RNA–Protein interactions for RNA: YBR273C

UBX7, Transcript of UBX (ubiquitin regulatory X) domain-containing protein, yeast

Gene UBX7, Length 1,311 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
UBX7	YBR273C	MEP1	P40260	492 aa		4.81	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	YRB2	P40517	327 aa		4.81	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	COS4	P43542	379 aa		4.81	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	UPF3	P48412	387 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	CLD1	P53264	445 aa		4.81	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	SHY1	P53266	389 aa		4.81	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	MTD1	Q02046	320 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	RCF1	Q03713	159 aa		4.81	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	ECM11	Q04110	302 aa		4.81	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	RAD33	Q04231	177 aa		4.81	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	ERB1	Q04660	807 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	GAL83	Q04739	417 aa		4.81	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	YLR225C	Q05948	407 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	NUT2	Q06213	157 aa		4.81	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	HUA2	Q12134	243 aa		4.81	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	MCD1	Q12158	566 aa		4.81	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	RMD5	Q12508	421 aa		4.81	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	TOM1	Q03280	3268 aa		4.81	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	SUC2	P00724	532 aa		4.8	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	ARG3	P05150	338 aa		4.8	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	GPH1	P06738	902 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	MRP13	P12686	339 aa		4.8	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	URE2	P23202	354 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	CTR86	P25355	563 aa		4.8	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	EMC1	P25574	760 aa		4.8	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	RAD27	P26793	382 aa		4.8	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	ITR2	P30606	609 aa		4.8	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	FUN30	P31380	1131 aa		4.8	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	GUT2	P32191	649 aa		4.8	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	SAC1	P32368	623 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	VPH1	P32563	840 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	RPN2	P32565	945 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	IMP3	P32899	183 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	SCD5	P34758	872 aa		4.8	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	MRPL17	P36528	281 aa		4.8	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	HMT1	P38074	348 aa		4.8	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	EXO84	P38261	753 aa		4.8	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	MSC7	P38694	644 aa		4.8	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	ETP1	P38748	585 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	PEX18	P38855	283 aa		4.8	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	MTG2	P38860	518 aa		4.8	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	EGD2	P38879	174 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	GIP4	P39732	760 aa		4.8	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	AVT6	P40074	448 aa		4.8	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	YJL070C	P40361	888 aa		4.8	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	AYR1	P40471	297 aa		4.8	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	OPT1	P40897	799 aa		4.8	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	FKH2	P41813	862 aa		4.8	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	GCD10	P41814	478 aa		4.8	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	VPS25	P47142	202 aa		4.8	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	KEL2	P50090	882 aa		4.8	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	SLD3	P53135	668 aa		4.8	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	ARP4	P80428	489 aa		4.8	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	CEG1	Q01159	459 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	TLG1	Q03322	224 aa		4.8	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	RSN1	Q03516	953 aa		4.8	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	TAF12	Q03761	539 aa		4.8	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	GSF2	Q04697	403 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	RCO1	Q04779	684 aa		4.8	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	GPI11	Q06636	219 aa		4.8	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	YOL159C	Q08300	171 aa		4.8	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	GPB1	Q08886	897 aa		4.8	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	RAD7	P06779	565 aa		4.79	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	GCN3	P14741	305 aa		4.79	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	UBA1	P22515	1024 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	YCK2	P23292	546 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	YCR099C	P25657	155 aa		4.79	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	PEX3	P28795	441 aa		4.79	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	SYN8	P31377	255 aa		4.79	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	PRP21	P32524	280 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	STE14	P32584	239 aa		4.79	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	ATO2	P32907	282 aa		4.79	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	NUF2	P33895	451 aa		4.79	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	TSA1	P34760	196 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	MOT2	P34909	587 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	MAE1	P36013	669 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	YBR284W	P38150	797 aa		4.79	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	ACO2	P39533	789 aa		4.79	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	PAC1	P39946	494 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	YER034W	P40022	185 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	KRE29	P40026	464 aa		4.79	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	YRB1	P41920	201 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	STB2	P46679	850 aa		4.79	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	BFA1	P47113	574 aa		4.79	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	YJR107W	P47145	328 aa		4.79	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	GTO1	P48239	356 aa		4.79	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	GPI8	P49018	411 aa		4.79	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	TOM22	P49334	152 aa		4.79	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	TIM13	P53299	105 aa		4.79	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	CIK1	Q01649	594 aa		4.79	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	GOT1	Q03554	138 aa		4.79	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	EFR3	Q03653	782 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	RRP17	Q04031	235 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	GPI17	Q04080	534 aa		4.79	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	URC2	Q04411	772 aa		4.79	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	KRE28	Q04431	385 aa		4.79	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	ECM22	Q05958	814 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	ERF2	Q06551	359 aa		4.79	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	VAM6	Q07468	1049 aa		4.79	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	FMP45	Q07651	309 aa		4.79	□□□□□ -1.64

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