RNA–Protein interactions for RNA: YLR347W-A

YLR347W-A, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YLR347W-A, Length 141 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YLR347W-AYLR347W-A GEA1P47102 1408 aaPredicted RBP3.89□□□□□ -1.79
YLR347W-AYLR347W-A HXK2P04807 486 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
YLR347W-AYLR347W-A SAC1P32368 623 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
YLR347W-AYLR347W-A KTR3P38130 404 aaPredicted RBP3.89□□□□□ -1.79
YLR347W-AYLR347W-A VID27P40157 782 aa3.89□□□□□ -1.79
YLR347W-AYLR347W-A PKP1P40530 394 aa3.89□□□□□ -1.79
YLR347W-AYLR347W-A SNM1P40993 198 aa3.89□□□□□ -1.79
YLR347W-AYLR347W-A ARC1P46672 376 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
YLR347W-AYLR347W-A MDV1P47025 714 aa3.89□□□□□ -1.79
YLR347W-AYLR347W-A INN1P53901 409 aa3.89□□□□□ -1.79
YLR347W-AYLR347W-A MPS1P54199 764 aa3.89□□□□□ -1.79
YLR347W-AYLR347W-A INA17Q02888 182 aa3.89□□□□□ -1.79
YLR347W-AYLR347W-A SKG3Q06315 1026 aa3.89□□□□□ -1.79
YLR347W-AYLR347W-A YAP7Q08182 245 aa3.89□□□□□ -1.79
YLR347W-AYLR347W-A GEA2P39993 1459 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
YLR347W-AYLR347W-A YBT1P32386 1661 aa3.89□□□□□ -1.79
YLR347W-AYLR347W-A TY3B-GQ99315 1547 aa3.89□□□□□ -1.79
YLR347W-AYLR347W-A NUP157P40064 1391 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
YLR347W-AYLR347W-A GND1P38720 489 aaKnown RBP3.88□□□□□ -1.79
YLR347W-AYLR347W-A YIR016WP40572 265 aa3.88□□□□□ -1.79
YLR347W-AYLR347W-A DPB11P47027 764 aaPredicted RBP3.88□□□□□ -1.79
YLR347W-AYLR347W-A BSC5P53755 489 aa3.88□□□□□ -1.79
YLR347W-AYLR347W-A YPL068CQ02749 293 aa3.88□□□□□ -1.79
YLR347W-AYLR347W-A SVL3Q03088 825 aaKnown RBP3.88□□□□□ -1.79
YLR347W-AYLR347W-A POS5Q06892 414 aa3.88□□□□□ -1.79
YLR347W-AYLR347W-A RIX7Q07844 837 aaKnown RBP3.88□□□□□ -1.79
YLR347W-AYLR347W-A GSH2Q08220 491 aa3.88□□□□□ -1.79
YLR347W-AYLR347W-A ATG9Q12142 997 aa3.88□□□□□ -1.79
YLR347W-AYLR347W-A GDB1Q06625 1536 aa3.87□□□□□ -1.79
YLR347W-AYLR347W-A CLB2P24869 491 aa3.87□□□□□ -1.79
YLR347W-AYLR347W-A YNG2P38806 282 aaKnown RBP3.87□□□□□ -1.79
YLR347W-AYLR347W-A SMC3P47037 1230 aa3.87□□□□□ -1.79
YLR347W-AYLR347W-A LYS20P48570 428 aaKnown RBP3.87□□□□□ -1.79
YLR347W-AYLR347W-A YTP1P53584 459 aa3.87□□□□□ -1.79
YLR347W-AYLR347W-A ENT4Q07872 247 aa3.87□□□□□ -1.79
YLR347W-AYLR347W-A YLR112WQ12130 139 aa3.87□□□□□ -1.79
YLR347W-AYLR347W-A PUF2Q12221 1075 aaKnown RBP RIP-Chip data3.87□□□□□ -1.79not detected
YLR347W-AYLR347W-A UBX3Q12229 455 aa3.87□□□□□ -1.79
YLR347W-AYLR347W-A SKM1Q12469 655 aa3.87□□□□□ -1.79
YLR347W-AYLR347W-A DOP1Q03921 1698 aa3.87□□□□□ -1.79
YLR347W-AYLR347W-A NUP170P38181 1502 aa3.86□□□□□ -1.79
YLR347W-AYLR347W-A TOP1P04786 769 aa3.86□□□□□ -1.79
YLR347W-AYLR347W-A CDC24P11433 854 aaPredicted RBP3.86□□□□□ -1.79
YLR347W-AYLR347W-A PDB1P32473 366 aaKnown RBP3.86□□□□□ -1.79
YLR347W-AYLR347W-A UIP3P39547 235 aa3.86□□□□□ -1.79
YLR347W-AYLR347W-A IRC8P47046 822 aa3.86□□□□□ -1.79
YLR347W-AYLR347W-A NNF2P53253 936 aa3.86□□□□□ -1.79
YLR347W-AYLR347W-A YMR178WQ03219 274 aaKnown RBP3.86□□□□□ -1.79
