RNA–Protein interactions for RNA: YOL108C

INO4, Transcript of Transcription factor involved in phospholipid synthesis, yeast

Gene INO4, Length 456 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
INO4	YOL108C	CIR1	P42940	261 aa		3.39	□□□□□ -1.87
INO4	YOL108C	RMD8	P43620	662 aa		3.39	□□□□□ -1.87
INO4	YOL108C	SAE2	P46946	345 aa		3.39	□□□□□ -1.87
INO4	YOL108C	SGM1	P47166	707 aa		3.39	□□□□□ -1.87
INO4	YOL108C	MRK1	P50873	501 aa		3.39	□□□□□ -1.87
INO4	YOL108C	VPS75	P53853	264 aa		3.39	□□□□□ -1.87
INO4	YOL108C	MDG1	P53885	366 aa		3.39	□□□□□ -1.87
INO4	YOL108C	AAT1	Q01802	451 aa		3.39	□□□□□ -1.87
INO4	YOL108C	INA17	Q02888	182 aa		3.39	□□□□□ -1.87
INO4	YOL108C	ARP9	Q05123	467 aa		3.39	□□□□□ -1.87
INO4	YOL108C	TCO89	Q08921	799 aa		3.39	□□□□□ -1.87
INO4	YOL108C	LEA1	Q08963	238 aa	Predicted RBP	3.39	□□□□□ -1.87
INO4	YOL108C	LYS21	Q12122	440 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
INO4	YOL108C	SPE4	Q12455	300 aa		3.39	□□□□□ -1.87
INO4	YOL108C	NOP58	Q12499	511 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
INO4	YOL108C	VTH1	P40438	1549 aa		3.39	□□□□□ -1.87
INO4	YOL108C	VTH2	P40890	1549 aa		3.39	□□□□□ -1.87
INO4	YOL108C	GCN4	P03069	281 aa		3.38	□□□□□ -1.87
INO4	YOL108C	ARG3	P05150	338 aa		3.38	□□□□□ -1.87
INO4	YOL108C	HEM1	P09950	548 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
INO4	YOL108C	POL4	P25615	582 aa		3.38	□□□□□ -1.87
INO4	YOL108C	RPC34	P32910	317 aa		3.38	□□□□□ -1.87
INO4	YOL108C	UBP13	P38187	747 aa		3.38	□□□□□ -1.87
INO4	YOL108C	PAC2	P39937	518 aa		3.38	□□□□□ -1.87
INO4	YOL108C	TPA1	P40032	644 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
INO4	YOL108C	YJL043W	P47053	257 aa		3.38	□□□□□ -1.87
INO4	YOL108C	LCL3	P53153	274 aa		3.38	□□□□□ -1.87
INO4	YOL108C	RPT6	Q01939	405 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
INO4	YOL108C	RSM28	Q03430	361 aa		3.38	□□□□□ -1.87
INO4	YOL108C	TAF11	Q04226	346 aa		3.38	□□□□□ -1.87
INO4	YOL108C	UTP21	Q06078	939 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
INO4	YOL108C	CTI6	Q08923	506 aa		3.38	□□□□□ -1.87
INO4	YOL108C	RCN2	Q12044	265 aa		3.38	□□□□□ -1.87
INO4	YOL108C	HSH49	Q99181	213 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
INO4	YOL108C	MYO4	P32492	1471 aa		3.37	□□□□□ -1.87
INO4	YOL108C	MAK32	P23060	363 aa		3.37	□□□□□ -1.87
INO4	YOL108C	PGS1	P25578	521 aa		3.37	□□□□□ -1.87
INO4	YOL108C	TOA1	P32773	286 aa		3.37	□□□□□ -1.87
INO4	YOL108C	SOF1	P33750	489 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
INO4	YOL108C	YNG2	P38806	282 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
INO4	YOL108C	RGI2	P40188	164 aa		3.37	□□□□□ -1.87
INO4	YOL108C	SPO22	P40511	975 aa		3.37	□□□□□ -1.87
INO4	YOL108C	QRI1	P43123	477 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
INO4	YOL108C	VTC2	P43585	828 aa		3.37	□□□□□ -1.87
INO4	YOL108C	GLO1	P50107	326 aa		3.37	□□□□□ -1.87
INO4	YOL108C	YPR003C	P53394	754 aa		3.37	□□□□□ -1.87
INO4	YOL108C	APM1	Q00776	475 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
INO4	YOL108C	SPC19	Q03954	165 aa		3.37	□□□□□ -1.87
INO4	YOL108C	YLR287C	Q05881	355 aa		3.37	□□□□□ -1.87
