RNA–Protein interactions for RNA: YFR049W

YMR31, Transcript of Mitochondrial ribosomal protein of the small subunit, yeast

Gene YMR31, Length 372 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YMR31	YFR049W	RAP1	P11938	827 aa		2.7	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	TPM1	P17536	199 aa	Known RBP	2.7	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	CLC1	P17891	233 aa		2.7	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	YCR006C	P25350	157 aa		2.7	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	PUP3	P25451	205 aa	Known RBP	2.7	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	DMC1	P25453	334 aa		2.7	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	AAD3	P25612	363 aa		2.7	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	HXT3	P32466	567 aa	Known RBP	2.7	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	YBL055C	P34220	418 aa	Predicted RBP	2.7	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	MSR1	P38714	643 aa		2.7	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	DBP8	P38719	431 aa		2.7	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	YHR054C	P38780	354 aa		2.7	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	ANS1	P38832	159 aa		2.7	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	STB2	P46679	850 aa		2.7	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	SMC3	P47037	1230 aa		2.7	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	YGR111W	P53265	400 aa		2.7	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	YPR003C	P53394	754 aa		2.7	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	SUN4	P53616	420 aa		2.7	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	YNL144C	P53907	740 aa		2.7	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	EOS1	P53938	366 aa		2.7	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	YNL058C	P53947	316 aa		2.7	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	SEC5	P89102	971 aa		2.7	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	PRP42	Q03776	544 aa	Known RBP	2.7	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	FIN1	Q03898	291 aa		2.7	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	RSF1	Q05043	376 aa		2.7	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	HEL2	Q05580	639 aa	Known RBP	2.7	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	RBS1	Q05672	457 aa	Known RBP	2.7	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	THI3	Q07471	609 aa		2.7	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	CUE5	Q08412	411 aa	Known RBP	2.7	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	DCI1	Q08558	271 aa		2.7	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	CFT2	Q12102	859 aa	Predicted RBP	2.7	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	TAF3	Q12297	353 aa		2.7	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	ISN1	Q99312	450 aa		2.7	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	YMR084W	A2P2R3	262 aa		2.69	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	HEM1	P09950	548 aa	Predicted RBP	2.69	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	PMA2	P19657	947 aa		2.69	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	TKL1	P23254	680 aa	Known RBP	2.69	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	PRD1	P25375	712 aa		2.69	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	BUD14	P27637	709 aa		2.69	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	YJU2	P28320	278 aa	Predicted RBP	2.69	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	MSS51	P32335	436 aa		2.69	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	SMI1	P32566	505 aa		2.69	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	RML2	P32611	393 aa		2.69	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	YME2	P32843	850 aa		2.69	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	SEC66	P33754	206 aa		2.69	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	TUL1	P36096	758 aa		2.69	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	LAS1	P36146	502 aa	Predicted RBP	2.69	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	RPL32	P38061	130 aa	Known RBP	2.69	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	NTC20	P38302	140 aa	Predicted RBP	2.69	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	RRT2	P38332	387 aa		2.69	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	MUP3	P38734	546 aa		2.69	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	EXO1	P39875	702 aa		2.69	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	PHM8	P40025	321 aa		2.69	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	STU2	P46675	888 aa		2.69	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	YGL138C	P53122	345 aa		2.69	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	YPL107W	Q02873	248 aa		2.69	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	GIS1	Q03833	894 aa		2.69	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	SOV1	Q04748	898 aa		2.69	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	DON1	Q05610	365 aa		2.69	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	YLR456W	Q06199	204 aa		2.69	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	CDC45	Q08032	650 aa		2.69	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	SIL1	Q08199	421 aa		2.69	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	MRH1	Q12117	320 aa	Predicted RBP	2.69	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	RPN5	Q12250	445 aa	Known RBP	2.69	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	CHO1	P08456	276 aa		2.68	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	SAT4	P25333	603 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	GAC1	P28006	793 aa		2.68	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	BRF1	P29056	596 aa		2.68	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	PUP2	P32379	260 aa		2.68	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	EMP70	P32802	667 aa		2.68	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	RPC34	P32910	317 aa		2.68	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	TSC10	P38342	320 aa		2.68	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	UBP5	P39944	805 aa		2.68	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	TDA10	P42938	290 aa		2.68	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	RPN11	P43588	306 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	SAE2	P46946	345 aa		2.68	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	ERG26	P53199	349 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	RSM23	Q01163	450 aa		2.68	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	YVH1	Q02256	364 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	YDR341C	Q05506	607 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	RAD34	Q06665	692 aa		2.68	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	YDL057W	Q07379	328 aa		2.68	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	FRE3	Q08905	711 aa		2.68	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	YDL007C-A	Q2V2Q0	85 aa		2.68	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	YER145C-A	A0A023PYF4	145 aa		2.67	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	ARG81	P05085	880 aa		2.67	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	HIP1	P06775	603 aa		2.67	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	ADE5,7	P07244	802 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	RPL31B	P0C2H9	113 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	AQY1	P0CD91	305 aa		2.67	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	YML002W	P0CF17	737 aa		2.67	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	IDH2	P28241	369 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	AFG1	P32317	509 aa		2.67	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	YMC1	P32331	307 aa		2.67	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	ELM1	P32801	640 aa		2.67	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	NIP100	P33420	868 aa		2.67	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	SWH1	P35845	1188 aa		2.67	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	NUP133	P36161	1157 aa		2.67	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	THI2	P38141	450 aa		2.67	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	FTH1	P38310	465 aa		2.67	□□□□□ -1.98

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