RNA–Protein interactions for RNA: YMR088C

VBA1, Transcript of Permease of basic amino acids in the vacuolar membrane, yeast

Gene VBA1, Length 1,689 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VBA1	YMR088C	FUM1	P08417	488 aa	Known RBP	5.45	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	RPL35A	P0CX84	120 aa	Known RBP	5.45	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	RPL35B	P0CX85	120 aa	Known RBP	5.45	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	HOP1	P20050	605 aa		5.45	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	AAT2	P23542	418 aa	Known RBP	5.45	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	CPR4	P25334	318 aa		5.45	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	SNT1	P25357	1226 aa		5.45	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	GID7	P25569	745 aa		5.45	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	PHO91	P27514	894 aa		5.45	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	SSE2	P32590	693 aa	Known RBP	5.45	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	FRD1	P32614	470 aa	Known RBP	5.45	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	SCO2	P38072	301 aa		5.45	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	ACA1	P39970	489 aa		5.45	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	RPN3	P40016	523 aa	Known RBP	5.45	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	TFG2	P41896	400 aa	Predicted RBP	5.45	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	RPC17	P47076	161 aa		5.45	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	YJR079W	P47126	109 aa		5.45	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	HLJ1	P48353	224 aa		5.45	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	PUS4	P48567	403 aa	Known RBP	5.45	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	SAM37	P50110	327 aa		5.45	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	YMR279C	Q03263	540 aa		5.45	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	YDR476C	Q03362	224 aa		5.45	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	YAP6	Q03935	383 aa		5.45	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	TY1A-BL	Q12266	440 aa		5.45	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	EMP46	Q12396	444 aa		5.45	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	PDH1	Q12428	516 aa	Known RBP	5.45	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	NSI1	Q12457	570 aa		5.45	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	PGA3	Q12746	312 aa	Known RBP	5.45	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	SRD1	P09007	221 aa		5.44	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	MRP2	P10663	115 aa	Predicted RBP	5.44	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	MTF2	P10849	440 aa		5.44	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	FRS1	P15624	595 aa	Known RBP	5.44	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	PRI2	P20457	528 aa		5.44	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	HXT2	P23585	541 aa		5.44	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	PRR1	P28708	518 aa		5.44	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	SRP101	P32916	621 aa		5.44	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	OAF3	P36023	863 aa		5.44	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	MCD4	P36051	919 aa		5.44	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	DID4	P36108	232 aa		5.44	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	UBA4	P38820	440 aa		5.44	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	FMP32	P43557	207 aa		5.44	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	NPY1	P53164	384 aa		5.44	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	SCW11	P53189	542 aa		5.44	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	TNA1	P53322	534 aa		5.44	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	ELP3	Q02908	557 aa	Known RBP	5.44	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	NGL2	Q03264	515 aa	Known RBP	5.44	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	YMR265C	Q03508	461 aa	Known RBP	5.44	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	PLM2	Q04383	521 aa		5.44	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	HFD1	Q04458	532 aa		5.44	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	GPN3	Q06543	272 aa		5.44	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	GSH2	Q08220	491 aa		5.44	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	TGL5	Q12043	749 aa		5.44	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	HER1	Q12276	1246 aa		5.44	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	PNO1	Q99216	274 aa	Known RBP	5.44	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	Q0144	Q9ZZW2	109 aa		5.44	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	NUP159	P40477	1460 aa		5.44	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	CDC8	P00572	216 aa		5.43	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	GCN2	P15442	1659 aa		5.43	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	HPR1	P17629	752 aa	Known RBP	5.43	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	AAC3	P18238	307 aa		5.43	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	CNB1	P25296	175 aa		5.43	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	GPI10	P30777	616 aa		5.43	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	TFC1	P32367	649 aa		5.43	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	BEM3	P32873	1128 aa		5.43	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	NAT2	P37293	288 aa		5.43	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	PTC7	P38797	343 aa		5.43	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	NPR2	P39923	615 aa		5.43	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	CSM2	P40465	213 aa		5.43	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	LCB2	P40970	561 aa		5.43	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	PSA1	P41940	361 aa	Known RBP	5.43	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	HXT14	P42833	540 aa		5.43	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	OTU1	P43558	301 aa		5.43	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	NMD5	P46970	1048 aa		5.43	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	CTH1	P47976	325 aa		5.43	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	CUL3	P53202	744 aa		5.43	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	SLI1	P53304	468 aa		5.43	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	DIA1	P54005	336 aa		5.43	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	NAM8	Q00539	523 aa	Known RBP	5.43	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	SLD5	Q03406	294 aa		5.43	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	BUD22	Q04347	519 aa	Known RBP	5.43	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	RSF1	Q05043	376 aa		5.43	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	CRR1	Q05790	422 aa		5.43	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	RSB1	Q08417	382 aa		5.43	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	HRK1	Q08732	759 aa	Known RBP	5.43	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	YDL176W	Q12027	708 aa		5.43	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	PCD1	Q12524	340 aa		5.43	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	DST1	P07273	309 aa		5.43	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	PYC1	P11154	1178 aa	Known RBP	5.43	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	ABF1	P14164	731 aa		5.43	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	STE50	P25344	346 aa		5.43	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	CAM1	P29547	415 aa	Known RBP	5.43	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	PYC2	P32327	1180 aa	Known RBP	5.43	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	GSP1	P32835	219 aa	Known RBP	5.43	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	GSP2	P32836	220 aa	Known RBP	5.43	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	SPO23	P33757	523 aa		5.43	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	YBL055C	P34220	418 aa	Predicted RBP	5.43	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	AIM29	P36154	155 aa		5.43	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	MRPL16	P38064	232 aa		5.43	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	MAL32	P38158	584 aa		5.43	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	POA1	P38218	177 aa		5.43	□□□□□ -1.54

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 22.5 ms