RNA–Protein interactions for RNA: YDL248W

COS7, Transcript of Protein of unknown function, yeast

Gene COS7, Length 1,152 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
COS7	YDL248W	TUL1	P36096	758 aa		4.58	□□□□□ -1.68
COS7	YDL248W	PIM1	P36775	1133 aa		4.58	□□□□□ -1.68
COS7	YDL248W	NTC20	P38302	140 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
COS7	YDL248W	LCB2	P40970	561 aa		4.58	□□□□□ -1.68
COS7	YDL248W	URB2	P47108	1174 aa		4.58	□□□□□ -1.68
COS7	YDL248W	LYS20	P48570	428 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
COS7	YDL248W	UBP8	P50102	471 aa		4.58	□□□□□ -1.68
COS7	YDL248W	FMS1	P50264	508 aa		4.58	□□□□□ -1.68
COS7	YDL248W	YGR126W	P53274	230 aa		4.58	□□□□□ -1.68
COS7	YDL248W	CAF130	P53280	1122 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
COS7	YDL248W	YTP1	P53584	459 aa		4.58	□□□□□ -1.68
COS7	YDL248W	RSM23	Q01163	450 aa		4.58	□□□□□ -1.68
COS7	YDL248W	RRP45	Q05636	305 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
COS7	YDL248W	ATG26	Q06321	1198 aa		4.58	□□□□□ -1.68
COS7	YDL248W	TPO3	Q06451	622 aa		4.58	□□□□□ -1.68
COS7	YDL248W	FRE3	Q08905	711 aa		4.58	□□□□□ -1.68
COS7	YDL248W	NAT1	P12945	854 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
COS7	YDL248W	TPM1	P17536	199 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
COS7	YDL248W	PRP2	P20095	876 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
COS7	YDL248W	KRR1	P25586	316 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
COS7	YDL248W	ADY2	P25613	283 aa		4.57	□□□□□ -1.68
COS7	YDL248W	ERV1	P27882	189 aa		4.57	□□□□□ -1.68
COS7	YDL248W	IDH2	P28241	369 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
COS7	YDL248W	RPN2	P32565	945 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
COS7	YDL248W	LTV1	P34078	463 aa		4.57	□□□□□ -1.68
COS7	YDL248W	ANS1	P38832	159 aa		4.57	□□□□□ -1.68
COS7	YDL248W	VMA13	P41807	478 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
COS7	YDL248W	NET1	P47035	1189 aa		4.57	□□□□□ -1.68
COS7	YDL248W	BPL1	P48445	690 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
COS7	YDL248W	YNL144C	P53907	740 aa		4.57	□□□□□ -1.68
COS7	YDL248W	HOT1	Q03213	719 aa		4.57	□□□□□ -1.68
COS7	YDL248W	TAP42	Q04372	366 aa		4.57	□□□□□ -1.68
COS7	YDL248W	RPS10A	Q08745	105 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
COS7	YDL248W	BRR1	Q99177	341 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
COS7	YDL248W	YER145C-A	A0A023PYF4	145 aa		4.56	□□□□□ -1.68
COS7	YDL248W	SPS4	P09937	338 aa		4.56	□□□□□ -1.68
COS7	YDL248W	ELO2	P25358	347 aa		4.56	□□□□□ -1.68
COS7	YDL248W	RAD14	P28519	371 aa		4.56	□□□□□ -1.68
COS7	YDL248W	MGM1	P32266	881 aa		4.56	□□□□□ -1.68
COS7	YDL248W	MTR2	P34232	184 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
COS7	YDL248W	SWH1	P35845	1188 aa		4.56	□□□□□ -1.68
COS7	YDL248W	HOT13	P36078	116 aa		4.56	□□□□□ -1.68
COS7	YDL248W	ATF1	P40353	525 aa		4.56	□□□□□ -1.68
COS7	YDL248W	RPS10B	P46784	105 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
COS7	YDL248W	ATP22	P50273	684 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
COS7	YDL248W	YGL138C	P53122	345 aa		4.56	□□□□□ -1.68
COS7	YDL248W	YGR111W	P53265	400 aa		4.56	□□□□□ -1.68
COS7	YDL248W	EAF7	P53911	425 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
