RNA–Protein interactions for RNA: YMR117C

SPC24, Transcript of Component of the kinetochore-associated Ndc80 complex, yeast

Gene SPC24, Length 642 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SPC24	YMR117C	CSR2	Q12734	1121 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SPC24	YMR117C	GLN3	P18494	730 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SPC24	YMR117C	ART10	P18634	518 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
SPC24	YMR117C	PPZ1	P26570	692 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SPC24	YMR117C	YUR1	P26725	428 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SPC24	YMR117C	ERG1	P32476	496 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
SPC24	YMR117C	GCS1	P35197	352 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SPC24	YMR117C	RTT107	P38850	1070 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SPC24	YMR117C	MAF1	P41910	395 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SPC24	YMR117C	MEP2	P41948	499 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SPC24	YMR117C	STB2	P46679	850 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SPC24	YMR117C	GUF1	P46943	645 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SPC24	YMR117C	VPS75	P53853	264 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SPC24	YMR117C	YPL014W	Q02606	381 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SPC24	YMR117C	CDC23	P16522	626 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SPC24	YMR117C	ACH1	P32316	526 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SPC24	YMR117C	TIF3	P34167	436 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
SPC24	YMR117C	IPI3	P53877	555 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SPC24	YMR117C	TDA7	P53882	636 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
SPC24	YMR117C	RHO4	Q00246	291 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SPC24	YMR117C	SHR3	Q02774	210 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SPC24	YMR117C	DIC1	Q06143	298 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SPC24	YMR117C	FMP45	Q07651	309 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SPC24	YMR117C	NRT1	Q08485	598 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SPC24	YMR117C	MED1	Q12321	566 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SPC24	YMR117C	MRP13	P12686	339 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SPC24	YMR117C	HSC82	P15108	705 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
SPC24	YMR117C	MET8	P15807	274 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SPC24	YMR117C	RIM2	P38127	377 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SPC24	YMR117C	RMD8	P43620	662 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SPC24	YMR117C	IMD4	P50094	524 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
SPC24	YMR117C	YEH2	Q07950	538 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SPC24	YMR117C	DFR1	P07807	211 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.04	□□□□□ -1.6	not detected
SPC24	YMR117C	PEP5	P12868	1029 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SPC24	YMR117C	OCA4	P25366	362 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SPC24	YMR117C	RPS2	P25443	254 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
SPC24	YMR117C	VPS17	P32913	551 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SPC24	YMR117C	YNK1	P36010	153 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
SPC24	YMR117C	TCD2	P36101	447 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
SPC24	YMR117C	YBR225W	P38321	900 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SPC24	YMR117C	YER130C	P39959	443 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SPC24	YMR117C	YTA12	P40341	825 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SPC24	YMR117C	YJL070C	P40361	888 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SPC24	YMR117C	YJL068C	P40363	299 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SPC24	YMR117C	DIM1	P41819	318 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
SPC24	YMR117C	FIN1	Q03898	291 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SPC24	YMR117C	VPS38	Q05919	439 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SPC24	YMR117C	YDL057W	Q07379	328 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SPC24	YMR117C	NDD1	Q08887	554 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SPC24	YMR117C	AVL9	Q12500	764 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SPC24	YMR117C	PDA1	P16387	420 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
SPC24	YMR117C	SEC1	P30619	724 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
SPC24	YMR117C	ECM15	P35195	104 aa		5.03	□□□□□ -1.6
SPC24	YMR117C	YHR210C	P38893	341 aa		5.03	□□□□□ -1.6
SPC24	YMR117C	ALT2	P52892	507 aa		5.03	□□□□□ -1.6
SPC24	YMR117C	ARE2	P53629	642 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
SPC24	YMR117C	SAM50	P53969	484 aa		5.03	□□□□□ -1.6
SPC24	YMR117C	RPT6	Q01939	405 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
SPC24	YMR117C	GLO2	Q05584	274 aa		5.03	□□□□□ -1.6
SPC24	YMR117C	THI20	Q08224	551 aa		5.03	□□□□□ -1.6
SPC24	YMR117C	RLM1	Q12224	676 aa		5.03	□□□□□ -1.6
SPC24	YMR117C	SRO77	P38163	1010 aa		5.02	□□□□□ -1.61
SPC24	YMR117C	ALK1	P43633	760 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
SPC24	YMR117C	RBG2	P53295	368 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
SPC24	YMR117C	VPS72	Q03388	795 aa		5.02	□□□□□ -1.61
SPC24	YMR117C	MFB1	Q04922	465 aa		5.02	□□□□□ -1.61
SPC24	YMR117C	PDH1	Q12428	516 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
SPC24	YMR117C	MRP7	P12687	371 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SPC24	YMR117C	SEC62	P21825	274 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SPC24	YMR117C	PAP1	P29468	568 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
SPC24	YMR117C	NPR2	P39923	615 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SPC24	YMR117C	SGN1	P40561	250 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.01	□□□□□ -1.61	not detected
SPC24	YMR117C	YJR154W	P47181	346 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SPC24	YMR117C	BUD32	P53323	261 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SPC24	YMR117C	TIM10	P87108	93 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SPC24	YMR117C	TOF2	Q02208	771 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SPC24	YMR117C	RBA50	Q04418	439 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SPC24	YMR117C	COQ9	Q05779	260 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SPC24	YMR117C	YOR365C	Q08844	703 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SPC24	YMR117C	NCE102	Q12207	173 aa	RIP-Chip data	5.01	□□□□□ -1.61	not detected
SPC24	YMR117C	HSH49	Q99181	213 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
SPC24	YMR117C	GAL80	P04387	435 aa		5	□□□□□ -1.61
SPC24	YMR117C	PEP4	P07267	405 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
SPC24	YMR117C	PMS1	P14242	873 aa		5	□□□□□ -1.61
SPC24	YMR117C	RPN12	P32496	274 aa		5	□□□□□ -1.61
SPC24	YMR117C	YME1	P32795	747 aa		5	□□□□□ -1.61
SPC24	YMR117C	MSR1	P38714	643 aa		5	□□□□□ -1.61
SPC24	YMR117C	CSM2	P40465	213 aa		5	□□□□□ -1.61
SPC24	YMR117C	CRZ1	P53968	678 aa		5	□□□□□ -1.61
SPC24	YMR117C	YMR317W	Q04893	1140 aa		5	□□□□□ -1.61
SPC24	YMR117C	FOB1	O13329	566 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SPC24	YMR117C	PRD1	P25375	712 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SPC24	YMR117C	WBP1	P33767	430 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
SPC24	YMR117C	SHP1	P34223	423 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SPC24	YMR117C	DOT5	P40553	215 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SPC24	YMR117C	ARF3	P40994	183 aa	RIP-Chip data	4.99	□□□□□ -1.61	not detected
SPC24	YMR117C	COG4	Q06096	861 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SPC24	YMR117C	THP1	Q08231	455 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SPC24	YMR117C	DAP1	Q12091	152 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SPC24	YMR117C	SGV1	P23293	657 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61

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