RNA–Protein interactions for RNA: YML067C

ERV41, Transcript of Protein localized to COPII-coated vesicles, yeast

Gene ERV41, Length 1,059 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ERV41	YML067C	CRN1	Q06440	651 aa		4.66	□□□□□ -1.66
ERV41	YML067C	GPN2	Q08726	347 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
ERV41	YML067C	SOF1	P33750	489 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
ERV41	YML067C	NPR3	P38742	1146 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ERV41	YML067C	YNL234W	P53857	426 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ERV41	YML067C	BET4	Q00618	327 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ERV41	YML067C	FMP42	Q04991	504 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ERV41	YML067C	ARP9	Q05123	467 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ERV41	YML067C	YLR281C	Q05863	155 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ERV41	YML067C	UTP21	Q06078	939 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
ERV41	YML067C	SRP54	P20424	541 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
ERV41	YML067C	RGT1	P32862	1170 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ERV41	YML067C	RKM3	P38222	552 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ERV41	YML067C	RPT2	P40327	437 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
ERV41	YML067C	ASE1	P50275	885 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ERV41	YML067C	ESBP6	P53918	673 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ERV41	YML067C	YOL057W	Q08225	711 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ERV41	YML067C	TPK1	P06244	397 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ERV41	YML067C	PET111	P08468	800 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ERV41	YML067C	MSM1	P22438	575 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ERV41	YML067C	TKL1	P23254	680 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
ERV41	YML067C	GEX2	P36173	615 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ERV41	YML067C	RTT107	P38850	1070 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ERV41	YML067C	CCT4	P39078	528 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
ERV41	YML067C	PSP1	P50896	841 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
ERV41	YML067C	YGL260W	P53056	76 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ERV41	YML067C	COG1	P53079	417 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ERV41	YML067C	ASI1	P54074	624 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ERV41	YML067C	MRPL13	Q02204	264 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ERV41	YML067C	MCP2	Q06567	569 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ERV41	YML067C	TMA16	Q08687	178 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ERV41	YML067C	YOR111W	Q99210	232 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ERV41	YML067C	CHO1	P08456	276 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ERV41	YML067C	STE50	P25344	346 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ERV41	YML067C	FCP1	Q03254	732 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ERV41	YML067C	YMR254C	Q04838	102 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ERV41	YML067C	RAP1	P11938	827 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ERV41	YML067C	GUK1	P15454	187 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
ERV41	YML067C	YCL049C	P25577	312 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ERV41	YML067C	NTR2	P36118	322 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
ERV41	YML067C	AAP1	P37898	856 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
ERV41	YML067C	SEC31	P38968	1273 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
ERV41	YML067C	CSL4	P53859	292 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
ERV41	YML067C	YNL181W	P53878	407 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ERV41	YML067C	ARP10	Q04549	284 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ERV41	YML067C	BLS1	Q06071	122 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ERV41	YML067C	TAH18	Q12181	623 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ERV41	YML067C	ERG27	Q12452	347 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
ERV41	YML067C	TY2A-LR1	P0C2J4	438 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ERV41	YML067C	TY2A-F	P0CX61	438 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ERV41	YML067C	TY2A-GR2	P0CX62	438 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ERV41	YML067C	APA1	P16550	321 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
ERV41	YML067C	TY2A-C	P25383	438 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ERV41	YML067C	RAD16	P31244	790 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ERV41	YML067C	TFC3	P34111	1160 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ERV41	YML067C	BZZ1	P38822	633 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ERV41	YML067C	YND1	P40009	630 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ERV41	YML067C	CTK2	P46962	323 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ERV41	YML067C	IML2	P47031	731 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ERV41	YML067C	SGF73	P53165	657 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ERV41	YML067C	RSM28	Q03430	361 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ERV41	YML067C	TY2A-DR2	Q03483	438 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ERV41	YML067C	TY2A-B	Q12260	438 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ERV41	YML067C	TY2A-OR2	Q12293	438 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ERV41	YML067C	TY2A-DR1	Q12392	438 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ERV41	YML067C	TY2A-OR1	Q12439	438 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ERV41	YML067C	PCD1	Q12524	340 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ERV41	YML067C	TY2A-DR3	Q99303	438 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ERV41	YML067C	PPZ1	P26570	692 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ERV41	YML067C	SAC1	P32368	623 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
ERV41	YML067C	PDR3	P33200	976 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ERV41	YML067C	LEU5	P38702	357 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ERV41	YML067C	SWP82	P43554	623 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ERV41	YML067C	ARC35	P53731	342 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
ERV41	YML067C	UBX4	P54730	416 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ERV41	YML067C	APL5	Q08951	932 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
ERV41	YML067C	PFK2	P16862	959 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.58	□□□□□ -1.68	not detected
ERV41	YML067C	CDC15	P27636	974 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ERV41	YML067C	STV1	P37296	890 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ERV41	YML067C	YPK3	P38070	525 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ERV41	YML067C	ECM10	P39987	644 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ERV41	YML067C	IST3	P40565	148 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
ERV41	YML067C	HNM1	P19807	563 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ERV41	YML067C	RPB8	P20436	146 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ERV41	YML067C	UBC1	P21734	215 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
ERV41	YML067C	MGR1	P25573	417 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ERV41	YML067C	SRB5	P32585	307 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ERV41	YML067C	IFA38	P38286	347 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ERV41	YML067C	RFC1	P38630	861 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
ERV41	YML067C	PFK26	P40433	827 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
ERV41	YML067C	SMK1	P41808	388 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ERV41	YML067C	SMA1	Q02651	245 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ERV41	YML067C	CTL1	Q03220	320 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
ERV41	YML067C	YMR317W	Q04893	1140 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ERV41	YML067C	CIA1	Q05583	330 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ERV41	YML067C	PGI1	P12709	554 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ERV41	YML067C	RAD24	P32641	659 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ERV41	YML067C	YDR415C	Q04033	374 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ERV41	YML067C	CSR1	Q06705	408 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ERV41	YML067C	MTF2	P10849	440 aa		4.55	□□□□□ -1.68

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