RNA–Protein interactions for RNA: YGR030C

POP6, Transcript of Subunit of both RNase MRP and nuclear RNase P, yeast

Gene POP6, Length 477 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
POP6	YGR030C	PSR1	Q07800	427 aa		4.67	□□□□□ -1.66
POP6	YGR030C	YPR089W	O13585	888 aa		4.66	□□□□□ -1.66
POP6	YGR030C	PAH1	P32567	862 aa		4.66	□□□□□ -1.66
POP6	YGR030C	SWE1	P32944	819 aa		4.66	□□□□□ -1.66
POP6	YGR030C	VPS41	P38959	992 aa		4.66	□□□□□ -1.66
POP6	YGR030C	PKP1	P40530	394 aa		4.66	□□□□□ -1.66
POP6	YGR030C	EAF7	P53911	425 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
POP6	YGR030C	INA17	Q02888	182 aa		4.66	□□□□□ -1.66
POP6	YGR030C	YAP7	Q08182	245 aa		4.66	□□□□□ -1.66
POP6	YGR030C	HUA2	Q12134	243 aa		4.66	□□□□□ -1.66
POP6	YGR030C	HER1	Q12276	1246 aa		4.66	□□□□□ -1.66
POP6	YGR030C	YER190C-B	P0CX94	160 aa		4.65	□□□□□ -1.67
POP6	YGR030C	YEL077W-A	P0CX95	160 aa		4.65	□□□□□ -1.67
POP6	YGR030C	YGR296C-B	P0CX96	160 aa		4.65	□□□□□ -1.67
POP6	YGR030C	YPL283W-B	P0CX97	160 aa		4.65	□□□□□ -1.67
POP6	YGR030C	YPR204C-A	P0CX98	160 aa		4.65	□□□□□ -1.67
POP6	YGR030C	SPE2	P21182	396 aa		4.65	□□□□□ -1.67
POP6	YGR030C	SAN1	P22470	610 aa		4.65	□□□□□ -1.67
POP6	YGR030C	STE50	P25344	346 aa		4.65	□□□□□ -1.67
POP6	YGR030C	MAL33	P38157	468 aa		4.65	□□□□□ -1.67
POP6	YGR030C	VRG4	P40107	337 aa		4.65	□□□□□ -1.67
POP6	YGR030C	SMC3	P47037	1230 aa		4.65	□□□□□ -1.67
POP6	YGR030C	MRPL1	Q04599	285 aa		4.65	□□□□□ -1.67
POP6	YGR030C	INP53	Q12271	1107 aa		4.65	□□□□□ -1.67
POP6	YGR030C	ICT1	Q12385	394 aa		4.65	□□□□□ -1.67
POP6	YGR030C	YBR126W-A	Q8TGU7	68 aa		4.65	□□□□□ -1.67
POP6	YGR030C	RPL19A	P0CX82	189 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
POP6	YGR030C	RPL19B	P0CX83	189 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
POP6	YGR030C	AAC3	P18238	307 aa		4.64	□□□□□ -1.67
POP6	YGR030C	VMA16	P23968	213 aa		4.64	□□□□□ -1.67
POP6	YGR030C	PDB1	P32473	366 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
POP6	YGR030C	YKL050C	P35736	922 aa		4.64	□□□□□ -1.67
POP6	YGR030C	AGP2	P38090	596 aa		4.64	□□□□□ -1.67
POP6	YGR030C	YNG2	P38806	282 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
POP6	YGR030C	NAB3	P38996	802 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.64	□□□□□ -1.67	not detected
POP6	YGR030C	UIP3	P39547	235 aa		4.64	□□□□□ -1.67
POP6	YGR030C	NOP16	P40007	231 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
POP6	YGR030C	RPS7B	P48164	190 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
POP6	YGR030C	YTP1	P53584	459 aa		4.64	□□□□□ -1.67
POP6	YGR030C	ASI1	P54074	624 aa		4.64	□□□□□ -1.67
POP6	YGR030C	APL4	Q12028	832 aa		4.64	□□□□□ -1.67
POP6	YGR030C	ATX2	Q12067	313 aa		4.64	□□□□□ -1.67
POP6	YGR030C	YCK1	P23291	538 aa		4.63	□□□□□ -1.67
POP6	YGR030C	LCB1	P25045	558 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
POP6	YGR030C	DIA4	P38705	446 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
POP6	YGR030C	SPC97	P38863	823 aa		4.63	□□□□□ -1.67
POP6	YGR030C	PCI8	P40512	444 aa		4.63	□□□□□ -1.67
POP6	YGR030C	YIR016W	P40572	265 aa		4.63	□□□□□ -1.67
POP6	YGR030C	GLO1	P50107	326 aa		4.63	□□□□□ -1.67
POP6	YGR030C	DUO1	P53168	247 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
POP6	YGR030C	RPL15B	P54780	204 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
