RNA–Protein interactions for RNA: YHL038C

CBP2, Required for splicing of the group I intron bI5 of the COB pre-mRNA, yeast

Gene CBP2, Length 1,893 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CBP2	YHL038C	HSP104	P31539	908 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
CBP2	YHL038C	DBF4	P32325	704 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CBP2	YHL038C	VMA8	P32610	256 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
CBP2	YHL038C	NPL6	P32832	435 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CBP2	YHL038C	SOF1	P33750	489 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
CBP2	YHL038C	PEX5	P35056	612 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CBP2	YHL038C	MTH1	P35198	433 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CBP2	YHL038C	KES1	P35844	434 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
CBP2	YHL038C	LHS1	P36016	881 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CBP2	YHL038C	MRPL10	P36520	322 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CBP2	YHL038C	YMC2	P38087	329 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CBP2	YHL038C	MUM2	P38236	366 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CBP2	YHL038C	VBA2	P38358	474 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
CBP2	YHL038C	OPT1	P40897	799 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CBP2	YHL038C	YRB1	P41920	201 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
CBP2	YHL038C	MSY1	P48527	492 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CBP2	YHL038C	LCL3	P53153	274 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CBP2	YHL038C	ADE16	P54113	591 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
CBP2	YHL038C	BUD22	Q04347	519 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
CBP2	YHL038C	ARG7	Q04728	441 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CBP2	YHL038C	ULS1	Q08562	1619 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CBP2	YHL038C	CET1	O13297	549 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
CBP2	YHL038C	LCB1	P25045	558 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
CBP2	YHL038C	HEL1	P36113	551 aa		3.14	□□□□□ -1.91
CBP2	YHL038C	NTR2	P36118	322 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
CBP2	YHL038C	MIT1	P40002	666 aa		3.14	□□□□□ -1.91
CBP2	YHL038C	MRX1	P40050	688 aa		3.14	□□□□□ -1.91
CBP2	YHL038C	BUR6	P40096	142 aa		3.14	□□□□□ -1.91
CBP2	YHL038C	RGI2	P40188	164 aa		3.14	□□□□□ -1.91
CBP2	YHL038C	CCT7	P42943	550 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
CBP2	YHL038C	ASN1	P49089	572 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
CBP2	YHL038C	YGL036W	P53185	909 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
CBP2	YHL038C	YGR066C	P53242	292 aa		3.14	□□□□□ -1.91
CBP2	YHL038C	HST1	P53685	503 aa		3.14	□□□□□ -1.91
CBP2	YHL038C	YNR061C	P53747	219 aa		3.14	□□□□□ -1.91
CBP2	YHL038C	JJJ1	P53863	590 aa		3.14	□□□□□ -1.91
CBP2	YHL038C	YMR155W	Q03795	547 aa		3.14	□□□□□ -1.91
CBP2	YHL038C	VPS20	Q04272	221 aa		3.14	□□□□□ -1.91
CBP2	YHL038C	GRC3	Q07845	632 aa		3.14	□□□□□ -1.91
CBP2	YHL038C	TAF3	Q12297	353 aa		3.14	□□□□□ -1.91
CBP2	YHL038C	RTC1	Q08281	1341 aa		3.14	□□□□□ -1.91
CBP2	YHL038C	HXK2	P04807	486 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
CBP2	YHL038C	HOM3	P10869	527 aa		3.13	□□□□□ -1.91
CBP2	YHL038C	MRPS28	P21771	286 aa		3.13	□□□□□ -1.91
CBP2	YHL038C	RRP43	P25359	394 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
CBP2	YHL038C	YIH1	P25637	258 aa		3.13	□□□□□ -1.91
