RNA–Protein interactions for RNA: YKR078W

YKR078W, Transcript of Cytoplasmic protein of unknown function, yeastyeast

Gene YKR078W, Length 1,758 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YKR078WYKR078W TY1B-PLQ12414 1755 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
YKR078WYKR078W JIP3O13555 125 aa2.77□□□□□ -1.97
YKR078WYKR078W SUP35P05453 685 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
YKR078WYKR078W FRS2P15625 503 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
YKR078WYKR078W PHO81P17442 1178 aa2.77□□□□□ -1.97
YKR078WYKR078W RPO26P20435 155 aa2.77□□□□□ -1.97
YKR078WYKR078W GAC1P28006 793 aa2.77□□□□□ -1.97
YKR078WYKR078W PRO3P32263 286 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
YKR078WYKR078W YEL043WP32618 956 aa2.77□□□□□ -1.97
YKR078WYKR078W PRX1P34227 261 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
YKR078WYKR078W MUD2P36084 527 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
YKR078WYKR078W MRPL36P36531 177 aa2.77□□□□□ -1.97
YKR078WYKR078W ARP1P38696 384 aa2.77□□□□□ -1.97
YKR078WYKR078W YNG2P38806 282 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
YKR078WYKR078W CAJ1P39101 391 aa2.77□□□□□ -1.97
YKR078WYKR078W PHO90P39535 881 aa2.77□□□□□ -1.97
YKR078WYKR078W ACA1P39970 489 aa2.77□□□□□ -1.97
YKR078WYKR078W RGI2P40188 164 aa2.77□□□□□ -1.97
YKR078WYKR078W TFG2P41896 400 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
YKR078WYKR078W APT1P49435 187 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
YKR078WYKR078W MAL13P53338 473 aa2.77□□□□□ -1.97
YKR078WYKR078W HOT1Q03213 719 aa2.77□□□□□ -1.97
YKR078WYKR078W STE23Q06010 1027 aa2.77□□□□□ -1.97
YKR078WYKR078W ARR1Q06596 294 aa2.77□□□□□ -1.97
YKR078WYKR078W TSR1Q07381 788 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
YKR078WYKR078W CMS1Q07897 291 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
YKR078WYKR078W YOL159CQ08300 171 aa2.77□□□□□ -1.97
YKR078WYKR078W NFI1Q12216 726 aa2.77□□□□□ -1.97
YKR078WYKR078W GLE1Q12315 538 aa2.77□□□□□ -1.97
YKR078WYKR078W TPK1P06244 397 aa2.76□□□□□ -1.97
YKR078WYKR078W NUC1P08466 329 aa2.76□□□□□ -1.97
YKR078WYKR078W PRP16P15938 1071 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
YKR078WYKR078W TPM1P17536 199 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
YKR078WYKR078W ERG7P38604 731 aa2.76□□□□□ -1.97
YKR078WYKR078W ROK1P45818 564 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
YKR078WYKR078W GUF1P46943 645 aa2.76□□□□□ -1.97
YKR078WYKR078W PKP2P53170 491 aa2.76□□□□□ -1.97
YKR078WYKR078W YNR061CP53747 219 aa2.76□□□□□ -1.97
YKR078WYKR078W FCP1Q03254 732 aa2.76□□□□□ -1.97
YKR078WYKR078W INP2Q03824 705 aa2.76□□□□□ -1.97
YKR078WYKR078W YOL057WQ08225 711 aa2.76□□□□□ -1.97
YKR078WYKR078W NYV1Q12255 253 aa2.76□□□□□ -1.97
YKR078WYKR078W TY1B-AO13527 1196 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
YKR078WYKR078W PMR1P13586 950 aa2.75□□□□□ -1.97
YKR078WYKR078W UBC1P21734 215 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
YKR078WYKR078W MSM1P22438 575 aa2.75□□□□□ -1.97
YKR078WYKR078W RAD5P32849 1169 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
YKR078WYKR078W NFU1P32860 256 aa2.75□□□□□ -1.97
