RNA–Protein interactions for RNA: YOL004W

SIN3, Transcript of Component of both the Rpd3S and Rpd3L histone deacetylase complexes, yeastyeast

Gene SIN3, Length 4,611 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SIN3YOL004W GPP2P40106 250 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W SLG1P54867 378 aa2.88□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W NDE2Q07500 545 aa2.88□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W CYK3Q07533 885 aa2.88□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W JIP3O13555 125 aa2.88□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W PRB1P09232 635 aa2.88□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W YFR010W-AP0C5N0 62 aa2.88□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W ERG8P24521 451 aa2.88□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W AAD3P25612 363 aa2.88□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W RPB9P27999 122 aa2.88□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W ARL1P38116 183 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W SRO7Q12038 1033 aa2.88□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W YLL054CQ12244 843 aa2.88□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W CPA1P07258 411 aaKnown RBP2.87□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W NFS1P25374 497 aa2.87□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W FAD1P38913 306 aa2.87□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W RTT101P47050 842 aa2.87□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W HST1P53685 503 aa2.87□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W YPR147CQ06522 304 aaKnown RBP2.87□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W TPO1Q07824 586 aa2.87□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W RSC58Q07979 502 aa2.87□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W ARG4P04076 463 aaPredicted RBP2.87□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W RFA1P22336 621 aaKnown RBP2.87□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W BYE1P36106 594 aa2.87□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W ARA1P38115 344 aa2.87□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W YHR033WP38690 423 aa2.87□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W NPP2P39997 493 aa2.87□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W NOP16P40007 231 aaKnown RBP2.87□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W GUP1P53154 560 aa2.87□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W CWC22P53333 577 aaKnown RBP2.87□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W MEP3P53390 489 aa2.87□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W NHX1Q04121 633 aa2.87□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W AVO1Q08236 1176 aa2.87□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W GEP3Q08622 556 aa2.87□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W NDD1Q08887 554 aa2.87□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W TY4B-JP47024 1803 aa2.87□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W SIR3P06701 978 aa2.87□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W ISY1P21374 235 aaPredicted RBP2.87□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W MLF3P32047 452 aa2.87□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W REC104P33323 182 aa2.87□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W ERG10P41338 398 aaKnown RBP2.87□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W ALK1P43633 760 aaKnown RBP2.87□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W GUS1P46655 708 aaKnown RBP RIP-Chip data2.87□□□□□ -1.95not detected
SIN3YOL004W SIP4P46954 829 aa2.87□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W YJL132WP47014 750 aa2.87□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W PCL10P53124 433 aa2.87□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W PDS5Q04264 1277 aa2.87□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W YOR223WQ12015 292 aa2.87□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W GTT2Q12390 233 aa2.87□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W CLN3P13365 580 aa2.86□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W MDL1P33310 695 aa2.86□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W DUN1P39009 513 aa2.86□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W QRI7P43122 407 aa2.86□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W CAF16P43569 289 aa2.86□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W SEH1P53011 349 aaKnown RBP2.86□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W CBK1P53894 756 aa2.86□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W YOL114CQ12322 202 aa2.86□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W GCN4P03069 281 aa2.86□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W SEC53P07283 254 aaKnown RBP2.86□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W PET123P17558 318 aa2.86□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W RRP43P25359 394 aaPredicted RBP2.86□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W SAC6P32599 642 aaKnown RBP2.86□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W SHP1P34223 423 aa2.86□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W FMP52P40008 231 aa2.86□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W MRPS35P53292 345 aa2.86□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W RTT102P53330 157 aa2.86□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W YPR003CP53394 754 aa2.86□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W EOS1P53938 366 aa2.86□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W CEG1Q01159 459 aaPredicted RBP2.86□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W ACS1Q01574 713 aa2.86□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W RPS15Q01855 142 aaKnown RBP2.86□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W YMR187CQ03236 431 aa2.86□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W SMD2Q06217 110 aaKnown RBP2.86□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W MEC1P38111 2368 aa2.86□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W RPC40P07703 335 aaKnown RBP2.86□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W PDX1P16451 410 aa2.86□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W DGR2P32330 852 aa2.86□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W DAL3P32459 195 aa2.86□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W DUG3P53871 357 aa2.86□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W RKM2Q03942 479 aa2.86□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W YLR036CQ07986 203 aa2.86□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W NUR1Q12066 484 aa2.86□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W TOP3P13099 656 aa2.86□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W SAN1P22470 610 aa2.86□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W GCS1P35197 352 aa2.86□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W YPQ1Q12010 308 aa2.86□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W MTR10Q99189 972 aa2.86□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W YOS9Q99220 542 aa2.86□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W SAL1D6W196 494 aa2.85□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W DIF1O13577 133 aa2.85□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W GDH1P07262 454 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W LEU1P07264 779 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W YJL197C-AP0C5P0 93 aa2.85□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W KIN82P25341 720 aa2.85□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W SEF1P34228 1148 aa2.85□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W YSW1P38280 609 aa2.85□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W STB2P46679 850 aa2.85□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W ARA2Q04212 335 aa2.85□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W YLR297WQ05899 129 aa2.85□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W YPR196WQ06595 470 aa2.85□□□□□ -1.95
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