RNA–Protein interactions for RNA: YOR032C

HMS1, Transcript of bHLH protein with similarity to myc-family transcription factors, yeast

Gene HMS1, Length 1,305 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
HMS1	YOR032C	SOF1	P33750	489 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
HMS1	YOR032C	LHS1	P36016	881 aa		4.67	□□□□□ -1.66
HMS1	YOR032C	NTR2	P36118	322 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
HMS1	YOR032C	RIX7	Q07844	837 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
HMS1	YOR032C	YOR389W	Q08912	624 aa		4.67	□□□□□ -1.66
HMS1	YOR032C	TAH18	Q12181	623 aa		4.67	□□□□□ -1.66
HMS1	YOR032C	NOP58	Q12499	511 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
HMS1	YOR032C	RTC1	Q08281	1341 aa		4.67	□□□□□ -1.66
HMS1	YOR032C	CET1	O13297	549 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
HMS1	YOR032C	SUI3	P09064	285 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
HMS1	YOR032C	PCT1	P13259	424 aa		4.66	□□□□□ -1.66
HMS1	YOR032C	MET8	P15807	274 aa		4.66	□□□□□ -1.66
HMS1	YOR032C	SRP54	P20424	541 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
HMS1	YOR032C	OLE1	P21147	510 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
HMS1	YOR032C	SGF29	P25554	259 aa		4.66	□□□□□ -1.66
HMS1	YOR032C	ADY2	P25613	283 aa		4.66	□□□□□ -1.66
HMS1	YOR032C	APD1	P38281	316 aa		4.66	□□□□□ -1.66
HMS1	YOR032C	JHD1	P40034	492 aa		4.66	□□□□□ -1.66
HMS1	YOR032C	SEC24	P40482	926 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
HMS1	YOR032C	SWP82	P43554	623 aa		4.66	□□□□□ -1.66
HMS1	YOR032C	SAE2	P46946	345 aa		4.66	□□□□□ -1.66
HMS1	YOR032C	BNR1	P40450	1375 aa		4.65	□□□□□ -1.67
HMS1	YOR032C	GCN4	P03069	281 aa		4.65	□□□□□ -1.67
HMS1	YOR032C	ILV6	P25605	309 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
HMS1	YOR032C	MAL33	P38157	468 aa		4.65	□□□□□ -1.67
HMS1	YOR032C	YBR225W	P38321	900 aa		4.65	□□□□□ -1.67
HMS1	YOR032C	FLC2	P39719	783 aa		4.65	□□□□□ -1.67
HMS1	YOR032C	INA17	Q02888	182 aa		4.65	□□□□□ -1.67
HMS1	YOR032C	RSM28	Q03430	361 aa		4.65	□□□□□ -1.67
HMS1	YOR032C	TDA9	Q04545	1251 aa		4.65	□□□□□ -1.67
HMS1	YOR032C	ARP9	Q05123	467 aa		4.65	□□□□□ -1.67
HMS1	YOR032C	RAD34	Q06665	692 aa		4.65	□□□□□ -1.67
HMS1	YOR032C	GPN2	Q08726	347 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
HMS1	YOR032C	NMD4	Q12129	218 aa		4.65	□□□□□ -1.67
HMS1	YOR032C	RDL1	Q12305	139 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
HMS1	YOR032C	GSY2	P27472	705 aa		4.64	□□□□□ -1.67
HMS1	YOR032C	GSH1	P32477	678 aa		4.64	□□□□□ -1.67
HMS1	YOR032C	PPZ2	P33329	710 aa		4.64	□□□□□ -1.67
HMS1	YOR032C	MPE1	P35728	441 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
HMS1	YOR032C	AUR1	P36107	401 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
HMS1	YOR032C	AGP2	P38090	596 aa		4.64	□□□□□ -1.67
HMS1	YOR032C	YNG2	P38806	282 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
HMS1	YOR032C	RPN11	P43588	306 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
HMS1	YOR032C	YGL036W	P53185	909 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
HMS1	YOR032C	IST1	P53843	298 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
HMS1	YOR032C	PSR1	Q07800	427 aa		4.64	□□□□□ -1.67
HMS1	YOR032C	RCN2	Q12044	265 aa		4.64	□□□□□ -1.67
HMS1	YOR032C	HXK2	P04807	486 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
HMS1	YOR032C	PEP3	P27801	918 aa		4.63	□□□□□ -1.67
HMS1	YOR032C	PDB1	P32473	366 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
HMS1	YOR032C	ADE17	P38009	592 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
HMS1	YOR032C	ARF3	P40994	183 aa	RIP-Chip data	4.63	□□□□□ -1.67	not detected
HMS1	YOR032C	SPC19	Q03954	165 aa		4.63	□□□□□ -1.67
HMS1	YOR032C	ARO10	Q06408	635 aa		4.63	□□□□□ -1.67
HMS1	YOR032C	SPN1	Q06505	410 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
HMS1	YOR032C	THI3	Q07471	609 aa		4.63	□□□□□ -1.67
HMS1	YOR032C	CTI6	Q08923	506 aa		4.63	□□□□□ -1.67
HMS1	YOR032C	MRP2	P10663	115 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
HMS1	YOR032C	MAK32	P23060	363 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HMS1	YOR032C	UBP13	P38187	747 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HMS1	YOR032C	FTH1	P38310	465 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HMS1	YOR032C	ECM10	P39987	644 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HMS1	YOR032C	BUR6	P40096	142 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HMS1	YOR032C	IRC6	P43615	237 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HMS1	YOR032C	DSD1	P53095	428 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HMS1	YOR032C	ARE2	P53629	642 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
HMS1	YOR032C	MRPL19	P53875	158 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HMS1	YOR032C	RPT6	Q01939	405 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
HMS1	YOR032C	NGL3	Q03210	505 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HMS1	YOR032C	MFB1	Q04922	465 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HMS1	YOR032C	TUB1	P09733	447 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
HMS1	YOR032C	KAR3	P17119	729 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HMS1	YOR032C	VMA16	P23968	213 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HMS1	YOR032C	PGS1	P25578	521 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HMS1	YOR032C	POL4	P25615	582 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HMS1	YOR032C	MSS51	P32335	436 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HMS1	YOR032C	RIX1	P38883	763 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
HMS1	YOR032C	NPR2	P39923	615 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HMS1	YOR032C	TAX4	P47030	604 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HMS1	YOR032C	MRX6	P48564	524 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HMS1	YOR032C	YPR003C	P53394	754 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HMS1	YOR032C	VPS75	P53853	264 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HMS1	YOR032C	TIM10	P87108	93 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HMS1	YOR032C	YPL071C	Q02864	156 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HMS1	YOR032C	BSP1	Q06604	576 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HMS1	YOR032C	NDJ1	Q12366	352 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HMS1	YOR032C	HOT13	P36078	116 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HMS1	YOR032C	FLO10	P36170	1169 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HMS1	YOR032C	IMD2	P38697	523 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
HMS1	YOR032C	DIA4	P38705	446 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
HMS1	YOR032C	CIN1	P40987	1014 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HMS1	YOR032C	RMD8	P43620	662 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HMS1	YOR032C	CTK2	P46962	323 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HMS1	YOR032C	DPB11	P47027	764 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
HMS1	YOR032C	SGM1	P47166	707 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HMS1	YOR032C	LYS4	P49367	693 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
HMS1	YOR032C	IMD3	P50095	523 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
HMS1	YOR032C	GLO1	P50107	326 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HMS1	YOR032C	ORC5	P50874	479 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HMS1	YOR032C	BUD22	Q04347	519 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 20.3 ms