	YHR104W	ULA1	Q12059	462 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GRE3	YHR104W	MRH1	Q12117	320 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
GRE3	YHR104W	SEC3	P33332	1336 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
GRE3	YHR104W	RAV1	P47104	1357 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GRE3	YHR104W	CLB2	P24869	491 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GRE3	YHR104W	YCR006C	P25350	157 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GRE3	YHR104W	GSY2	P27472	705 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GRE3	YHR104W	YIM1	P28625	365 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GRE3	YHR104W	SHP1	P34223	423 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GRE3	YHR104W	YSW1	P38280	609 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GRE3	YHR104W	APD1	P38281	316 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GRE3	YHR104W	ANS1	P38832	159 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GRE3	YHR104W	MBB1	P39534	108 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GRE3	YHR104W	UBP5	P39944	805 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GRE3	YHR104W	CDC1	P40986	491 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GRE3	YHR104W	ALT2	P52892	507 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GRE3	YHR104W	YGL108C	P53139	140 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GRE3	YHR104W	RMD9	P53140	646 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
GRE3	YHR104W	RHO5	P53879	331 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
GRE3	YHR104W	VTI1	Q04338	217 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GRE3	YHR104W	TMN2	Q04562	672 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GRE3	YHR104W	DBP9	Q06218	594 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
GRE3	YHR104W	VAM3	Q12241	283 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GRE3	YHR104W	TFB5	Q3E7C1	72 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
GRE3	YHR104W	ADE5,7	P07244	802 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
GRE3	YHR104W	CBP1	P07252	654 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GRE3	YHR104W	COR1	P07256	457 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GRE3	YHR104W	MAK32	P23060	363 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GRE3	YHR104W	MTR2	P34232	184 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
GRE3	YHR104W	OCT1	P35999	772 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GRE3	YHR104W	SER3	P40054	469 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GRE3	YHR104W	YTA12	P40341	825 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GRE3	YHR104W	FET5	P43561	622 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GRE3	YHR104W	EPL1	P43572	832 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GRE3	YHR104W	AIM22	P47051	409 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GRE3	YHR104W	MRK1	P50873	501 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GRE3	YHR104W	RPN9	Q04062	393 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
GRE3	YHR104W	PDR8	Q06149	701 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GRE3	YHR104W	DCS1	Q06151	350 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GRE3	YHR104W	ATG26	Q06321	1198 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GRE3	YHR104W	RPS10A	Q08745	105 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
GRE3	YHR104W	PSY3	Q12318	242 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GRE3	YHR104W	MTR10	Q99189	972 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GRE3	YHR104W	YKL023W	P36103	277 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
GRE3	YHR104W	ADH5	P38113	351 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
GRE3	YHR104W	PCL7	P40186	285 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GRE3	YHR104W	ULP2	P40537	1034 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
GRE3	YHR104W	NAS2	P40555	220 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GRE3	YHR104W	CHS6	P40955	746 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GRE3	YHR104W	RPS10B	P46784	105 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
GRE3	YHR104W	LYS20	P48570	428 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
GRE3	YHR104W	TOM22	P49334	152 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GRE3	YHR104W	YTP1	P53584	459 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GRE3	YHR104W	SUN4	P53616	420 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GRE3	YHR104W	SLG1	P54867	378 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GRE3	YHR104W	RRP9	Q06506	573 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
GRE3	YHR104W	YDL057W	Q07379	328 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GRE3	YHR104W	THP1	Q08231	455 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GRE3	YHR104W	MCH4	Q08268	501 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GRE3	YHR104W	HER1	Q12276	1246 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GRE3	YHR104W	RDL1	Q12305	139 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
GRE3	YHR104W	NBL1	Q3E7Y6	73 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GRE3	YHR104W	SPA2	P23201	1466 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
GRE3	YHR104W	PDE2	P06776	526 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GRE3	YHR104W	GPA1	P08539	472 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GRE3	YHR104W	AQY1	P0CD91	305 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GRE3	YHR104W	HIR2	P32480	875 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GRE3	YHR104W	PXL1	P36166	706 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GRE3	YHR104W	MRPL4	P36517	319 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GRE3	YHR104W	VHC1	P38329	1120 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GRE3	YHR104W	YHR210C	P38893	341 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GRE3	YHR104W	YIL089W	P40500	205 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GRE3	YHR104W	SNG1	P46950	547 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GRE3	YHR104W	ECM27	P47144	725 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GRE3	YHR104W	PYK2	P52489	506 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
GRE3	YHR104W	PDR16	P53860	351 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
GRE3	YHR104W	DUG3	P53871	357 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GRE3	YHR104W	HEF3	P53978	1044 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
GRE3	YHR104W	MLH2	Q07980	695 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GRE3	YHR104W	PUF2	Q12221	1075 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.81	□□□□□ -1.64	not detected
GRE3	YHR104W	SUT2	Q12286	268 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GRE3	YHR104W	PEP4	P07267	405 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
GRE3	YHR104W	RPC40	P07703	335 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
GRE3	YHR104W	NUP1	P20676	1076 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GRE3	YHR104W	KRE2	P27809	442 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GRE3	YHR104W	YMC1	P32331	307 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GRE3	YHR104W	REC114	P32841	428 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GRE3	YHR104W	ZTA1	P38230	334 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
GRE3	YHR104W	ARN1	P38731	627 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GRE3	YHR104W	FAD1	P38913	306 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GRE3	YHR104W	ERV46	P39727	415 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GRE3	YHR104W	YEL020C	P39994	560 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GRE3	YHR104W	VHS2	P40463	436 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GRE3	YHR104W	CIN1	P40987	1014 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GRE3	YHR104W	UBP8	P50102	471 aa		4.8	□□□□□ -1.64

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