RNA–Protein interactions for RNA: Q0140

VAR1, Transcript of Mitochondrial ribosomal protein of the small subunit, yeast

Gene VAR1, Length 1,197 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VAR1	Q0140	PDH1	Q12428	516 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
VAR1	Q0140	SRB5	P32585	307 aa		3.17	□□□□□ -1.9
VAR1	Q0140	PTR2	P32901	601 aa		3.17	□□□□□ -1.9
VAR1	Q0140	YNK1	P36010	153 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
VAR1	Q0140	SMC3	P47037	1230 aa		3.17	□□□□□ -1.9
VAR1	Q0140	ASE1	P50275	885 aa		3.17	□□□□□ -1.9
VAR1	Q0140	YOL057W	Q08225	711 aa		3.17	□□□□□ -1.9
VAR1	Q0140	TFC3	P34111	1160 aa		3.16	□□□□□ -1.9
VAR1	Q0140	PKP1	P40530	394 aa		3.16	□□□□□ -1.9
VAR1	Q0140	FAF1	P40546	346 aa	Predicted RBP	3.16	□□□□□ -1.9
VAR1	Q0140	CSL4	P53859	292 aa	Predicted RBP	3.16	□□□□□ -1.9
VAR1	Q0140	AYT1	Q12226	474 aa		3.16	□□□□□ -1.9
VAR1	Q0140	SEC62	P21825	274 aa		3.15	□□□□□ -1.91
VAR1	Q0140	CLB4	P24871	460 aa		3.15	□□□□□ -1.91
VAR1	Q0140	CMK1	P27466	446 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
VAR1	Q0140	SNC1	P31109	117 aa		3.15	□□□□□ -1.91
VAR1	Q0140	VPS17	P32913	551 aa		3.15	□□□□□ -1.91
VAR1	Q0140	SIP2	P34164	415 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
VAR1	Q0140	SRO77	P38163	1010 aa		3.15	□□□□□ -1.91
VAR1	Q0140	MTC4	P38335	694 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
VAR1	Q0140	UBA4	P38820	440 aa		3.15	□□□□□ -1.91
VAR1	Q0140	SMK1	P41808	388 aa		3.15	□□□□□ -1.91
VAR1	Q0140	SAM50	P53969	484 aa		3.15	□□□□□ -1.91
VAR1	Q0140	PAL1	Q05518	499 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
VAR1	Q0140	HEL2	Q05580	639 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
VAR1	Q0140	HXK2	P04807	486 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
VAR1	Q0140	ECM15	P35195	104 aa		3.14	□□□□□ -1.91
VAR1	Q0140	PUG1	P40100	303 aa		3.14	□□□□□ -1.91
VAR1	Q0140	SIM1	P40472	476 aa		3.14	□□□□□ -1.91
VAR1	Q0140	HIM1	Q06674	414 aa		3.14	□□□□□ -1.91
VAR1	Q0140	THI20	Q08224	551 aa		3.14	□□□□□ -1.91
VAR1	Q0140	APL4	Q12028	832 aa		3.14	□□□□□ -1.91
VAR1	Q0140	MPD2	Q99316	277 aa		3.14	□□□□□ -1.91
VAR1	Q0140	RPL20A	P0CX23	172 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
VAR1	Q0140	RPL20B	P0CX24	172 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
VAR1	Q0140	SNF3	P10870	884 aa		3.13	□□□□□ -1.91
VAR1	Q0140	PMR1	P13586	950 aa		3.13	□□□□□ -1.91
VAR1	Q0140	SSK1	Q07084	712 aa		3.13	□□□□□ -1.91
VAR1	Q0140	TMA16	Q08687	178 aa		3.13	□□□□□ -1.91
VAR1	Q0140	YCL021W-A	Q96VH3	125 aa		3.13	□□□□□ -1.91
VAR1	Q0140	HEM2	P05373	342 aa		3.12	□□□□□ -1.91
VAR1	Q0140	NCP1	P16603	691 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
VAR1	Q0140	PGS1	P25578	521 aa		3.12	□□□□□ -1.91
VAR1	Q0140	YKL133C	P36066	463 aa		3.12	□□□□□ -1.91
VAR1	Q0140	YMR087W	Q04299	284 aa		3.12	□□□□□ -1.91
VAR1	Q0140	ATG9	Q12142	997 aa		3.12	□□□□□ -1.91
VAR1	Q0140	TY2A-LR1	P0C2J4	438 aa		3.11	□□□□□ -1.91
VAR1	Q0140	TY2A-F	P0CX61	438 aa		3.11	□□□□□ -1.91
VAR1	Q0140	TY2A-GR2	P0CX62	438 aa		3.11	□□□□□ -1.91
