RNA–Protein interactions for RNA: YMR053C

STB2, Transcript of Protein that interacts with Sin3p in a two-hybrid assay, yeast

Gene STB2, Length 2,553 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
STB2	YMR053C	CMS1	Q07897	291 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
STB2	YMR053C	YBR182C-A	Q8TGU6	64 aa		4.57	□□□□□ -1.68
STB2	YMR053C	YLR302C	O13544	120 aa		4.57	□□□□□ -1.68
STB2	YMR053C	RAS1	P01119	309 aa		4.57	□□□□□ -1.68
STB2	YMR053C	SSA3	P09435	649 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
STB2	YMR053C	TY1A-LR4	P0C2I8	440 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
STB2	YMR053C	TY1A-DR6	P0CX70	440 aa		4.57	□□□□□ -1.68
STB2	YMR053C	TY1A-ER1	P0CX71	440 aa		4.57	□□□□□ -1.68
STB2	YMR053C	TY1A-LR2	P0CX72	440 aa		4.57	□□□□□ -1.68
STB2	YMR053C	TY1A-PL	P0CX73	440 aa		4.57	□□□□□ -1.68
STB2	YMR053C	TY1A-JR1	P0CX74	440 aa		4.57	□□□□□ -1.68
STB2	YMR053C	TY1A-LR3	P0CX75	440 aa		4.57	□□□□□ -1.68
STB2	YMR053C	TY1A-ML2	P0CX76	440 aa		4.57	□□□□□ -1.68
STB2	YMR053C	PCK1	P10963	549 aa		4.57	□□□□□ -1.68
STB2	YMR053C	RVS161	P25343	265 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
STB2	YMR053C	ZIP1	P31111	875 aa		4.57	□□□□□ -1.68
STB2	YMR053C	YPT52	P36018	234 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
STB2	YMR053C	ATG14	P38270	344 aa		4.57	□□□□□ -1.68
STB2	YMR053C	CBR1	P38626	284 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
STB2	YMR053C	NEM1	P38757	446 aa		4.57	□□□□□ -1.68
STB2	YMR053C	MPT5	P39016	859 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.57	□□□□□ -1.68	not detected
STB2	YMR053C	GPB2	P39717	880 aa		4.57	□□□□□ -1.68
STB2	YMR053C	GTO1	P48239	356 aa		4.57	□□□□□ -1.68
STB2	YMR053C	KAP120	Q02932	1032 aa		4.57	□□□□□ -1.68
STB2	YMR053C	VPS38	Q05919	439 aa		4.57	□□□□□ -1.68
STB2	YMR053C	THI22	Q06490	572 aa		4.57	□□□□□ -1.68
STB2	YMR053C	AAD4	Q07747	329 aa		4.57	□□□□□ -1.68
STB2	YMR053C	YOR059C	Q08448	450 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
STB2	YMR053C	TY1A-GR1	Q12085	440 aa		4.57	□□□□□ -1.68
STB2	YMR053C	TY1A-PR3	Q6Q5H1	440 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
STB2	YMR053C	TY1A-OL	Q92392	440 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
STB2	YMR053C	SGS1	P35187	1447 aa		4.56	□□□□□ -1.68
STB2	YMR053C	GEX1	P25596	615 aa		4.56	□□□□□ -1.68
STB2	YMR053C	MCM4	P30665	933 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
STB2	YMR053C	ARP2	P32381	391 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
STB2	YMR053C	GEX2	P36173	615 aa		4.56	□□□□□ -1.68
STB2	YMR053C	TSL1	P38427	1098 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
STB2	YMR053C	SSZ1	P38788	538 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
STB2	YMR053C	RTC3	P38804	111 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
STB2	YMR053C	SEC31	P38968	1273 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
STB2	YMR053C	NET1	P47035	1189 aa		4.56	□□□□□ -1.68
STB2	YMR053C	AAD10	P47182	288 aa		4.56	□□□□□ -1.68
STB2	YMR053C	CLA4	P48562	842 aa		4.56	□□□□□ -1.68
STB2	YMR053C	NGL2	Q03264	515 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
STB2	YMR053C	RKM2	Q03942	479 aa		4.56	□□□□□ -1.68
STB2	YMR053C	PPN1	Q04119	674 aa		4.56	□□□□□ -1.68
STB2	YMR053C	SPC2	Q04969	178 aa		4.56	□□□□□ -1.68
STB2	YMR053C	RQC1	Q05468	723 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