COS7	YDL248W	ASI1	P54074	624 aa		4.56	□□□□□ -1.68
COS7	YDL248W	SKO1	Q02100	647 aa		4.56	□□□□□ -1.68
COS7	YDL248W	COQ9	Q05779	260 aa		4.56	□□□□□ -1.68
COS7	YDL248W	SPE3	Q12074	293 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
COS7	YDL248W	SUT2	Q12286	268 aa		4.56	□□□□□ -1.68
COS7	YDL248W	GPM3	Q12326	303 aa		4.56	□□□□□ -1.68
COS7	YDL248W	YLR111W	Q12528	110 aa		4.56	□□□□□ -1.68
COS7	YDL248W	CTF3	Q12748	733 aa		4.56	□□□□□ -1.68
COS7	YDL248W	RHO2	P06781	192 aa		4.55	□□□□□ -1.68
COS7	YDL248W	CBP1	P07252	654 aa		4.55	□□□□□ -1.68
COS7	YDL248W	NUP1	P20676	1076 aa		4.55	□□□□□ -1.68
COS7	YDL248W	SHP1	P34223	423 aa		4.55	□□□□□ -1.68
COS7	YDL248W	RRT2	P38332	387 aa		4.55	□□□□□ -1.68
COS7	YDL248W	UBA4	P38820	440 aa		4.55	□□□□□ -1.68
COS7	YDL248W	RIX1	P38883	763 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
COS7	YDL248W	ULP2	P40537	1034 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
COS7	YDL248W	IRC7	P43623	340 aa		4.55	□□□□□ -1.68
COS7	YDL248W	ATG27	P46989	271 aa		4.55	□□□□□ -1.68
COS7	YDL248W	COS5	P47187	383 aa		4.55	□□□□□ -1.68
COS7	YDL248W	PYK2	P52489	506 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
COS7	YDL248W	CUL3	P53202	744 aa		4.55	□□□□□ -1.68
COS7	YDL248W	BTN2	P53286	410 aa		4.55	□□□□□ -1.68
COS7	YDL248W	YMR160W	Q03823	816 aa		4.55	□□□□□ -1.68
COS7	YDL248W	ADE13	Q05911	482 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
COS7	YDL248W	COS7	Q07788	383 aa		4.55	□□□□□ -1.68
COS7	YDL248W	SKS1	Q12505	502 aa		4.55	□□□□□ -1.68
COS7	YDL248W	GPH1	P06738	902 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
COS7	YDL248W	SRV2	P17555	526 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
COS7	YDL248W	PPH22	P23595	377 aa		4.54	□□□□□ -1.68
COS7	YDL248W	SPB1	P25582	841 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
COS7	YDL248W	DPH2	P32461	534 aa		4.54	□□□□□ -1.68
COS7	YDL248W	YKL023W	P36103	277 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
COS7	YDL248W	SLM4	P38247	162 aa		4.54	□□□□□ -1.68
COS7	YDL248W	YHR210C	P38893	341 aa		4.54	□□□□□ -1.68
COS7	YDL248W	AIM22	P47051	409 aa		4.54	□□□□□ -1.68
COS7	YDL248W	YGR149W	P48236	432 aa		4.54	□□□□□ -1.68
COS7	YDL248W	EOS1	P53938	366 aa		4.54	□□□□□ -1.68
COS7	YDL248W	ARP10	Q04549	284 aa		4.54	□□□□□ -1.68
COS7	YDL248W	ORM2	Q06144	216 aa		4.54	□□□□□ -1.68
COS7	YDL248W	SMF3	Q12078	473 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
COS7	YDL248W	MED2	Q12124	431 aa		4.54	□□□□□ -1.68
COS7	YDL248W	PUF2	Q12221	1075 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.54	□□□□□ -1.68	not detected
COS7	YDL248W	HIP1	P06775	603 aa		4.53	□□□□□ -1.68
COS7	YDL248W	PEP4	P07267	405 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
COS7	YDL248W	RPB8	P20436	146 aa		4.53	□□□□□ -1.68
COS7	YDL248W	RRP7	P25368	297 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
COS7	YDL248W	CUE2	P36075	443 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
COS7	YDL248W	STV1	P37296	890 aa		4.53	□□□□□ -1.68
COS7	YDL248W	ARP1	P38696	384 aa		4.53	□□□□□ -1.68
COS7	YDL248W	YHR054C	P38780	354 aa		4.53	□□□□□ -1.68
COS7	YDL248W	SNG1	P46950	547 aa		4.53	□□□□□ -1.68
COS7	YDL248W	TAX4	P47030	604 aa		4.53	□□□□□ -1.68

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