RNA–Protein interactions for RNA: YDR297W

SUR2, Transcript of Sphinganine C4-hydroxylase, yeast

Gene SUR2, Length 1,050 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SUR2	YDR297W	SMF2	P38778	549 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SUR2	YDR297W	SEC31	P38968	1273 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SUR2	YDR297W	STT3	P39007	718 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SUR2	YDR297W	VHR1	P40522	640 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SUR2	YDR297W	ERR3	P42222	437 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SUR2	YDR297W	LSB6	P42951	607 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SUR2	YDR297W	POL31	P46957	487 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SUR2	YDR297W	VMA10	P48836	114 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SUR2	YDR297W	MPS2	P53159	387 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SUR2	YDR297W	YNR040W	P53736	256 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SUR2	YDR297W	EGD1	Q02642	157 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SUR2	YDR297W	EAR1	Q03212	550 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SUR2	YDR297W	WAR1	Q03631	944 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SUR2	YDR297W	YDR131C	Q03899	556 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SUR2	YDR297W	GFD1	Q04839	188 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SUR2	YDR297W	RTN1	Q04947	295 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SUR2	YDR297W	TY1A-GR1	Q12085	440 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SUR2	YDR297W	NBP2	Q12163	236 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SUR2	YDR297W	ZRT2	Q12436	422 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SUR2	YDR297W	TY1A-PR3	Q6Q5H1	440 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SUR2	YDR297W	TY1A-OL	Q92392	440 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SUR2	YDR297W	FUM1	P08417	488 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	MTF2	P10849	440 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	POL3	P15436	1097 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	PDX1	P16451	410 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	HPR1	P17629	752 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	YPK2	P18961	677 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	SAM2	P19358	384 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	ADE2	P21264	571 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	MSB1	P21339	1137 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	RFA1	P22336	621 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	CDC15	P27636	974 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	PRO1	P32264	428 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	CBF2	P32504	956 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	MGM101	P32787	269 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	MDL1	P33310	695 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	YUH1	P35127	236 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	CPR5	P35176	225 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	APM3	P38153	483 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	QNS1	P38795	714 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	MTG2	P38860	518 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	HXT6	P39003	570 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	HXT7	P39004	570 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	PIK1	P39104	1066 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	RIO2	P40160	425 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	PSF2	P40359	213 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	YRB2	P40517	327 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	ULP2	P40537	1034 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	LYS14	P40971	790 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	SHR5	P41912	237 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	YFL066C	P43538	392 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	YFL052W	P43551	465 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	STU2	P46675	888 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	MDV1	P47025	714 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	ABM1	P47146	123 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	SSN8	P47821	323 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	PUS4	P48567	403 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	YDL183C	P48569	320 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	ALT1	P52893	592 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	DSE4	P53753	1117 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	CBK1	P53894	756 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	FYV6	P53913	173 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	PEX25	Q02969	394 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	MRPS17	Q03246	237 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	HCR1	Q05775	265 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	NUR1	Q12066	484 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	YLR278C	Q05854	1341 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	CBP1	P07252	654 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	SSC1	P0CS90	654 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	GRR1	P24814	1151 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	YCL049C	P25577	312 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	EFT1	P32324	842 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	VPH2	P32341	215 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	RMA1	P36001	430 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	STL1	P39932	569 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	ZRG8	P40021	1076 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	YTA12	P40341	825 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	YJR061W	P40355	935 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	UBP7	P40453	1071 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	YIL077C	P40508	320 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	AGE2	P40529	298 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	TFG2	P41896	400 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	ASE1	P50275	885 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	YGR117C	P53270	476 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	BRE5	P53741	515 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	CIK1	Q01649	594 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	VPS60	Q03390	229 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	ARO80	Q04052	950 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	CSM3	Q04659	317 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	RTT103	Q05543	409 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	ECM38	Q05902	660 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	ATG17	Q06410	417 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	TMA16	Q08687	178 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	HRK1	Q08732	759 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	BUD7	Q08754	746 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	ICL2	Q12031	575 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	VIK1	Q12045	647 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	SRN2	Q99176	213 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	YLR358C	O13565	187 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	AAC3	P18238	307 aa		4.81	□□□□□ -1.64

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