RNA–Protein interactions for RNA: YHR160C

PEX18, Transcript of Peroxin, yeast

Gene PEX18, Length 852 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PEX18	YHR160C	RSF2	P46974	1380 aa		3.5	□□□□□ -1.85
PEX18	YHR160C	YML002W	P0CF17	737 aa		3.49	□□□□□ -1.85
PEX18	YHR160C	MTF2	P10849	440 aa		3.49	□□□□□ -1.85
PEX18	YHR160C	KRS1	P15180	591 aa	Known RBP	3.49	□□□□□ -1.85
PEX18	YHR160C	UBC1	P21734	215 aa	Known RBP	3.49	□□□□□ -1.85
PEX18	YHR160C	TFC3	P34111	1160 aa		3.49	□□□□□ -1.85
PEX18	YHR160C	RIM2	P38127	377 aa		3.49	□□□□□ -1.85
PEX18	YHR160C	PSD1	P39006	500 aa		3.49	□□□□□ -1.85
PEX18	YHR160C	PFK26	P40433	827 aa	Known RBP	3.49	□□□□□ -1.85
PEX18	YHR160C	RPN11	P43588	306 aa	Known RBP	3.49	□□□□□ -1.85
PEX18	YHR160C	RRT6	P53117	311 aa	Predicted RBP	3.49	□□□□□ -1.85
PEX18	YHR160C	CRZ1	P53968	678 aa		3.49	□□□□□ -1.85
PEX18	YHR160C	TFC6	Q06339	672 aa		3.49	□□□□□ -1.85
PEX18	YHR160C	IMH1	Q06704	911 aa	Known RBP	3.49	□□□□□ -1.85
PEX18	YHR160C	DAP1	Q12091	152 aa		3.49	□□□□□ -1.85
PEX18	YHR160C	YOR019W	Q99248	730 aa		3.49	□□□□□ -1.85
PEX18	YHR160C	AUS1	Q08409	1394 aa		3.49	□□□□□ -1.85
PEX18	YHR160C	PMS1	P14242	873 aa		3.48	□□□□□ -1.85
PEX18	YHR160C	GLN3	P18494	730 aa		3.48	□□□□□ -1.85
PEX18	YHR160C	YIR014W	P40570	242 aa		3.48	□□□□□ -1.85
PEX18	YHR160C	AZF1	P41696	914 aa		3.48	□□□□□ -1.85
PEX18	YHR160C	PKP2	P53170	491 aa		3.48	□□□□□ -1.85
PEX18	YHR160C	NNF2	P53253	936 aa		3.48	□□□□□ -1.85
PEX18	YHR160C	PAP2	P53632	584 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
PEX18	YHR160C	REG1	Q00816	1014 aa		3.48	□□□□□ -1.85
PEX18	YHR160C	NUP100	Q02629	959 aa		3.48	□□□□□ -1.85
PEX18	YHR160C	VCX1	Q99385	411 aa		3.48	□□□□□ -1.85
PEX18	YHR160C	RPS24A	P0CX31	135 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
PEX18	YHR160C	RPS24B	P0CX32	135 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
PEX18	YHR160C	PGI1	P12709	554 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
PEX18	YHR160C	PDA1	P16387	420 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
PEX18	YHR160C	ERG8	P24521	451 aa		3.47	□□□□□ -1.85
PEX18	YHR160C	GID7	P25569	745 aa		3.47	□□□□□ -1.85
PEX18	YHR160C	RAD16	P31244	790 aa		3.47	□□□□□ -1.85
PEX18	YHR160C	ARP1	P38696	384 aa		3.47	□□□□□ -1.85
PEX18	YHR160C	IST3	P40565	148 aa	Predicted RBP	3.47	□□□□□ -1.85
PEX18	YHR160C	CTF18	P49956	741 aa		3.47	□□□□□ -1.85
PEX18	YHR160C	UBX4	P54730	416 aa		3.47	□□□□□ -1.85
PEX18	YHR160C	BLS1	Q06071	122 aa		3.47	□□□□□ -1.85
PEX18	YHR160C	ERG27	Q12452	347 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
PEX18	YHR160C	PMD1	P32634	1753 aa		3.47	□□□□□ -1.85
PEX18	YHR160C	ERG7	P38604	731 aa		3.46	□□□□□ -1.86
PEX18	YHR160C	KRE9	P39005	276 aa		3.46	□□□□□ -1.86
PEX18	YHR160C	DHH1	P39517	506 aa	Known RBP	3.46	□□□□□ -1.86
PEX18	YHR160C	YJR008W	P47085	338 aa		3.46	□□□□□ -1.86
PEX18	YHR160C	ADE13	Q05911	482 aa	Known RBP	3.46	□□□□□ -1.86
PEX18	YHR160C	CSR1	Q06705	408 aa	Known RBP	3.46	□□□□□ -1.86
PEX18	YHR160C	SLM3	Q12093	417 aa		3.46	□□□□□ -1.86
PEX18	YHR160C	ATG9	Q12142	997 aa		3.46	□□□□□ -1.86
PEX18	YHR160C	ROM2	P51862	1356 aa	Known RBP	3.46	□□□□□ -1.86
