RNA–Protein interactions for RNA: YDR457W

TOM1, Transcript of E3 ubiquitin ligase of the hect-domain class, yeast

Gene TOM1, Length 9,807 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TOM1	YDR457W	MIC26	P50087	233 aa		2.72	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	SSU72	P53538	206 aa	Predicted RBP	2.72	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	DAD3	P69850	94 aa		2.72	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	YLR271W	Q06152	274 aa		2.72	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	RPS19A	P07280	144 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	RPS19B	P07281	144 aa	Predicted RBP	2.72	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	ARG8	P18544	423 aa		2.72	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	ANB1	P19211	157 aa		2.72	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	ATO2	P32907	282 aa		2.72	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	JEN1	P36035	616 aa		2.72	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	VPS52	P39904	641 aa		2.72	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	RTT101	P47050	842 aa		2.72	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	BIO4	P53630	237 aa		2.72	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	MPS1	P54199	764 aa		2.72	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	CEG1	Q01159	459 aa	Predicted RBP	2.72	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	RAD30	Q04049	632 aa		2.72	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	CBP1	P07252	654 aa		2.72	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	MET16	P18408	261 aa	Predicted RBP	2.72	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	MGR1	P25573	417 aa		2.72	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	CLB6	P32943	380 aa		2.72	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	YBR284W	P38150	797 aa		2.72	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	BNA4	P38169	460 aa		2.72	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	CCC2	P38995	1004 aa		2.72	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	NPT1	P39683	429 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	KRE29	P40026	464 aa		2.72	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	TGL3	P40308	642 aa		2.72	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	YGR210C	P42942	411 aa		2.72	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	OTU1	P43558	301 aa		2.72	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	SIP4	P46954	829 aa		2.72	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	YGR067C	P53243	804 aa		2.72	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	VOA1	P53262	265 aa		2.72	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	YGR266W	P53326	701 aa		2.72	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	DAK1	P54838	584 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	SAE3	P89114	91 aa		2.72	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	TOS4	Q06266	489 aa		2.72	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	SLM3	Q12093	417 aa		2.72	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	MDM12	Q92328	271 aa		2.72	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	MEX67	Q99257	599 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	ILV2	P07342	687 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	MNS1	P32906	549 aa		2.72	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	RPB11	P38902	120 aa		2.72	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	PCL7	P40186	285 aa		2.72	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	GCD14	P46959	383 aa	Predicted RBP	2.72	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	DIE2	P50076	525 aa		2.72	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	FLC3	P53121	802 aa		2.72	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	BUD17	P53727	317 aa		2.72	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	YLR352W	Q06479	807 aa		2.72	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	PRP11	Q07350	266 aa	Predicted RBP	2.72	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	YCL001W-B	Q96VH2	84 aa		2.72	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	KRE6	P32486	720 aa		2.72	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	TSC10	P38342	320 aa		2.72	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	MCM22	P47167	239 aa		2.72	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	MTM1	P53320	366 aa		2.72	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	ALO1	P54783	526 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	KIN4	Q01919	800 aa		2.72	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	YDL129W	Q07555	291 aa		2.72	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	KNS1	P32350	737 aa	Predicted RBP	2.72	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	MAD2	P40958	196 aa		2.72	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	HXT14	P42833	540 aa		2.72	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	HSV2	P50079	448 aa	Predicted RBP	2.72	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	COG1	P53079	417 aa		2.72	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	AIM36	Q03798	255 aa		2.72	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	THI7	Q05998	598 aa		2.72	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	GAS2	Q06135	555 aa		2.72	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	CYK3	Q07533	885 aa		2.72	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	AIM39	Q08223	395 aa		2.72	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	SME1	Q12330	94 aa	Predicted RBP	2.72	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	ARP2	P32381	391 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	LIP5	P32875	414 aa		2.72	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	RCN1	P36054	211 aa		2.72	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	PTI1	P39927	425 aa	Predicted RBP	2.72	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	HXT11	P54862	567 aa		2.72	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	CTF19	Q02732	369 aa		2.72	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	YMD8	Q03697	442 aa		2.72	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	MCH5	Q08777	521 aa		2.72	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	TRX1	P22217	103 aa	Known RBP	2.71	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	SAC1	P32368	623 aa	Known RBP	2.71	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	SSS1	P35179	80 aa		2.71	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	DAD2	P36162	133 aa		2.71	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	PCS60	P38137	543 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.71	□□□□□ -1.97	not detected
TOM1	YDR457W	SLI1	P53304	468 aa		2.71	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	CTL1	Q03220	320 aa	Known RBP	2.71	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	YMR130W	Q04223	302 aa		2.71	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	PCD1	Q12524	340 aa		2.71	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	TIM9	O74700	87 aa		2.71	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	PRC1	P00729	532 aa		2.71	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	PPR1	P07272	904 aa	Predicted RBP	2.71	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	SAM1	P10659	382 aa	Known RBP	2.71	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	SNF6	P18888	332 aa		2.71	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	SRM1	P21827	482 aa		2.71	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	PHO84	P25297	587 aa	Known RBP	2.71	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	SIP1	P32578	815 aa		2.71	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	TMA19	P35691	167 aa	Known RBP	2.71	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	MRPL3	P36516	390 aa		2.71	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	PGM2	P37012	569 aa	Known RBP	2.71	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	MON2	P48563	1636 aa	Predicted RBP	2.71	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	ARO8	P53090	500 aa	Known RBP	2.71	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	USE1	P53146	245 aa		2.71	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	KXD1	P53158	218 aa		2.71	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	TUM1	Q08686	304 aa	Known RBP	2.71	□□□□□ -1.98

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