RNA–Protein interactions for RNA: YOL008W

COQ10, Transcript of Coenzyme Q (ubiquinone) binding protein, yeast

Gene COQ10, Length 624 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
COQ10	YOL008W	TFC6	Q06339	672 aa		2.75	□□□□□ -1.97
COQ10	YOL008W	CDC45	Q08032	650 aa		2.75	□□□□□ -1.97
COQ10	YOL008W	NGL1	Q08213	363 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
COQ10	YOL008W	SGT2	Q12118	346 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
COQ10	YOL008W	RTN2	Q12443	393 aa		2.75	□□□□□ -1.97
COQ10	YOL008W	SKM1	Q12469	655 aa		2.75	□□□□□ -1.97
COQ10	YOL008W	NOP58	Q12499	511 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
COQ10	YOL008W	VAS1	P07806	1104 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
COQ10	YOL008W	MIS1	P09440	975 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
COQ10	YOL008W	PCK1	P10963	549 aa		2.74	□□□□□ -1.97
COQ10	YOL008W	POL3	P15436	1097 aa		2.74	□□□□□ -1.97
COQ10	YOL008W	ROX1	P25042	368 aa		2.74	□□□□□ -1.97
COQ10	YOL008W	MF(ALPHA)2	P32435	120 aa		2.74	□□□□□ -1.97
COQ10	YOL008W	CDC5	P32562	705 aa		2.74	□□□□□ -1.97
COQ10	YOL008W	GDA1	P32621	518 aa		2.74	□□□□□ -1.97
COQ10	YOL008W	YBR138C	P38277	524 aa		2.74	□□□□□ -1.97
COQ10	YOL008W	SDS24	P38314	527 aa		2.74	□□□□□ -1.97
COQ10	YOL008W	RFC1	P38630	861 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
COQ10	YOL008W	STT3	P39007	718 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
COQ10	YOL008W	MET30	P39014	640 aa		2.74	□□□□□ -1.97
COQ10	YOL008W	GDI1	P39958	451 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
COQ10	YOL008W	YJL055W	P47044	245 aa		2.74	□□□□□ -1.97
COQ10	YOL008W	MDE1	P47095	244 aa		2.74	□□□□□ -1.97
COQ10	YOL008W	DUO1	P53168	247 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
COQ10	YOL008W	VPS9	P54787	451 aa		2.74	□□□□□ -1.97
COQ10	YOL008W	VTC3	Q02725	835 aa		2.74	□□□□□ -1.97
COQ10	YOL008W	PRP42	Q03776	544 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
COQ10	YOL008W	AIM32	Q04689	311 aa		2.74	□□□□□ -1.97
COQ10	YOL008W	YMR034C	Q05131	434 aa	Predicted RBP	2.74	□□□□□ -1.97
COQ10	YOL008W	YOR389W	Q08912	624 aa		2.74	□□□□□ -1.97
COQ10	YOL008W	REX3	Q12090	404 aa		2.74	□□□□□ -1.97
COQ10	YOL008W	NFI1	Q12216	726 aa		2.74	□□□□□ -1.97
COQ10	YOL008W	SEC53	P07283	254 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
COQ10	YOL008W	SEC12	P11655	471 aa		2.73	□□□□□ -1.97
COQ10	YOL008W	RMA1	P36001	430 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
COQ10	YOL008W	DED81	P38707	554 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
COQ10	YOL008W	RTT105	P40063	208 aa		2.73	□□□□□ -1.97
COQ10	YOL008W	PCL7	P40186	285 aa		2.73	□□□□□ -1.97
COQ10	YOL008W	YIL169C	P40442	995 aa		2.73	□□□□□ -1.97
COQ10	YOL008W	DJP1	P40564	432 aa		2.73	□□□□□ -1.97
COQ10	YOL008W	IRC5	P43610	853 aa		2.73	□□□□□ -1.97
COQ10	YOL008W	FYV8	P46949	817 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
COQ10	YOL008W	SGF73	P53165	657 aa		2.73	□□□□□ -1.97
COQ10	YOL008W	ART5	P53244	586 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
COQ10	YOL008W	NNF2	P53253	936 aa		2.73	□□□□□ -1.97
COQ10	YOL008W	OGG1	P53397	376 aa	Predicted RBP	2.73	□□□□□ -1.97
COQ10	YOL008W	HST1	P53685	503 aa		2.73	□□□□□ -1.97
COQ10	YOL008W	SQS1	P53866	767 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
