RNA–Protein interactions for RNA: YEL009C

GCN4, Transcript of bZIP transcriptional activator of amino acid biosynthetic genes, yeastyeast

Gene GCN4, Length 846 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GCN4YEL009C POL3P15436 1097 aa2.3□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C PET123P17558 318 aa2.3□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C RAD57P25301 460 aa2.3□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C CWH43P25618 953 aa2.3□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C URK1P27515 501 aa2.3□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C GAC1P28006 793 aa2.3□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C GSH1P32477 678 aa2.3□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C FRE1P32791 686 aa2.3□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C GYP6P32806 458 aa2.3□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C TKL2P33315 681 aa2.3□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C NOP4P37838 685 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C RFS1P38234 210 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C SHE3P38272 425 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C YEL075CP39972 122 aa2.3□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C DSE1P40077 573 aa2.3□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C MMF1P40185 145 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C SEC9P40357 651 aa2.3□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C EFM4P40516 257 aa2.3□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C FAF1P40546 346 aaPredicted RBP2.3□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C MKT1P40850 830 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C IRC5P43610 853 aa2.3□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C MND1P53102 219 aa2.3□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C YGR021WP53212 290 aa2.3□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C ALF1P53904 254 aa2.3□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C YNL144CP53907 740 aa2.3□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C CRZ1P53968 678 aa2.3□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C ACS1Q01574 713 aa2.3□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C YVH1Q02256 364 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C ADA2Q02336 434 aa2.3□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C MUB1Q03162 620 aa2.3□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C SND1Q04007 877 aa2.3□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C ARO80Q04052 950 aa2.3□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C PRM6Q04705 352 aa2.3□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C YDR222WQ04925 415 aa2.3□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C FMP42Q04991 504 aa2.3□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C SIL1Q08199 421 aa2.3□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C BSC6Q08280 497 aa2.3□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C GPM2Q12008 311 aa2.3□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C DAS2Q12084 232 aa2.3□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C URA3P03962 267 aa2.29□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C RPL42AP0CX27 106 aaKnown RBP2.29□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C RPL42BP0CX28 106 aaKnown RBP2.29□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C MAS1P10507 462 aa2.29□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C EST1P17214 699 aaPredicted RBP2.29□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C PGS1P25578 521 aa2.29□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C LRE1P25579 583 aaKnown RBP2.29□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C HXT1P32465 570 aa2.29□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C SRB4P32569 687 aa2.29□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C MRP4P32902 394 aa2.29□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C NIC96P34077 839 aa2.29□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C TIF3P34167 436 aaKnown RBP2.29□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C BLI1P35727 113 aa2.29□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C YBR056WP38081 501 aa2.29□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C SRP68P38687 599 aaKnown RBP2.29□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C ARN1P38731 627 aa2.29□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C TCD1P38756 429 aa2.29□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C BZZ1P38822 633 aa2.29□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C ARO9P38840 513 aaPredicted RBP2.29□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C CAJ1P39101 391 aa2.29□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C RPT2P40327 437 aaKnown RBP2.29□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C ASG7P46993 209 aa2.29□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C APT1P49435 187 aaKnown RBP2.29□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C MNT2P53059 558 aa2.29□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C KAP114P53067 1004 aa2.29□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C HOP2P53187 214 aa2.29□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C YGR111WP53265 400 aa2.29□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C JJJ1P53863 590 aa2.29□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C YNL034WP53963 612 aa2.29□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C ADD37Q03233 198 aa2.29□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C GYL1Q04322 720 aa2.29□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C YMR018WQ04364 514 aa2.29□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C SOV1Q04748 898 aa2.29□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C SML1Q04964 104 aa2.29□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C VAC14Q06708 880 aa2.29□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C YDL242WQ07746 117 aa2.29□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C DIS3Q08162 1001 aaKnown RBP2.29□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C LEA1Q08963 238 aaPredicted RBP2.29□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C TAF10Q12030 206 aa2.29□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C VPS54Q12071 889 aa2.29□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C HRT3Q12347 344 aa2.29□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C EMP46Q12396 444 aa2.29□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C VPS5Q92331 675 aa2.29□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C BI3Q9ZZW7 517 aa2.29□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C ADE3P07245 946 aaKnown RBP2.28□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C PUT4P15380 627 aa2.28□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C KAR3P17119 729 aa2.28□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C CKI1P20485 582 aa2.28□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C PDE1P22434 369 aa2.28□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C SEC1P30619 724 aaKnown RBP2.28□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C SYN8P31377 255 aa2.28□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C DBF4P32325 704 aa2.28□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C SRB2P34162 210 aa2.28□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C SIF2P38262 535 aa2.28□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C RRT2P38332 387 aa2.28□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C PCA1P38360 1216 aa2.28□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C RCK2P38623 610 aa2.28□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C HIS2P38635 335 aa2.28□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C SPC72P39723 622 aa2.28□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C YER189WP40104 122 aa2.28□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C UBP7P40453 1071 aa2.28□□□□□ -2.04
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