POP6	YGR030C	ZDS2	P54786	942 aa		4.63	□□□□□ -1.67
POP6	YGR030C	YMR178W	Q03219	274 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
POP6	YGR030C	TMA64	Q04600	565 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
POP6	YGR030C	POS5	Q06892	414 aa		4.63	□□□□□ -1.67
POP6	YGR030C	YOL159C	Q08300	171 aa		4.63	□□□□□ -1.67
POP6	YGR030C	ATG9	Q12142	997 aa		4.63	□□□□□ -1.67
POP6	YGR030C	SEM1	O94742	89 aa		4.62	□□□□□ -1.67
POP6	YGR030C	KRS1	P15180	591 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
POP6	YGR030C	PWP1	P21304	576 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
POP6	YGR030C	AIM17	P23180	465 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
POP6	YGR030C	MGM1	P32266	881 aa		4.62	□□□□□ -1.67
POP6	YGR030C	AUR1	P36107	401 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
POP6	YGR030C	RFC1	P38630	861 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
POP6	YGR030C	DIA3	P52290	468 aa		4.62	□□□□□ -1.67
POP6	YGR030C	VPS72	Q03388	795 aa		4.62	□□□□□ -1.67
POP6	YGR030C	YKU80	Q04437	629 aa		4.62	□□□□□ -1.67
POP6	YGR030C	MCP2	Q06567	569 aa		4.62	□□□□□ -1.67
POP6	YGR030C	GSH2	Q08220	491 aa		4.62	□□□□□ -1.67
POP6	YGR030C	YLR112W	Q12130	139 aa		4.62	□□□□□ -1.67
POP6	YGR030C	RGT2	Q12300	763 aa		4.62	□□□□□ -1.67
POP6	YGR030C	CLB2	P24869	491 aa		4.61	□□□□□ -1.67
POP6	YGR030C	SNU114	P36048	1008 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
POP6	YGR030C	STV1	P37296	890 aa		4.61	□□□□□ -1.67
POP6	YGR030C	AFG3	P39925	761 aa		4.61	□□□□□ -1.67
POP6	YGR030C	GAT1	P43574	510 aa		4.61	□□□□□ -1.67
POP6	YGR030C	MDV1	P47025	714 aa		4.61	□□□□□ -1.67
POP6	YGR030C	UPF3	P48412	387 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
POP6	YGR030C	LYS4	P49367	693 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
POP6	YGR030C	SCW4	P53334	386 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
POP6	YGR030C	CAC2	Q04199	468 aa		4.61	□□□□□ -1.67
POP6	YGR030C	PUF2	Q12221	1075 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.61	□□□□□ -1.67	not detected
POP6	YGR030C	SEC53	P07283	254 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
POP6	YGR030C	RPB8	P20436	146 aa		4.6	□□□□□ -1.67
POP6	YGR030C	ADH7	P25377	361 aa		4.6	□□□□□ -1.67
POP6	YGR030C	POL4	P25615	582 aa		4.6	□□□□□ -1.67
POP6	YGR030C	SAC6	P32599	642 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
POP6	YGR030C	ASK1	P35734	292 aa		4.6	□□□□□ -1.67
POP6	YGR030C	STR3	P53101	465 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
POP6	YGR030C	SGF73	P53165	657 aa		4.6	□□□□□ -1.67
POP6	YGR030C	SEC5	P89102	971 aa		4.6	□□□□□ -1.67
POP6	YGR030C	BUD22	Q04347	519 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
POP6	YGR030C	ARP10	Q04549	284 aa		4.6	□□□□□ -1.67
POP6	YGR030C	UTP21	Q06078	939 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
POP6	YGR030C	GEP3	Q08622	556 aa		4.6	□□□□□ -1.67
POP6	YGR030C	NOP58	Q12499	511 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
POP6	YGR030C	MNN2	P38069	597 aa		4.59	□□□□□ -1.67
POP6	YGR030C	LCL3	P53153	274 aa		4.59	□□□□□ -1.67
POP6	YGR030C	YNL234W	P53857	426 aa		4.59	□□□□□ -1.67
POP6	YGR030C	IZH1	Q03419	316 aa		4.59	□□□□□ -1.67

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