STB2	YMR053C	NDL1	Q06568	189 aa		4.56	□□□□□ -1.68
STB2	YMR053C	GRS2	Q06817	618 aa		4.56	□□□□□ -1.68
STB2	YMR053C	DFR1	P07807	211 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.56	□□□□□ -1.68	not detected
STB2	YMR053C	UBA1	P22515	1024 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
STB2	YMR053C	PET18	P25362	215 aa		4.56	□□□□□ -1.68
STB2	YMR053C	YCL068C	P25593	260 aa		4.56	□□□□□ -1.68
STB2	YMR053C	BMH1	P29311	267 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
STB2	YMR053C	SYN8	P31377	255 aa		4.56	□□□□□ -1.68
STB2	YMR053C	UBC6	P33296	250 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
STB2	YMR053C	YBL055C	P34220	418 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
STB2	YMR053C	KAP104	P38217	918 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
STB2	YMR053C	MLH1	P38920	769 aa		4.56	□□□□□ -1.68
STB2	YMR053C	AFG3	P39925	761 aa		4.56	□□□□□ -1.68
STB2	YMR053C	YIR042C	P40586	236 aa		4.56	□□□□□ -1.68
STB2	YMR053C	GLG2	P47011	380 aa		4.56	□□□□□ -1.68
STB2	YMR053C	MPS3	P47069	682 aa		4.56	□□□□□ -1.68
STB2	YMR053C	EMC2	P47133	292 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
STB2	YMR053C	PRM1	P53835	661 aa		4.56	□□□□□ -1.68
STB2	YMR053C	SPO19	Q03029	223 aa		4.56	□□□□□ -1.68
STB2	YMR053C	HED1	Q03937	162 aa		4.56	□□□□□ -1.68
STB2	YMR053C	PDR8	Q06149	701 aa		4.56	□□□□□ -1.68
STB2	YMR053C	SEC10	Q06245	871 aa		4.56	□□□□□ -1.68
STB2	YMR053C	RSB1	Q08417	382 aa		4.56	□□□□□ -1.68
STB2	YMR053C	GET4	Q12125	312 aa		4.56	□□□□□ -1.68
STB2	YMR053C	SFG1	Q12507	346 aa		4.56	□□□□□ -1.68
STB2	YMR053C	YJR112W-A	Q3E743	109 aa		4.56	□□□□□ -1.68
STB2	YMR053C	YOS9	Q99220	542 aa		4.56	□□□□□ -1.68
STB2	YMR053C	RPL11A	P0C0W9	174 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
STB2	YMR053C	TCP1	P12612	559 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
STB2	YMR053C	YKL151C	P36059	337 aa		4.55	□□□□□ -1.68
STB2	YMR053C	MRPL10	P36520	322 aa		4.55	□□□□□ -1.68
STB2	YMR053C	AKL1	P38080	1108 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
STB2	YMR053C	YBR139W	P38109	508 aa		4.55	□□□□□ -1.68
STB2	YMR053C	SIC1	P38634	284 aa		4.55	□□□□□ -1.68
STB2	YMR053C	YER158C	P40095	573 aa		4.55	□□□□□ -1.68
STB2	YMR053C	FET4	P40988	552 aa		4.55	□□□□□ -1.68
STB2	YMR053C	COG1	P53079	417 aa		4.55	□□□□□ -1.68
STB2	YMR053C	MND1	P53102	219 aa		4.55	□□□□□ -1.68
STB2	YMR053C	RRP46	P53256	223 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
STB2	YMR053C	CSL4	P53859	292 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
STB2	YMR053C	ARP4	P80428	489 aa		4.55	□□□□□ -1.68
STB2	YMR053C	RPN9	Q04062	393 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
STB2	YMR053C	URH1	Q04179	340 aa		4.55	□□□□□ -1.68
STB2	YMR053C	CRF1	Q04930	467 aa		4.55	□□□□□ -1.68
STB2	YMR053C	GPB1	Q08886	897 aa		4.55	□□□□□ -1.68
STB2	YMR053C	YOL107W	Q12239	342 aa		4.55	□□□□□ -1.68
STB2	YMR053C	SPE4	Q12455	300 aa		4.55	□□□□□ -1.68
STB2	YMR053C	RPL11B	Q3E757	174 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
STB2	YMR053C	YPR089W	O13585	888 aa		4.55	□□□□□ -1.68
STB2	YMR053C	RPS31	P05759	152 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
STB2	YMR053C	MRPL4	P36517	319 aa		4.55	□□□□□ -1.68
STB2	YMR053C	YBL086C	P38177	466 aa		4.55	□□□□□ -1.68

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