VAR1	Q0140	LCB1	P25045	558 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
VAR1	Q0140	TY2A-C	P25383	438 aa		3.11	□□□□□ -1.91
VAR1	Q0140	CDC15	P27636	974 aa		3.11	□□□□□ -1.91
VAR1	Q0140	SAC6	P32599	642 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
VAR1	Q0140	VPS27	P40343	622 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
VAR1	Q0140	DPB11	P47027	764 aa	Predicted RBP	3.11	□□□□□ -1.91
VAR1	Q0140	SDT1	P53078	280 aa		3.11	□□□□□ -1.91
VAR1	Q0140	TY2A-DR2	Q03483	438 aa		3.11	□□□□□ -1.91
VAR1	Q0140	DIC1	Q06143	298 aa		3.11	□□□□□ -1.91
VAR1	Q0140	TY2A-B	Q12260	438 aa		3.11	□□□□□ -1.91
VAR1	Q0140	TY2A-OR2	Q12293	438 aa		3.11	□□□□□ -1.91
VAR1	Q0140	TY2A-DR1	Q12392	438 aa		3.11	□□□□□ -1.91
VAR1	Q0140	TY2A-OR1	Q12439	438 aa		3.11	□□□□□ -1.91
VAR1	Q0140	TY2A-DR3	Q99303	438 aa		3.11	□□□□□ -1.91
VAR1	Q0140	MSS18	P08593	268 aa		3.1	□□□□□ -1.91
VAR1	Q0140	MSN2	P33748	704 aa		3.1	□□□□□ -1.91
VAR1	Q0140	YKL050C	P35736	922 aa		3.1	□□□□□ -1.91
VAR1	Q0140	STR3	P53101	465 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
VAR1	Q0140	TAN1	P53072	289 aa	Predicted RBP	3.09	□□□□□ -1.91
VAR1	Q0140	COG1	P53079	417 aa		3.09	□□□□□ -1.91
VAR1	Q0140	YGL039W	P53183	348 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
VAR1	Q0140	HNT3	Q08702	217 aa		3.09	□□□□□ -1.91
VAR1	Q0140	COX17	Q12287	69 aa		3.09	□□□□□ -1.91
VAR1	Q0140	RER1	P25560	188 aa		3.08	□□□□□ -1.92
VAR1	Q0140	TUL1	P36096	758 aa		3.08	□□□□□ -1.92
VAR1	Q0140	NPR3	P38742	1146 aa		3.08	□□□□□ -1.92
VAR1	Q0140	ANS1	P38832	159 aa		3.08	□□□□□ -1.92
VAR1	Q0140	HIS6	P40545	261 aa		3.08	□□□□□ -1.92
VAR1	Q0140	BTN2	P53286	410 aa		3.08	□□□□□ -1.92
VAR1	Q0140	MLC2	Q06580	163 aa		3.08	□□□□□ -1.92
VAR1	Q0140	TMC1	Q08422	150 aa	Predicted RBP	3.08	□□□□□ -1.92
VAR1	Q0140	ERG27	Q12452	347 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
VAR1	Q0140	SOD1	P00445	154 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
VAR1	Q0140	ATR1	P13090	542 aa		3.07	□□□□□ -1.92
VAR1	Q0140	SPE2	P21182	396 aa		3.07	□□□□□ -1.92
VAR1	Q0140	PMU1	P36069	295 aa		3.07	□□□□□ -1.92
VAR1	Q0140	MRPL36	P36531	177 aa		3.07	□□□□□ -1.92
VAR1	Q0140	ROT2	P38138	954 aa		3.07	□□□□□ -1.92
VAR1	Q0140	LAG1	P38703	411 aa		3.07	□□□□□ -1.92
VAR1	Q0140	NPR2	P39923	615 aa		3.07	□□□□□ -1.92
VAR1	Q0140	MSO1	P53604	210 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
VAR1	Q0140	YMR160W	Q03823	816 aa		3.07	□□□□□ -1.92
VAR1	Q0140	INP53	Q12271	1107 aa		3.07	□□□□□ -1.92
VAR1	Q0140	NAT1	P12945	854 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
VAR1	Q0140	SNU114	P36048	1008 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
VAR1	Q0140	PFK26	P40433	827 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
VAR1	Q0140	ZDS2	P54786	942 aa		3.06	□□□□□ -1.92
VAR1	Q0140	MHR1	Q06630	226 aa		3.06	□□□□□ -1.92
VAR1	Q0140	RRP12	Q12754	1228 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
VAR1	Q0140	YER078W-A	Q3E7A2	54 aa		3.06	□□□□□ -1.92
VAR1	Q0140	TPK1	P06244	397 aa		3.05	□□□□□ -1.92

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