RNA–Protein interactions for RNA: YOR033C

EXO1, Transcript of 5'-3' exonuclease and flap-endonuclease, yeast

Gene EXO1, Length 2,109 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
EXO1	YOR033C	FRD1	P32614	470 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
EXO1	YOR033C	MKS1	P34072	584 aa		5.09	□□□□□ -1.59
EXO1	YOR033C	DUG2	P38149	878 aa		5.09	□□□□□ -1.59
EXO1	YOR033C	MAL32	P38158	584 aa		5.09	□□□□□ -1.59
EXO1	YOR033C	SIF2	P38262	535 aa		5.09	□□□□□ -1.59
EXO1	YOR033C	LEU5	P38702	357 aa		5.09	□□□□□ -1.59
EXO1	YOR033C	YHR045W	P38775	560 aa		5.09	□□□□□ -1.59
EXO1	YOR033C	PTC7	P38797	343 aa		5.09	□□□□□ -1.59
EXO1	YOR033C	LRP1	P38801	184 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
EXO1	YOR033C	GPB2	P39717	880 aa		5.09	□□□□□ -1.59
EXO1	YOR033C	SKP2	P42843	763 aa		5.09	□□□□□ -1.59
EXO1	YOR033C	CCT7	P42943	550 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
EXO1	YOR033C	CCC1	P47818	322 aa		5.09	□□□□□ -1.59
EXO1	YOR033C	YPT32	P51996	222 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
EXO1	YOR033C	PYK2	P52489	506 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
EXO1	YOR033C	MAL12	P53341	584 aa		5.09	□□□□□ -1.59
EXO1	YOR033C	CWC24	P53769	259 aa		5.09	□□□□□ -1.59
EXO1	YOR033C	GIM5	Q04493	163 aa		5.09	□□□□□ -1.59
EXO1	YOR033C	YOL019W	Q08157	551 aa		5.09	□□□□□ -1.59
EXO1	YOR033C	FYV7	Q12247	151 aa		5.09	□□□□□ -1.59
EXO1	YOR033C	ARG80	P07249	177 aa		5.08	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	CTR86	P25355	563 aa		5.08	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	NDI1	P32340	513 aa		5.08	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	DAL3	P32459	195 aa		5.08	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	VPS17	P32913	551 aa		5.08	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	SEO1	P39709	593 aa		5.08	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	VAB2	P40003	282 aa		5.08	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	RPN3	P40016	523 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	PHM8	P40025	321 aa		5.08	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	ORC5	P50874	479 aa		5.08	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	PRM1	P53835	661 aa		5.08	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	ENT5	Q03769	411 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	YDR387C	Q04162	555 aa		5.08	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	BOP2	Q06150	570 aa		5.08	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	ZRT2	Q12436	422 aa		5.08	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	RPI1	P23250	407 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	ADP1	P25371	1049 aa		5.08	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	RRT12	P25381	491 aa		5.08	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	YIM1	P28625	365 aa		5.08	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	CAM1	P29547	415 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	PTC1	P35182	281 aa		5.08	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	YET1	P35723	206 aa		5.08	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	DHR2	P36009	735 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	RPF2	P36160	344 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	KSP1	P38691	1029 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	AIM18	P38884	321 aa		5.08	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	HRB1	P38922	454 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.08	□□□□□ -1.6	not detected
EXO1	YOR033C	PFK26	P40433	827 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	YFL034W	P43564	1073 aa		5.08	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	JHD2	P47156	728 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	AMA1	P50082	593 aa		5.08	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	KXD1	P53158	218 aa		5.08	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	SLX9	P53251	210 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	LSC2	P53312	427 aa		5.08	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	KTR6	P54070	446 aa		5.08	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	ADE16	P54113	591 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	RPT6	Q01939	405 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	MTD1	Q02046	320 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	ELP4	Q02884	456 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	GSF2	Q04697	403 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	CIA1	Q05583	330 aa		5.08	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	DCR2	Q05924	578 aa		5.08	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	YLR455W	Q06188	304 aa		5.08	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	YDL086W	Q07505	273 aa		5.08	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	YNG1	Q08465	219 aa		5.08	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	KEL3	Q08979	651 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	YPL272C	Q08984	517 aa		5.08	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	RIM20	Q12033	661 aa		5.08	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	YOR114W	Q12219	294 aa		5.08	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	YOR019W	Q99248	730 aa		5.08	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	MRP1	P10662	321 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	ARO3	P14843	370 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	FUR1	P18562	216 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	CBP3	P21560	335 aa		5.07	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	PPH22	P23595	377 aa		5.07	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	VMA5	P31412	392 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	NDC1	P32500	655 aa		5.07	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	PRP40	P33203	583 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	CTF13	P35203	478 aa		5.07	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	RPC25	P35718	212 aa		5.07	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	AIM29	P36154	155 aa		5.07	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	GOS1	P38736	223 aa		5.07	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	BZZ1	P38822	633 aa		5.07	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	YHR182W	P38870	785 aa		5.07	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	SAH1	P39954	449 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	ATM1	P40416	690 aa		5.07	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	VHR1	P40522	640 aa		5.07	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	TIR3	P40552	269 aa		5.07	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	NCS6	P53088	359 aa		5.07	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	AIM14	P53109	570 aa		5.07	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	YBP2	P53169	641 aa		5.07	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	YGR042W	P53227	271 aa		5.07	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	GTF1	P53260	183 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	VOA1	P53262	265 aa		5.07	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	PUS6	P53294	404 aa		5.07	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	HDA1	P53973	706 aa		5.07	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	UME1	Q03010	460 aa		5.07	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	FLC1	Q08967	793 aa		5.07	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	SMF3	Q12078	473 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	HER1	Q12276	1246 aa		5.07	□□□□□ -1.6

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