CBP2	YHL038C	CDC60	P26637	1090 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
CBP2	YHL038C	ORC2	P32833	620 aa		3.13	□□□□□ -1.91
CBP2	YHL038C	SRO77	P38163	1010 aa		3.13	□□□□□ -1.91
CBP2	YHL038C	SRP72	P38688	640 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
CBP2	YHL038C	ASG1	P40467	964 aa		3.13	□□□□□ -1.91
CBP2	YHL038C	DOT5	P40553	215 aa		3.13	□□□□□ -1.91
CBP2	YHL038C	YGL117W	P53133	265 aa		3.13	□□□□□ -1.91
CBP2	YHL038C	RRB1	Q04225	511 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
CBP2	YHL038C	RAD33	Q04231	177 aa		3.13	□□□□□ -1.91
CBP2	YHL038C	KRE28	Q04431	385 aa		3.13	□□□□□ -1.91
CBP2	YHL038C	CMS1	Q07897	291 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
CBP2	YHL038C	GPN2	Q08726	347 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
CBP2	YHL038C	GET3	Q12154	354 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
CBP2	YHL038C	RTN2	Q12443	393 aa		3.13	□□□□□ -1.91
CBP2	YHL038C	YJR112W-A	Q3E743	109 aa		3.13	□□□□□ -1.91
CBP2	YHL038C	YMR084W	A2P2R3	262 aa		3.13	□□□□□ -1.91
CBP2	YHL038C	SES1	P07284	462 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
CBP2	YHL038C	PWP1	P21304	576 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
CBP2	YHL038C	RPL5	P26321	297 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
CBP2	YHL038C	PDB1	P32473	366 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
CBP2	YHL038C	SEC66	P33754	206 aa		3.13	□□□□□ -1.91
CBP2	YHL038C	UBP11	P36026	717 aa		3.13	□□□□□ -1.91
CBP2	YHL038C	AAP1	P37898	856 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
CBP2	YHL038C	MUP3	P38734	546 aa		3.13	□□□□□ -1.91
CBP2	YHL038C	YNG2	P38806	282 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
CBP2	YHL038C	SEC31	P38968	1273 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
CBP2	YHL038C	SDS3	P40505	327 aa		3.13	□□□□□ -1.91
CBP2	YHL038C	SWP82	P43554	623 aa		3.13	□□□□□ -1.91
CBP2	YHL038C	YFL015C	P43578	164 aa		3.13	□□□□□ -1.91
CBP2	YHL038C	RPS7B	P48164	190 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
CBP2	YHL038C	STR3	P53101	465 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
CBP2	YHL038C	IST1	P53843	298 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
CBP2	YHL038C	INA17	Q02888	182 aa		3.13	□□□□□ -1.91
CBP2	YHL038C	RSM28	Q03430	361 aa		3.13	□□□□□ -1.91
CBP2	YHL038C	RCF1	Q03713	159 aa		3.13	□□□□□ -1.91
CBP2	YHL038C	INP2	Q03824	705 aa		3.13	□□□□□ -1.91
CBP2	YHL038C	ATG26	Q06321	1198 aa		3.13	□□□□□ -1.91
CBP2	YHL038C	YLR352W	Q06479	807 aa		3.13	□□□□□ -1.91
CBP2	YHL038C	YEH1	Q07804	573 aa		3.13	□□□□□ -1.91
CBP2	YHL038C	PCL8	Q08966	492 aa		3.13	□□□□□ -1.91
CBP2	YHL038C	RIM20	Q12033	661 aa		3.13	□□□□□ -1.91
CBP2	YHL038C	GLE1	Q12315	538 aa		3.13	□□□□□ -1.91
CBP2	YHL038C	SNU66	Q12420	587 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
CBP2	YHL038C	SMC6	Q12749	1114 aa		3.13	□□□□□ -1.91
CBP2	YHL038C	PDR18	P53756	1333 aa		3.13	□□□□□ -1.91
CBP2	YHL038C	HAP1	P0CE41	1502 aa		3.13	□□□□□ -1.91
CBP2	YHL038C	CDC25	P04821	1589 aa		3.13	□□□□□ -1.91
CBP2	YHL038C	RPL7A	P05737	244 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
CBP2	YHL038C	KRS1	P15180	591 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
CBP2	YHL038C	PDX1	P16451	410 aa		3.12	□□□□□ -1.91
CBP2	YHL038C	YSP3	P25036	478 aa		3.12	□□□□□ -1.91
CBP2	YHL038C	ERG3	P32353	365 aa		3.12	□□□□□ -1.91
CBP2	YHL038C	KAR9	P32526	644 aa		3.12	□□□□□ -1.91
CBP2	YHL038C	SKI2	P35207	1287 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.12	□□□□□ -1.91	not detected

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 18.2 ms