RNA–Protein interactions for RNA: YGR212W

SLI1, Transcript of N-acetyltransferase, yeast

Gene SLI1, Length 1,407 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SLI1	YGR212W	RER1	P25560	188 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SLI1	YGR212W	RPT3	P33298	428 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
SLI1	YGR212W	MAM1	P40065	302 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SLI1	YGR212W	PSA1	P41940	361 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
SLI1	YGR212W	ADE16	P54113	591 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
SLI1	YGR212W	OPY2	Q06810	360 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SLI1	YGR212W	NEW1	Q08972	1196 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
SLI1	YGR212W	TRM8	Q12009	286 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SLI1	YGR212W	PNO1	Q99216	274 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
SLI1	YGR212W	SIR4	P11978	1358 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SLI1	YGR212W	KGD2	P19262	463 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
SLI1	YGR212W	PDE1	P22434	369 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SLI1	YGR212W	AMD2	P22580	549 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SLI1	YGR212W	MRPL9	P31334	269 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SLI1	YGR212W	NUP120	P35729	1037 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SLI1	YGR212W	TEF4	P36008	412 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
SLI1	YGR212W	MTG2	P38860	518 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SLI1	YGR212W	NAB3	P38996	802 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.17	□□□□□ -1.74	not detected
SLI1	YGR212W	LAS21	P40367	830 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SLI1	YGR212W	EAF6	P47128	113 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SLI1	YGR212W	UBP16	Q02863	499 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SLI1	YGR212W	YML119W	Q03208	357 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SLI1	YGR212W	VPS72	Q03388	795 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SLI1	YGR212W	WAR1	Q03631	944 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SLI1	YGR212W	YMR018W	Q04364	514 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SLI1	YGR212W	ORM2	Q06144	216 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SLI1	YGR212W	VAM6	Q07468	1049 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SLI1	YGR212W	PCD1	Q12524	340 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SLI1	YGR212W	MLP1	Q02455	1875 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
SLI1	YGR212W	RPO41	P13433	1351 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
SLI1	YGR212W	CHO2	P05374	869 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
SLI1	YGR212W	RPL7A	P05737	244 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
SLI1	YGR212W	URK1	P27515	501 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SLI1	YGR212W	GDA1	P32621	518 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SLI1	YGR212W	VPS8	P39702	1274 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SLI1	YGR212W	PSP1	P50896	841 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
SLI1	YGR212W	MTG1	Q03151	367 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
SLI1	YGR212W	ARG7	Q04728	441 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SLI1	YGR212W	YDL242W	Q07746	117 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SLI1	YGR212W	RPL7B	Q12213	244 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
SLI1	YGR212W	RVB2	Q12464	471 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
SLI1	YGR212W	SPT7	P35177	1332 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SLI1	YGR212W	ATP2	P00830	511 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.74
SLI1	YGR212W	GUK1	P15454	187 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.74
SLI1	YGR212W	PMA2	P19657	947 aa		4.15	□□□□□ -1.74
SLI1	YGR212W	MCM10	P32354	571 aa		4.15	□□□□□ -1.74
SLI1	YGR212W	AXL2	P38928	823 aa		4.15	□□□□□ -1.74
SLI1	YGR212W	BUD16	P39988	312 aa		4.15	□□□□□ -1.74
SLI1	YGR212W	YFL015C	P43578	164 aa		4.15	□□□□□ -1.74
SLI1	YGR212W	COG1	P53079	417 aa		4.15	□□□□□ -1.74
SLI1	YGR212W	CSL4	P53859	292 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.74
SLI1	YGR212W	GTB1	Q04924	702 aa		4.15	□□□□□ -1.74
SLI1	YGR212W	PCL8	Q08966	492 aa		4.15	□□□□□ -1.74
SLI1	YGR212W	LCB4	Q12246	624 aa		4.15	□□□□□ -1.74
SLI1	YGR212W	TY2A-LR1	P0C2J4	438 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SLI1	YGR212W	TY2A-F	P0CX61	438 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SLI1	YGR212W	TY2A-GR2	P0CX62	438 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SLI1	YGR212W	TY2A-C	P25383	438 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SLI1	YGR212W	AAD3	P25612	363 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SLI1	YGR212W	SIP1	P32578	815 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SLI1	YGR212W	ECM32	P32644	1121 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
SLI1	YGR212W	CNS1	P33313	385 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SLI1	YGR212W	YER010C	P40011	234 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SLI1	YGR212W	OPT1	P40897	799 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SLI1	YGR212W	IRC8	P47046	822 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SLI1	YGR212W	COG2	P53271	262 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SLI1	YGR212W	MEP3	P53390	489 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SLI1	YGR212W	TY2A-DR2	Q03483	438 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SLI1	YGR212W	RAD33	Q04231	177 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SLI1	YGR212W	YML053C	Q04978	212 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SLI1	YGR212W	STP3	Q05937	343 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SLI1	YGR212W	TY2A-B	Q12260	438 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SLI1	YGR212W	TY2A-OR2	Q12293	438 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SLI1	YGR212W	TY2A-DR1	Q12392	438 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SLI1	YGR212W	TY2A-OR1	Q12439	438 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SLI1	YGR212W	AHA1	Q12449	350 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
SLI1	YGR212W	TY2A-DR3	Q99303	438 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SLI1	YGR212W	AI5_ALPHA	Q9ZZX1	630 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SLI1	YGR212W	YMR084W	A2P2R3	262 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SLI1	YGR212W	RPF2	P36160	344 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
SLI1	YGR212W	YIL161W	P40449	235 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
SLI1	YGR212W	IST3	P40565	148 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
SLI1	YGR212W	YGR079W	P53249	370 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SLI1	YGR212W	ATG23	Q06671	453 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SLI1	YGR212W	BUG1	Q12191	341 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SLI1	YGR212W	Q0010	Q9ZZX9	128 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SLI1	YGR212W	AUS1	Q08409	1394 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SLI1	YGR212W	SPO16	P17122	198 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SLI1	YGR212W	ERC1	P38767	581 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SLI1	YGR212W	FUN12	P39730	1002 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
SLI1	YGR212W	RIC1	P40395	1056 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SLI1	YGR212W	TDA10	P42938	290 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SLI1	YGR212W	ASE1	P50275	885 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SLI1	YGR212W	CBK1	P53894	756 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SLI1	YGR212W	PLM2	Q04383	521 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SLI1	YGR212W	TMA64	Q04600	565 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
SLI1	YGR212W	SWT1	Q12104	458 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SLI1	YGR212W	PRS5	Q12265	496 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
SLI1	YGR212W	COX1	P00401	534 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SLI1	YGR212W	YML003W	P0CF16	290 aa		4.12	□□□□□ -1.75

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 24.3 ms