RNA–Protein interactions for RNA: YLR117C

CLF1, Transcript of Member of the NineTeen Complex (NTC), yeast

Gene CLF1, Length 2,064 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CLF1	YLR117C	COB	P00163	385 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	PAB1	P04147	577 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.74	□□□□□ -1.65	not detected
CLF1	YLR117C	SNF1	P06782	633 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	RAD10	P06838	210 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	ARO3	P14843	370 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	KRR1	P25586	316 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	GUT2	P32191	649 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	UTR4	P32626	227 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	VAM7	P32912	316 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	SRB2	P34162	210 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	SPT10	P35208	640 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	YKL077W	P36081	392 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	EDS1	P38073	919 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	NCL1	P38205	684 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	SAP30	P38429	201 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	IPI1	P38803	334 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	YHR131C	P38835	850 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	YEL020C	P39994	560 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	BIM1	P40013	344 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	EMP47	P43555	445 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	AIM23	P47015	356 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	UBC12	P52491	188 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	PEX8	P53248	589 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	ARE2	P53629	642 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	MNT4	P53745	580 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	CWC24	P53769	259 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	CWC21	Q03375	135 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	ARP10	Q04549	284 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	BSC2	Q05611	235 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	ADY4	Q05955	493 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	SPH1	Q06160	661 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	NBA1	Q08229	501 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	LYS21	Q12122	440 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	ARP7	Q12406	477 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	ERP4	Q12450	207 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	YCL001W-B	Q96VH2	84 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	DFG16	Q99234	619 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	LAT1	P12695	482 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	HOM2	P13663	365 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	RPL3	P14126	387 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	NSP1	P14907	823 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	HPR1	P17629	752 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	VMA16	P23968	213 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	RPS7A	P26786	190 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	DBF4	P32325	704 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	DAL1	P32375	460 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	MEI5	P32489	222 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	TOD6	P34219	525 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	YBR259W	P38338	688 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	PCA1	P38360	1216 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	HRB1	P38922	454 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.73	□□□□□ -1.65	not detected
CLF1	YLR117C	FHL1	P39521	936 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	YER184C	P39961	794 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	MIT1	P40002	666 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	PIG2	P40187	538 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	ERG10	P41338	398 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	GSM1	P42950	618 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	BST1	P43571	1029 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	SAE2	P46946	345 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	RPS12	P48589	143 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	BIO3	P50277	480 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	SLD3	P53135	668 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	YGL036W	P53185	909 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	CAF120	P53836	1060 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	ATG16	Q03818	150 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	CUE5	Q08412	411 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	MUM3	Q08750	479 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	MDM32	Q12171	622 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	RPN6	Q12377	434 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	CBP2	P03874	630 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	NGG1	P32494	702 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	DOA4	P32571	926 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	TOM20	P35180	183 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	JEN1	P36035	616 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	STV1	P37296	890 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	YBR056W	P38081	501 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	RIM2	P38127	377 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	GPX2	P38143	162 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	YBL028C	P38202	106 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	ALG14	P38242	237 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	ERP2	P39704	215 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	CIN1	P40987	1014 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	SPT20	P50875	604 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	GPI1	P53306	609 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	CPR8	P53728	308 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	RPS15	Q01855	142 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	FLO11	P08640	1367 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	RPL25	P04456	142 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	ARG3	P05150	338 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	SNF3	P10870	884 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	UGA1	P17649	471 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	GLK1	P17709	500 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	AAC3	P18238	307 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	CCA1	P21269	546 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	APA2	P22108	325 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	YCK1	P23291	538 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	SRO9	P25567	434 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	RSC6	P25632	483 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	NTG1	P31378	399 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	ANP1	P32629	500 aa		4.72	□□□□□ -1.65

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