YLR347W-AYLR347W-A PSR1Q07800 427 aa3.86□□□□□ -1.79
YLR347W-AYLR347W-A YOL159CQ08300 171 aa3.86□□□□□ -1.79
YLR347W-AYLR347W-A INP53Q12271 1107 aa3.86□□□□□ -1.79
YLR347W-AYLR347W-A DRS2P39524 1355 aa3.86□□□□□ -1.79
YLR347W-AYLR347W-A MMS1Q06211 1407 aa3.86□□□□□ -1.79
YLR347W-AYLR347W-A PDR12Q02785 1511 aa3.85□□□□□ -1.79
YLR347W-AYLR347W-A PDR10P51533 1564 aa3.85□□□□□ -1.79
YLR347W-AYLR347W-A RPL42AP0CX27 106 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
YLR347W-AYLR347W-A RPL42BP0CX28 106 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
YLR347W-AYLR347W-A KRS1P15180 591 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
YLR347W-AYLR347W-A ATO2P32907 282 aa3.85□□□□□ -1.79
YLR347W-AYLR347W-A SNU114P36048 1008 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
YLR347W-AYLR347W-A RFC1P38630 861 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
YLR347W-AYLR347W-A LEU5P38702 357 aa3.85□□□□□ -1.79
YLR347W-AYLR347W-A DIA4P38705 446 aaPredicted RBP3.85□□□□□ -1.79
YLR347W-AYLR347W-A YIL152WP40455 235 aa3.85□□□□□ -1.79
YLR347W-AYLR347W-A BOP3P53958 396 aa3.85□□□□□ -1.79
YLR347W-AYLR347W-A YSA1Q01976 231 aa3.85□□□□□ -1.79
YLR347W-AYLR347W-A MAK10Q02197 733 aa3.85□□□□□ -1.79
YLR347W-AYLR347W-A IZH1Q03419 316 aa3.85□□□□□ -1.79
YLR347W-AYLR347W-A RAD30Q04049 632 aa3.85□□□□□ -1.79
YLR347W-AYLR347W-A YKU80Q04437 629 aa3.85□□□□□ -1.79
YLR347W-AYLR347W-A ARP10Q04549 284 aa3.85□□□□□ -1.79
YLR347W-AYLR347W-A ECI1Q05871 280 aa3.85□□□□□ -1.79
YLR347W-AYLR347W-A UTP21Q06078 939 aaPredicted RBP3.85□□□□□ -1.79
YLR347W-AYLR347W-A MCP2Q06567 569 aa3.85□□□□□ -1.79
YLR347W-AYLR347W-A VIP1Q06685 1146 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
YLR347W-AYLR347W-A MLH2Q07980 695 aa3.85□□□□□ -1.79
YLR347W-AYLR347W-A CIR2Q08822 631 aa3.85□□□□□ -1.79
YLR347W-AYLR347W-A CDC16P09798 840 aa3.84□□□□□ -1.79
YLR347W-AYLR347W-A RPL19AP0CX82 189 aaKnown RBP3.84□□□□□ -1.79
YLR347W-AYLR347W-A RPL19BP0CX83 189 aaPredicted RBP3.84□□□□□ -1.79
YLR347W-AYLR347W-A PWP1P21304 576 aaKnown RBP3.84□□□□□ -1.79
YLR347W-AYLR347W-A PRE8P23639 250 aa3.84□□□□□ -1.79
YLR347W-AYLR347W-A CHS3P29465 1165 aa3.84□□□□□ -1.79
YLR347W-AYLR347W-A YKL050CP35736 922 aa3.84□□□□□ -1.79
YLR347W-AYLR347W-A MUD2P36084 527 aaKnown RBP3.84□□□□□ -1.79
YLR347W-AYLR347W-A SGF73P53165 657 aa3.84□□□□□ -1.79
YLR347W-AYLR347W-A ARP9Q05123 467 aa3.84□□□□□ -1.79
YLR347W-AYLR347W-A DSE3Q08729 430 aa3.84□□□□□ -1.79
YLR347W-AYLR347W-A NKP1Q12493 238 aa3.84□□□□□ -1.79
YLR347W-AYLR347W-A YOR111WQ99210 232 aa3.84□□□□□ -1.79
YLR347W-AYLR347W-A SPE2P21182 396 aa3.83□□□□□ -1.8
YLR347W-AYLR347W-A MIA40P36046 403 aa3.83□□□□□ -1.8
YLR347W-AYLR347W-A MNN2P38069 597 aa3.83□□□□□ -1.8
YLR347W-AYLR347W-A RTS1P38903 757 aa3.83□□□□□ -1.8
YLR347W-AYLR347W-A YEL068CP39977 110 aa3.83□□□□□ -1.8
YLR347W-AYLR347W-A PCL6P40038 420 aa3.83□□□□□ -1.8
YLR347W-AYLR347W-A BUR6P40096 142 aa3.83□□□□□ -1.8
YLR347W-AYLR347W-A VRG4P40107 337 aa3.83□□□□□ -1.8
YLR347W-AYLR347W-A HXT9P40885 567 aa3.83□□□□□ -1.8
YLR347W-AYLR347W-A LYS14P40971 790 aa3.83□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 209.9 ms