RNA–Protein interactions for RNA: YBR273C

UBX7, Transcript of UBX (ubiquitin regulatory X) domain-containing protein, yeast

Gene UBX7, Length 1,311 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
UBX7	YBR273C	SKT5	P34226	696 aa		4.83	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	TPO5	P36029	618 aa		4.83	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	CAF4	P36130	643 aa		4.83	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	TFA2	P36145	328 aa		4.83	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	APE3	P37302	537 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	ROT2	P38138	954 aa		4.83	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	BRL1	P38770	471 aa		4.83	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	YHR218W	P38899	603 aa		4.83	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	FHL1	P39521	936 aa		4.83	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	RRD1	P40454	393 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	ESL1	P40456	1118 aa		4.83	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	IRR1	P40541	1150 aa		4.83	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	ELP2	P42935	788 aa		4.83	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	SWP82	P43554	623 aa		4.83	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	YGL176C	P46945	554 aa		4.83	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	SNG1	P46950	547 aa		4.83	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	YJR154W	P47181	346 aa		4.83	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	RPA14	P50106	137 aa		4.83	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	STR3	P53101	465 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	SFB2	P53953	876 aa		4.83	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	SED5	Q01590	340 aa		4.83	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	NUP100	Q02629	959 aa		4.83	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	SWP1	Q02795	286 aa		4.83	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	GAS3	Q03655	524 aa		4.83	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	RPN9	Q04062	393 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	SPO20	Q04359	397 aa		4.83	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	PEX12	Q04370	399 aa		4.83	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	SPG3	Q04398	127 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	ORM2	Q06144	216 aa		4.83	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	MCM21	Q06675	368 aa		4.83	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	RSB1	Q08417	382 aa		4.83	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	PUF2	Q12221	1075 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.83	□□□□□ -1.64	not detected
UBX7	YBR273C	CIT2	P08679	460 aa		4.82	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	NSP1	P14907	823 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	ART10	P18634	518 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	ACO1	P19414	778 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.82	□□□□□ -1.64	not detected
UBX7	YBR273C	CLN1	P20437	546 aa		4.82	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	PUP3	P25451	205 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	FUB1	P25659	250 aa		4.82	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	CIN8	P27895	1000 aa		4.82	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	MF(ALPHA)2	P32435	120 aa		4.82	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	PEP12	P32854	288 aa		4.82	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	RPS1A	P33442	255 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	CTF13	P35203	478 aa		4.82	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	SPC34	P36131	295 aa		4.82	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	DRE2	P36152	348 aa		4.82	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	SRP72	P38688	640 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	RIM4	P38741	713 aa		4.82	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	SSZ1	P38788	538 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	YHR131C	P38835	850 aa		4.82	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	FAD1	P38913	306 aa		4.82	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	RBG1	P39729	369 aa		4.82	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	MET18	P40469	1032 aa		4.82	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	VMA13	P41807	478 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	SKP2	P42843	763 aa		4.82	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	BUD13	P46947	266 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	TY4A-J	P47023	414 aa		4.82	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	YJL055W	P47044	245 aa		4.82	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	NCS6	P53088	359 aa		4.82	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	MET13	P53128	600 aa		4.82	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	BRE5	P53741	515 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	YNR068C	P53754	272 aa		4.82	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	TOF2	Q02208	771 aa		4.82	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	RSM24	Q03976	319 aa		4.82	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	TRM12	Q04235	462 aa		4.82	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	CRN1	Q06440	651 aa		4.82	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	ESC8	Q08119	714 aa		4.82	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	NUS1	Q12063	375 aa		4.82	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	YLR049C	Q12110	428 aa		4.82	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	UBX3	Q12229	455 aa		4.82	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	YLL054C	Q12244	843 aa		4.82	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	MAM3	Q12296	706 aa		4.82	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	PFK27	Q12471	397 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	YOL159C-A	Q3E769	90 aa		4.82	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	BRR1	Q99177	341 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	MED11	Q99278	115 aa		4.82	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	RPS9A	O13516	197 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	TPK3	P05986	398 aa		4.81	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	RHO1	P06780	209 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	SEC53	P07283	254 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	COS2	P0CX12	379 aa		4.81	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	COS3	P0CX13	379 aa		4.81	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	RPS4A	P0CX35	261 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	RPS4B	P0CX36	261 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	SSA1	P10591	642 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	HSF1	P10961	833 aa		4.81	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	KGD2	P19262	463 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	BUD23	P25627	275 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	PTM1	P32857	523 aa		4.81	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	CSE2	P33308	149 aa		4.81	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	DOM34	P33309	386 aa		4.81	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	YKL100C	P34248	587 aa		4.81	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	ADD66	P36040	267 aa		4.81	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	YPK3	P38070	525 aa		4.81	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	POL12	P38121	705 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	ECM13	P38195	257 aa		4.81	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	YLF2	P38746	405 aa		4.81	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	YHR045W	P38775	560 aa		4.81	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	APE4	P38821	490 aa		4.81	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	RGI2	P40188	164 aa		4.81	□□□□□ -1.64

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