RNA–Protein interactions for RNA: YFR049W

YMR31, Transcript of Mitochondrial ribosomal protein of the small subunit, yeast

Gene YMR31, Length 372 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YMR31	YFR049W	SEC3	P33332	1336 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	RTC1	Q08281	1341 aa		2.73	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	CYB2	P00175	591 aa		2.73	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	TPK2	P06245	380 aa		2.73	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	PET111	P08468	800 aa		2.73	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	MRP13	P12686	339 aa		2.73	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	PCT1	P13259	424 aa		2.73	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	KGD1	P20967	1014 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	IMG1	P25626	169 aa		2.73	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	PTC6	P25646	442 aa		2.73	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	CTS1	P29029	562 aa		2.73	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	MGM1	P32266	881 aa		2.73	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	WBP1	P33767	430 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	TIF3	P34167	436 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	YMC2	P38087	329 aa		2.73	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	ICS2	P38284	255 aa		2.73	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	DIA4	P38705	446 aa	Predicted RBP	2.73	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	POP2	P39008	433 aa		2.73	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	YIL166C	P40445	542 aa		2.73	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	DLD2	P46681	530 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	CUL3	P53202	744 aa		2.73	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	YGR127W	P53275	312 aa		2.73	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	KIN4	Q01919	800 aa		2.73	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	ARX1	Q03862	593 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	HBT1	Q07653	1046 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	YPL272C	Q08984	517 aa		2.73	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	SMF3	Q12078	473 aa	Predicted RBP	2.73	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	LEU9	Q12166	604 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	GPM3	Q12326	303 aa		2.73	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	CTF3	Q12748	733 aa		2.73	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	Q0010	Q9ZZX9	128 aa		2.73	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	STF1	P01098	86 aa		2.72	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	ART10	P18634	518 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	CDC43	P18898	376 aa		2.72	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	KIN3	P22209	435 aa		2.72	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	RRP7	P25368	297 aa	Predicted RBP	2.72	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	URA7	P28274	579 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	PMI40	P29952	429 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	GSH1	P32477	678 aa		2.72	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	MRE11	P32829	692 aa		2.72	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	HCS1	P34243	683 aa		2.72	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	ELO1	P39540	310 aa		2.72	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	UIP3	P39547	235 aa		2.72	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	MIT1	P40002	666 aa		2.72	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	EFM4	P40516	257 aa		2.72	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	CCT7	P42943	550 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	BUD27	P43573	796 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.72	□□□□□ -1.97	not detected
YMR31	YFR049W	FAR3	P46671	204 aa		2.72	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	ASN1	P49089	572 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	HOS2	P53096	452 aa	Predicted RBP	2.72	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	VPS73	P53142	486 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	CAF130	P53280	1122 aa	Predicted RBP	2.72	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	CPR8	P53728	308 aa		2.72	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	BOP3	P53958	396 aa		2.72	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	EFM6	P53970	246 aa		2.72	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	RPA49	Q01080	415 aa	Predicted RBP	2.72	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	PFA5	Q03289	374 aa		2.72	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	RQC1	Q05468	723 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	HRD3	Q05787	833 aa		2.72	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	VTA1	Q06263	330 aa		2.72	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	TEN1	Q07921	160 aa		2.72	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	PGC1	Q08959	321 aa		2.72	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	LEA1	Q08963	238 aa	Predicted RBP	2.72	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	APL4	Q12028	832 aa		2.72	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	SPE3	Q12074	293 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	YLR049C	Q12110	428 aa		2.72	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	ACF2	Q12168	779 aa		2.72	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	NFI1	Q12216	726 aa		2.72	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	FRE6	Q12473	712 aa		2.72	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	SEC39	Q12745	709 aa		2.72	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	RPL7A	P05737	244 aa	Known RBP	2.71	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	MRP2	P10663	115 aa	Predicted RBP	2.71	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	SRV2	P17555	526 aa	Known RBP	2.71	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	TRX1	P22217	103 aa	Known RBP	2.71	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	CPR2	P23285	205 aa		2.71	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	PPH22	P23595	377 aa		2.71	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	BOS1	P25385	244 aa		2.71	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	KRR1	P25586	316 aa	Predicted RBP	2.71	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	RPN2	P32565	945 aa	Known RBP	2.71	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	UGP1	P32861	499 aa	Known RBP	2.71	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	TRM2	P33753	639 aa		2.71	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	SNU114	P36048	1008 aa	Known RBP	2.71	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	PKP1	P40530	394 aa		2.71	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	OPT1	P40897	799 aa		2.71	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	CAK1	P43568	368 aa	Predicted RBP	2.71	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	YJL043W	P47053	257 aa		2.71	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	TCB2	P48231	1178 aa		2.71	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	STB4	P50104	949 aa		2.71	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	YGL117W	P53133	265 aa		2.71	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	TIM44	Q01852	431 aa		2.71	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	KAP120	Q02932	1032 aa		2.71	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	PDS5	Q04264	1277 aa		2.71	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	EMI2	Q04409	500 aa	Known RBP	2.71	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	ECM30	Q06673	1274 aa		2.71	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	CYK3	Q07533	885 aa		2.71	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	YOL159C	Q08300	171 aa		2.71	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	VPS54	Q12071	889 aa		2.71	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	ATG9	Q12142	997 aa		2.71	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	RPL7B	Q12213	244 aa	Known RBP	2.71	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	BI2	P03873	423 aa		2.7	□□□□□ -1.98

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