RNA–Protein interactions for RNA: YGL154C

LYS5, Transcript of Phosphopantetheinyl transferase involved in lysine biosynthesis, yeast

Gene LYS5, Length 819 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
LYS5	YGL154C	INA22	P40576	216 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LYS5	YGL154C	MIC19	P43594	170 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LYS5	YGL154C	DAS1	P47005	663 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LYS5	YGL154C	YKE2	P52553	114 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LYS5	YGL154C	CUE3	P53137	624 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
LYS5	YGL154C	CIK1	Q01649	594 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LYS5	YGL154C	SEG1	Q04279	960 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LYS5	YGL154C	ATG17	Q06410	417 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LYS5	YGL154C	CUR1	Q06469	252 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LYS5	YGL154C	GPN2	Q08726	347 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
LYS5	YGL154C	APL4	Q12028	832 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LYS5	YGL154C	NDJ1	Q12366	352 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LYS5	YGL154C	WHI5	Q12416	295 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LYS5	YGL154C	YPR089W	O13585	888 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LYS5	YGL154C	TUF1	P02992	437 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
LYS5	YGL154C	PET494	P07390	489 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
LYS5	YGL154C	ASP3-2	P0CX77	362 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LYS5	YGL154C	ASP3-3	P0CX78	362 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LYS5	YGL154C	ASP3-4	P0CX79	362 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LYS5	YGL154C	ASP3-1	P0CZ17	362 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LYS5	YGL154C	SSB1	P11484	613 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
LYS5	YGL154C	PFK1	P16861	987 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
LYS5	YGL154C	CKA2	P19454	339 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LYS5	YGL154C	CDC15	P27636	974 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LYS5	YGL154C	YJU2	P28320	278 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
LYS5	YGL154C	MLS1	P30952	554 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LYS5	YGL154C	CBF2	P32504	956 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LYS5	YGL154C	TKL2	P33315	681 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LYS5	YGL154C	STO1	P34160	861 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
LYS5	YGL154C	YKT6	P36015	200 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
LYS5	YGL154C	SRX1	P36077	127 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LYS5	YGL154C	YBR056W	P38081	501 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LYS5	YGL154C	WSC4	P38739	605 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LYS5	YGL154C	YER130C	P39959	443 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LYS5	YGL154C	SSB2	P40150	613 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
LYS5	YGL154C	OSW5	P40219	148 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LYS5	YGL154C	ERG10	P41338	398 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
LYS5	YGL154C	HOS2	P53096	452 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
LYS5	YGL154C	SDA1	P53313	767 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
LYS5	YGL154C	TDA7	P53882	636 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
LYS5	YGL154C	YNL144C	P53907	740 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LYS5	YGL154C	CEG1	Q01159	459 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
LYS5	YGL154C	MGR3	Q04472	501 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LYS5	YGL154C	PRM6	Q04705	352 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LYS5	YGL154C	HEL2	Q05580	639 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
LYS5	YGL154C	YLR177W	Q06251	628 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LYS5	YGL154C	GPM2	Q12008	311 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LYS5	YGL154C	YPL150W	Q12152	901 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LYS5	YGL154C	SCM3	Q12334	223 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LYS5	YGL154C	SSC1	P0CS90	654 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
LYS5	YGL154C	PHO13	P19881	312 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LYS5	YGL154C	BAS1	P22035	811 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LYS5	YGL154C	SSO1	P32867	290 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LYS5	YGL154C	YRO2	P38079	344 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LYS5	YGL154C	RFT1	P38206	574 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
LYS5	YGL154C	SHE3	P38272	425 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
LYS5	YGL154C	YBR242W	P38331	238 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LYS5	YGL154C	CHS7	P38843	316 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LYS5	YGL154C	REV7	P38927	245 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LYS5	YGL154C	SAK1	P38990	1142 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LYS5	YGL154C	SCS2	P40075	244 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
LYS5	YGL154C	CNN1	P43618	361 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LYS5	YGL154C	NUP84	P52891	726 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LYS5	YGL154C	ERP6	P53198	216 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LYS5	YGL154C	TOF2	Q02208	771 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LYS5	YGL154C	ADY4	Q05955	493 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LYS5	YGL154C	YLR407W	Q06070	228 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LYS5	YGL154C	VAC14	Q06708	880 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LYS5	YGL154C	GNT1	Q12096	491 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LYS5	YGL154C	GET3	Q12154	354 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
LYS5	YGL154C	GPR1	Q12361	961 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LYS5	YGL154C	YOL098C	Q12496	1037 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LYS5	YGL154C	LSO2	Q3E772	92 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
LYS5	YGL154C	ADH4	P10127	382 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LYS5	YGL154C	SEN2	P16658	377 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LYS5	YGL154C	ALG1	P16661	449 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LYS5	YGL154C	SEC15	P22224	910 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LYS5	YGL154C	RDS1	P25611	832 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LYS5	YGL154C	NIP1	P32497	812 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
LYS5	YGL154C	AGP2	P38090	596 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LYS5	YGL154C	UBP13	P38187	747 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LYS5	YGL154C	HEK2	P38199	381 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.77	□□□□□ -1.65	not detected
LYS5	YGL154C	ATG12	P38316	186 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LYS5	YGL154C	EFM2	P38347	419 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LYS5	YGL154C	BAT1	P38891	393 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
LYS5	YGL154C	YHB1	P39676	399 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
LYS5	YGL154C	RPT2	P40327	437 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
LYS5	YGL154C	DUG1	P43616	481 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
LYS5	YGL154C	HFM1	P51979	1187 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LYS5	YGL154C	TOF1	P53840	1238 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LYS5	YGL154C	BOP3	P53958	396 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LYS5	YGL154C	HFD1	Q04458	532 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LYS5	YGL154C	YPR172W	Q06608	200 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LYS5	YGL154C	TSR2	Q06672	205 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
LYS5	YGL154C	MRL1	Q06815	381 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LYS5	YGL154C	RTK1	Q12100	620 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
LYS5	YGL154C	CPA2	P03965	1118 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
LYS5	YGL154C	RPL22A	P05749	121 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
LYS5	YGL154C	HMG1	P12683	1054 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LYS5	YGL154C	NMT1	P14743	455 aa		4.76	□□□□□ -1.65

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