INO4	YOL108C	PSR1	Q07800	427 aa		3.37	□□□□□ -1.87
INO4	YOL108C	YPL272C	Q08984	517 aa		3.37	□□□□□ -1.87
INO4	YOL108C	ERP4	Q12450	207 aa		3.37	□□□□□ -1.87
INO4	YOL108C	STH1	P32597	1359 aa		3.37	□□□□□ -1.87
INO4	YOL108C	VPS15	P22219	1454 aa		3.36	□□□□□ -1.87
INO4	YOL108C	GEA2	P39993	1459 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
INO4	YOL108C	MET17	P06106	444 aa		3.36	□□□□□ -1.87
INO4	YOL108C	CBS1	P14066	229 aa		3.36	□□□□□ -1.87
INO4	YOL108C	CKA1	P15790	372 aa		3.36	□□□□□ -1.87
INO4	YOL108C	PWP1	P21304	576 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
INO4	YOL108C	SPO11	P23179	398 aa		3.36	□□□□□ -1.87
INO4	YOL108C	ADY2	P25613	283 aa		3.36	□□□□□ -1.87
INO4	YOL108C	GSY2	P27472	705 aa		3.36	□□□□□ -1.87
INO4	YOL108C	PEP3	P27801	918 aa		3.36	□□□□□ -1.87
INO4	YOL108C	PDB1	P32473	366 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
INO4	YOL108C	NFU1	P32860	256 aa		3.36	□□□□□ -1.87
INO4	YOL108C	LHS1	P36016	881 aa		3.36	□□□□□ -1.87
INO4	YOL108C	ADE17	P38009	592 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
INO4	YOL108C	IMD2	P38697	523 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
INO4	YOL108C	ERV46	P39727	415 aa		3.36	□□□□□ -1.87
INO4	YOL108C	ECM10	P39987	644 aa		3.36	□□□□□ -1.87
INO4	YOL108C	MRX1	P40050	688 aa		3.36	□□□□□ -1.87
INO4	YOL108C	BUR6	P40096	142 aa		3.36	□□□□□ -1.87
INO4	YOL108C	ASG1	P40467	964 aa		3.36	□□□□□ -1.87
INO4	YOL108C	ARF3	P40994	183 aa	RIP-Chip data	3.36	□□□□□ -1.87	not detected
INO4	YOL108C	RPN11	P43588	306 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
INO4	YOL108C	STU2	P46675	888 aa		3.36	□□□□□ -1.87
INO4	YOL108C	IMD3	P50095	523 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
INO4	YOL108C	YPL071C	Q02864	156 aa		3.36	□□□□□ -1.87
INO4	YOL108C	FMP30	Q02883	468 aa		3.36	□□□□□ -1.87
INO4	YOL108C	YML122C	Q03207	126 aa		3.36	□□□□□ -1.87
INO4	YOL108C	YOR389W	Q08912	624 aa		3.36	□□□□□ -1.87
INO4	YOL108C	SCM3	Q12334	223 aa		3.36	□□□□□ -1.87
INO4	YOL108C	SNQ2	P32568	1501 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
INO4	YOL108C	PET111	P08468	800 aa		3.35	□□□□□ -1.87
INO4	YOL108C	NPL6	P32832	435 aa		3.35	□□□□□ -1.87
INO4	YOL108C	MNN2	P38069	597 aa		3.35	□□□□□ -1.87
INO4	YOL108C	AGP2	P38090	596 aa		3.35	□□□□□ -1.87
INO4	YOL108C	SRO77	P38163	1010 aa		3.35	□□□□□ -1.87
INO4	YOL108C	RPS7B	P48164	190 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
INO4	YOL108C	YNL058C	P53947	316 aa		3.35	□□□□□ -1.87
INO4	YOL108C	YML037C	Q03703	340 aa		3.35	□□□□□ -1.87
INO4	YOL108C	SYF1	Q04048	859 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
INO4	YOL108C	SPN1	Q06505	410 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
INO4	YOL108C	THI3	Q07471	609 aa		3.35	□□□□□ -1.87
INO4	YOL108C	YEH1	Q07804	573 aa		3.35	□□□□□ -1.87
INO4	YOL108C	ATG9	Q12142	997 aa		3.35	□□□□□ -1.87
INO4	YOL108C	RRG1	Q12167	365 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
INO4	YOL108C	PGA3	Q12746	312 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
INO4	YOL108C	YPT6	Q99260	215 aa		3.35	□□□□□ -1.87
INO4	YOL108C	DRS2	P39524	1355 aa		3.35	□□□□□ -1.87

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 27.7 ms