PEX18	YHR160C	FAS2	P19097	1887 aa	Known RBP	3.45	□□□□□ -1.86
PEX18	YHR160C	DBF20	P32328	564 aa		3.45	□□□□□ -1.86
PEX18	YHR160C	PHO90	P39535	881 aa		3.45	□□□□□ -1.86
PEX18	YHR160C	SMK1	P41808	388 aa		3.45	□□□□□ -1.86
PEX18	YHR160C	PSK2	Q08217	1101 aa		3.45	□□□□□ -1.86
PEX18	YHR160C	SIR4	P11978	1358 aa		3.45	□□□□□ -1.86
PEX18	YHR160C	HKR1	P41809	1802 aa		3.44	□□□□□ -1.86
PEX18	YHR160C	YRF1-4	O13559	1382 aa		3.44	□□□□□ -1.86
PEX18	YHR160C	HXK2	P04807	486 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
PEX18	YHR160C	GAC1	P28006	793 aa		3.44	□□□□□ -1.86
PEX18	YHR160C	MIA40	P36046	403 aa		3.44	□□□□□ -1.86
PEX18	YHR160C	YER130C	P39959	443 aa		3.44	□□□□□ -1.86
PEX18	YHR160C	SEC24	P40482	926 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
PEX18	YHR160C	IST1	P53843	298 aa	Predicted RBP	3.44	□□□□□ -1.86
PEX18	YHR160C	YMR178W	Q03219	274 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
PEX18	YHR160C	ATG26	Q06321	1198 aa		3.44	□□□□□ -1.86
PEX18	YHR160C	TRM8	Q12009	286 aa		3.44	□□□□□ -1.86
PEX18	YHR160C	DUR1,2	P32528	1835 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
PEX18	YHR160C	CDC15	P27636	974 aa		3.43	□□□□□ -1.86
PEX18	YHR160C	YOX1	P34161	385 aa		3.43	□□□□□ -1.86
PEX18	YHR160C	RGI2	P40188	164 aa		3.43	□□□□□ -1.86
PEX18	YHR160C	PKP1	P40530	394 aa		3.43	□□□□□ -1.86
PEX18	YHR160C	DOT5	P40553	215 aa		3.43	□□□□□ -1.86
PEX18	YHR160C	IME4	P41833	600 aa		3.43	□□□□□ -1.86
PEX18	YHR160C	GUF1	P46943	645 aa		3.43	□□□□□ -1.86
PEX18	YHR160C	BNA1	P47096	177 aa		3.43	□□□□□ -1.86
PEX18	YHR160C	STR3	P53101	465 aa	Known RBP	3.43	□□□□□ -1.86
PEX18	YHR160C	PDS5	Q04264	1277 aa		3.43	□□□□□ -1.86
PEX18	YHR160C	TMA64	Q04600	565 aa	Known RBP	3.43	□□□□□ -1.86
PEX18	YHR160C	YBR298C-A	Q8TGK4	73 aa		3.43	□□□□□ -1.86
PEX18	YHR160C	MRS3	P10566	314 aa		3.42	□□□□□ -1.86
PEX18	YHR160C	PRP16	P15938	1071 aa	Predicted RBP	3.42	□□□□□ -1.86
PEX18	YHR160C	LCB1	P25045	558 aa	Known RBP	3.42	□□□□□ -1.86
PEX18	YHR160C	PGS1	P25578	521 aa		3.42	□□□□□ -1.86
PEX18	YHR160C	PRO3	P32263	286 aa	Known RBP	3.42	□□□□□ -1.86
PEX18	YHR160C	ERG1	P32476	496 aa	Known RBP	3.42	□□□□□ -1.86
PEX18	YHR160C	TEF4	P36008	412 aa	Known RBP	3.42	□□□□□ -1.86
PEX18	YHR160C	ANS1	P38832	159 aa		3.42	□□□□□ -1.86
PEX18	YHR160C	YJL068C	P40363	299 aa		3.42	□□□□□ -1.86
PEX18	YHR160C	DPB11	P47027	764 aa	Predicted RBP	3.42	□□□□□ -1.86
PEX18	YHR160C	IMP4	P53941	290 aa	Known RBP	3.42	□□□□□ -1.86
PEX18	YHR160C	TAP42	Q04372	366 aa		3.42	□□□□□ -1.86
PEX18	YHR160C	RDR1	Q08904	546 aa		3.42	□□□□□ -1.86
PEX18	YHR160C	RPO41	P13433	1351 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
PEX18	YHR160C	YLR302C	O13544	120 aa		3.41	□□□□□ -1.86
PEX18	YHR160C	SNF1	P06782	633 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
PEX18	YHR160C	NOP1	P15646	327 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
PEX18	YHR160C	PFK2	P16862	959 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.41	□□□□□ -1.86	not detected
PEX18	YHR160C	MCM4	P30665	933 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
PEX18	YHR160C	PHD1	P36093	366 aa		3.41	□□□□□ -1.86

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