YKR078WYKR078W MIA40P36046 403 aa2.75□□□□□ -1.97
YKR078WYKR078W YSW1P38280 609 aa2.75□□□□□ -1.97
YKR078WYKR078W NAB3P38996 802 aaKnown RBP RIP-Chip data2.75□□□□□ -1.97not detected
YKR078WYKR078W YRB1P41920 201 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
YKR078WYKR078W CTF18P49956 741 aa2.75□□□□□ -1.97
YKR078WYKR078W YGL242CP53066 181 aa2.75□□□□□ -1.97
YKR078WYKR078W SDH5Q08230 162 aa2.75□□□□□ -1.97
YKR078WYKR078W HIF1Q12373 385 aa2.75□□□□□ -1.97
YKR078WYKR078W DDP1Q99321 188 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
YKR078WYKR078W VMR1P38735 1592 aa2.75□□□□□ -1.97
YKR078WYKR078W BUD3P25558 1636 aa2.75□□□□□ -1.97
YKR078WYKR078W CHC1P22137 1653 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
YKR078WYKR078W SPO14P36126 1683 aa2.74□□□□□ -1.97
YKR078WYKR078W SAC3P46674 1301 aa2.74□□□□□ -1.97
YKR078WYKR078W MRS3P10566 314 aa2.74□□□□□ -1.97
YKR078WYKR078W GCD2P12754 651 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
YKR078WYKR078W HSC82P15108 705 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
YKR078WYKR078W BUD14P27637 709 aa2.74□□□□□ -1.97
YKR078WYKR078W BRF1P29056 596 aa2.74□□□□□ -1.97
YKR078WYKR078W RAD16P31244 790 aa2.74□□□□□ -1.97
YKR078WYKR078W KAR9P32526 644 aa2.74□□□□□ -1.97
YKR078WYKR078W IFA38P38286 347 aa2.74□□□□□ -1.97
YKR078WYKR078W YAP3P38749 330 aa2.74□□□□□ -1.97
YKR078WYKR078W PET100P38958 111 aa2.74□□□□□ -1.97
YKR078WYKR078W DIM1P41819 318 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
YKR078WYKR078W TRS85P46944 698 aa2.74□□□□□ -1.97
YKR078WYKR078W SHE4P51534 789 aa2.74□□□□□ -1.97
YKR078WYKR078W IST1P53843 298 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
YKR078WYKR078W MRPL13Q02204 264 aa2.74□□□□□ -1.97
YKR078WYKR078W TMA64Q04600 565 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
YKR078WYKR078W GGA1Q06336 557 aa2.74□□□□□ -1.97
YKR078WYKR078W PSR2Q07949 397 aa2.74□□□□□ -1.97
YKR078WYKR078W CTI6Q08923 506 aa2.74□□□□□ -1.97
YKR078WYKR078W ERG27Q12452 347 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
YKR078WYKR078W NKP1Q12493 238 aa2.74□□□□□ -1.97
YKR078WYKR078W TY1B-JR2P47100 1755 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
YKR078WYKR078W TY1B-ER2Q03619 1755 aa2.74□□□□□ -1.97
YKR078WYKR078W TY1B-MR1Q04214 1755 aa2.74□□□□□ -1.97
YKR078WYKR078W TY1B-MR2Q04670 1755 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
YKR078WYKR078W TY1B-LR1Q12088 1755 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
YKR078WYKR078W TY1B-NL1Q12112 1755 aa2.74□□□□□ -1.97
YKR078WYKR078W TY1B-GR1Q12141 1755 aa2.74□□□□□ -1.97
YKR078WYKR078W TY1B-BLQ12490 1755 aa2.74□□□□□ -1.97
YKR078WYKR078W PDR18P53756 1333 aa2.74□□□□□ -1.97
YKR078WYKR078W RAD1P06777 1100 aa2.74□□□□□ -1.97
YKR078WYKR078W CDC16P09798 840 aa2.74□□□□□ -1.97
YKR078WYKR078W MTF2P10849 440 aa2.74□□□□□ -1.97
YKR078WYKR078W APA1P16550 321 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
YKR078WYKR078W CPR3P25719 182 aa2.74□□□□□ -1.97
YKR078WYKR078W CDC15P27636 974 aa2.74□□□□□ -1.97
YKR078WYKR078W EFB1P32471 206 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
YKR078WYKR078W ERG1P32476 496 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 124.3 ms