COQ10	YOL008W	YNL092W	P53934	400 aa		2.73	□□□□□ -1.97
COQ10	YOL008W	LAP3	Q01532	483 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.73	□□□□□ -1.97	not detected
COQ10	YOL008W	ADA2	Q02336	434 aa		2.73	□□□□□ -1.97
COQ10	YOL008W	YDR131C	Q03899	556 aa		2.73	□□□□□ -1.97
COQ10	YOL008W	YLR345W	Q06137	509 aa		2.73	□□□□□ -1.97
COQ10	YOL008W	IWR1	Q07532	353 aa	Predicted RBP	2.73	□□□□□ -1.97
COQ10	YOL008W	MLH2	Q07980	695 aa		2.73	□□□□□ -1.97
COQ10	YOL008W	APL5	Q08951	932 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
COQ10	YOL008W	HUA2	Q12134	243 aa		2.73	□□□□□ -1.97
COQ10	YOL008W	PDH1	Q12428	516 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
COQ10	YOL008W	TPK1	P06244	397 aa		2.72	□□□□□ -1.97
COQ10	YOL008W	CDC26	P14724	124 aa		2.72	□□□□□ -1.97
COQ10	YOL008W	REC107	P21651	314 aa		2.72	□□□□□ -1.97
COQ10	YOL008W	SIR1	P21691	654 aa		2.72	□□□□□ -1.97
COQ10	YOL008W	RIT1	P23796	513 aa		2.72	□□□□□ -1.97
COQ10	YOL008W	LCB1	P25045	558 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
COQ10	YOL008W	SWI4	P25302	1093 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
COQ10	YOL008W	OCA4	P25366	362 aa		2.72	□□□□□ -1.97
COQ10	YOL008W	DGR2	P32330	852 aa		2.72	□□□□□ -1.97
COQ10	YOL008W	PUP2	P32379	260 aa		2.72	□□□□□ -1.97
COQ10	YOL008W	SMI1	P32566	505 aa		2.72	□□□□□ -1.97
COQ10	YOL008W	IME2	P32581	645 aa		2.72	□□□□□ -1.97
COQ10	YOL008W	RIB7	P33312	244 aa		2.72	□□□□□ -1.97
COQ10	YOL008W	FMP46	P36141	133 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
COQ10	YOL008W	APE3	P37302	537 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
COQ10	YOL008W	SSP120	P39931	234 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
COQ10	YOL008W	VRG4	P40107	337 aa		2.72	□□□□□ -1.97
COQ10	YOL008W	YJR061W	P40355	935 aa		2.72	□□□□□ -1.97
COQ10	YOL008W	SPO22	P40511	975 aa		2.72	□□□□□ -1.97
COQ10	YOL008W	PSP1	P50896	841 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
COQ10	YOL008W	PIL1	P53252	339 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
COQ10	YOL008W	VPS75	P53853	264 aa		2.72	□□□□□ -1.97
COQ10	YOL008W	HOT1	Q03213	719 aa		2.72	□□□□□ -1.97
COQ10	YOL008W	GYL1	Q04322	720 aa		2.72	□□□□□ -1.97
COQ10	YOL008W	YMR317W	Q04893	1140 aa		2.72	□□□□□ -1.97
COQ10	YOL008W	ARP9	Q05123	467 aa		2.72	□□□□□ -1.97
COQ10	YOL008W	SWA2	Q06677	668 aa		2.72	□□□□□ -1.97
COQ10	YOL008W	APL4	Q12028	832 aa		2.72	□□□□□ -1.97
COQ10	YOL008W	RTK1	Q12100	620 aa	Predicted RBP	2.72	□□□□□ -1.97
COQ10	YOL008W	GET3	Q12154	354 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
COQ10	YOL008W	NBP2	Q12163	236 aa		2.72	□□□□□ -1.97
COQ10	YOL008W	FRE6	Q12473	712 aa		2.72	□□□□□ -1.97
COQ10	YOL008W	PCD1	Q12524	340 aa		2.72	□□□□□ -1.97
COQ10	YOL008W	YBR126W-A	Q8TGU7	68 aa		2.72	□□□□□ -1.97
COQ10	YOL008W	CHD1	P32657	1468 aa		2.71	□□□□□ -1.97
COQ10	YOL008W	SAC3	P46674	1301 aa		2.71	□□□□□ -1.98
COQ10	YOL008W	YLR302C	O13544	120 aa		2.71	□□□□□ -1.98
COQ10	YOL008W	CDC24	P11433	854 aa	Predicted RBP	2.71	□□□□□ -1.98
COQ10	YOL008W	STE50	P25344	346 aa		2.71	□□□□□ -1.98
COQ10	YOL008W	PEP3	P27801	918 aa		2.71	□□□□□ -1.98
COQ10	YOL008W	YOX1	P34161	385 aa		2.71	□□□□□ -1.98
COQ10	YOL008W	ESL2	P36168	1195 aa		2.71	□□□□□ -1.98

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