RNA–Protein interactions for RNA: YGR165W

MRPS35, Transcript of Mitochondrial ribosomal protein of the small subunit, yeast

Gene MRPS35, Length 1,038 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MRPS35	YGR165W	KTR3	P38130	404 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
MRPS35	YGR165W	EXO1	P39875	702 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MRPS35	YGR165W	YJL043W	P47053	257 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MRPS35	YGR165W	UPF3	P48412	387 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
MRPS35	YGR165W	YNR061C	P53747	219 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MRPS35	YGR165W	BSC5	P53755	489 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MRPS35	YGR165W	AAT1	Q01802	451 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MRPS35	YGR165W	ENT4	Q07872	247 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MRPS35	YGR165W	SKM1	Q12469	655 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MRPS35	YGR165W	YOR019W	Q99248	730 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MRPS35	YGR165W	VCX1	Q99385	411 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MRPS35	YGR165W	RTC1	Q08281	1341 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MRPS35	YGR165W	CHC1	P22137	1653 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.66
MRPS35	YGR165W	RPB2	P08518	1224 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
MRPS35	YGR165W	HEM1	P09950	548 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
MRPS35	YGR165W	LAC1	P28496	418 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MRPS35	YGR165W	ALY1	P36117	915 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MRPS35	YGR165W	VBA2	P38358	474 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
MRPS35	YGR165W	YIL166C	P40445	542 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MRPS35	YGR165W	VPS4	P52917	437 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MRPS35	YGR165W	ADE16	P54113	591 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
MRPS35	YGR165W	FMP30	Q02883	468 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MRPS35	YGR165W	ATG23	Q06671	453 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MRPS35	YGR165W	CYK3	Q07533	885 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MRPS35	YGR165W	PSK2	Q08217	1101 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MRPS35	YGR165W	RPN13	O13563	156 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MRPS35	YGR165W	SES1	P07284	462 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
MRPS35	YGR165W	YSP3	P25036	478 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MRPS35	YGR165W	HES1	P35843	434 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MRPS35	YGR165W	NOP16	P40007	231 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
MRPS35	YGR165W	NDE1	P40215	560 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MRPS35	YGR165W	DJP1	P40564	432 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MRPS35	YGR165W	TDA10	P42938	290 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MRPS35	YGR165W	SIP4	P46954	829 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MRPS35	YGR165W	MSY1	P48527	492 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MRPS35	YGR165W	APM1	Q00776	475 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
MRPS35	YGR165W	FCP1	Q03254	732 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MRPS35	YGR165W	RCO1	Q04779	684 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MRPS35	YGR165W	NUS1	Q12063	375 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MRPS35	YGR165W	NBP2	Q12163	236 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MRPS35	YGR165W	PPZ2	P33329	710 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MRPS35	YGR165W	ESL2	P36168	1195 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MRPS35	YGR165W	OPT1	P40897	799 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MRPS35	YGR165W	QRI1	P43123	477 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
MRPS35	YGR165W	YSA1	Q01976	231 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MRPS35	YGR165W	RAD30	Q04049	632 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MRPS35	YGR165W	CRN1	Q06440	651 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MRPS35	YGR165W	SWA2	Q06677	668 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MRPS35	YGR165W	MED1	Q12321	566 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MRPS35	YGR165W	YOR111W	Q99210	232 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MRPS35	YGR165W	YBT1	P32386	1661 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MRPS35	YGR165W	ARO1	P08566	1588 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
MRPS35	YGR165W	YMR084W	A2P2R3	262 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MRPS35	YGR165W	ILV2	P07342	687 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
MRPS35	YGR165W	ADY2	P25613	283 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MRPS35	YGR165W	SRB5	P32585	307 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MRPS35	YGR165W	RPC34	P32910	317 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MRPS35	YGR165W	TFC3	P34111	1160 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MRPS35	YGR165W	PAC2	P39937	518 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MRPS35	YGR165W	IME4	P41833	600 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MRPS35	YGR165W	MRK1	P50873	501 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MRPS35	YGR165W	YOR389W	Q08912	624 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MRPS35	YGR165W	YPL191C	Q08930	360 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MRPS35	YGR165W	TY3B-G	Q99315	1547 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MRPS35	YGR165W	YOR093C	Q12275	1648 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MRPS35	YGR165W	INH1	P01097	85 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MRPS35	YGR165W	CDC24	P11433	854 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
MRPS35	YGR165W	IMP2'	P32351	346 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MRPS35	YGR165W	KES1	P35844	434 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
MRPS35	YGR165W	SWP82	P43554	623 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MRPS35	YGR165W	SAE2	P46946	345 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MRPS35	YGR165W	DUO1	P53168	247 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
MRPS35	YGR165W	PIL1	P53252	339 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
MRPS35	YGR165W	MDM1	Q01846	1127 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MRPS35	YGR165W	YKU80	Q04437	629 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MRPS35	YGR165W	RAD34	Q06665	692 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MRPS35	YGR165W	BAG7	Q12128	409 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MRPS35	YGR165W	BNR1	P40450	1375 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MRPS35	YGR165W	SUI3	P09064	285 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MRPS35	YGR165W	PCT1	P13259	424 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MRPS35	YGR165W	HSC82	P15108	705 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MRPS35	YGR165W	PTC6	P25646	442 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MRPS35	YGR165W	JHD1	P40034	492 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MRPS35	YGR165W	SLZ1	P40167	298 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MRPS35	YGR165W	UBP7	P40453	1071 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MRPS35	YGR165W	SEC24	P40482	926 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MRPS35	YGR165W	ARC1	P46672	376 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MRPS35	YGR165W	TAX4	P47030	604 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MRPS35	YGR165W	INN1	P53901	409 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MRPS35	YGR165W	YAT1	P80235	687 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MRPS35	YGR165W	YBR126W-A	Q8TGU7	68 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MRPS35	YGR165W	SRB8	P25648	1427 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MRPS35	YGR165W	CET1	O13297	549 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MRPS35	YGR165W	SEM1	O94742	89 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MRPS35	YGR165W	RPL19A	P0CX82	189 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MRPS35	YGR165W	RPL19B	P0CX83	189 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MRPS35	YGR165W	MET8	P15807	274 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MRPS35	YGR165W	YCK1	P23291	538 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MRPS35	YGR165W	GSH1	P32477	678 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MRPS35	YGR165W	NTR2	P36118	322 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67

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