RNA–Protein interactions for RNA: YDR288W

NSE3, Transcript of Component of the SMC5-SMC6 complex, yeast

Gene NSE3, Length 912 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NSE3	YDR288W	PSK2	Q08217	1101 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NSE3	YDR288W	FRE7	Q12333	620 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NSE3	YDR288W	YOR111W	Q99210	232 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NSE3	YDR288W	CDC24	P11433	854 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
NSE3	YDR288W	PCT1	P13259	424 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NSE3	YDR288W	MBR1	P23493	339 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NSE3	YDR288W	UBP13	P38187	747 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NSE3	YDR288W	MUB1	Q03162	620 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NSE3	YDR288W	RSM28	Q03430	361 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NSE3	YDR288W	PDR8	Q06149	701 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NSE3	YDR288W	YDR056C	Q12025	205 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NSE3	YDR288W	PTP1	P25044	335 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NSE3	YDR288W	COQ3	P27680	312 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NSE3	YDR288W	SWE1	P32944	819 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NSE3	YDR288W	MUD2	P36084	527 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
NSE3	YDR288W	LYS14	P40971	790 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NSE3	YDR288W	SWP82	P43554	623 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NSE3	YDR288W	RSC9	Q03124	581 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NSE3	YDR288W	HXK2	P04807	486 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
NSE3	YDR288W	YMR085W	P0CF18	432 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NSE3	YDR288W	SRP54	P20424	541 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
NSE3	YDR288W	SLZ1	P40167	298 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NSE3	YDR288W	ULP2	P40537	1034 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
NSE3	YDR288W	ARC1	P46672	376 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
NSE3	YDR288W	PFA5	Q03289	374 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NSE3	YDR288W	TMA64	Q04600	565 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
NSE3	YDR288W	SKG3	Q06315	1026 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NSE3	YDR288W	ENT4	Q07872	247 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NSE3	YDR288W	TCO89	Q08921	799 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NSE3	YDR288W	HUA2	Q12134	243 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NSE3	YDR288W	ESL2	P36168	1195 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NSE3	YDR288W	YBL029W	P38201	376 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NSE3	YDR288W	ARN1	P38731	627 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NSE3	YDR288W	ECM10	P39987	644 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NSE3	YDR288W	LTP1	P40347	161 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NSE3	YDR288W	PSA1	P41940	361 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
NSE3	YDR288W	AAD10	P47182	288 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NSE3	YDR288W	IST1	P53843	298 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
NSE3	YDR288W	RAD30	Q04049	632 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NSE3	YDR288W	MCH4	Q08268	501 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NSE3	YDR288W	PFA4	Q12006	378 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NSE3	YDR288W	CDC16	P09798	840 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NSE3	YDR288W	OCT1	P35999	772 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NSE3	YDR288W	RTS1	P38903	757 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NSE3	YDR288W	SEC24	P40482	926 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
NSE3	YDR288W	YJL107C	P42947	387 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NSE3	YDR288W	SIP4	P46954	829 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NSE3	YDR288W	UBP8	P50102	471 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NSE3	YDR288W	YML122C	Q03207	126 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NSE3	YDR288W	VIP1	Q06685	1146 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
NSE3	YDR288W	GPN2	Q08726	347 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
NSE3	YDR288W	GET3	Q12154	354 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
NSE3	YDR288W	PET111	P08468	800 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NSE3	YDR288W	MDM10	P18409	493 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NSE3	YDR288W	YAP1	P19880	650 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
NSE3	YDR288W	SCO2	P38072	301 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NSE3	YDR288W	BUR6	P40096	142 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NSE3	YDR288W	FMP10	P40098	244 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NSE3	YDR288W	CDC1	P40986	491 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NSE3	YDR288W	CTK2	P46962	323 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NSE3	YDR288W	NET1	P47035	1189 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NSE3	YDR288W	PIL1	P53252	339 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
NSE3	YDR288W	YNL144C	P53907	740 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NSE3	YDR288W	ECM22	Q05958	814 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
NSE3	YDR288W	PSR1	Q07800	427 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NSE3	YDR288W	CRC1	Q12289	327 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NSE3	YDR288W	RRI1	Q12468	440 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NSE3	YDR288W	RAP1	P11938	827 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NSE3	YDR288W	SAN1	P22470	610 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NSE3	YDR288W	PAH1	P32567	862 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NSE3	YDR288W	YFR020W	P43600	232 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NSE3	YDR288W	NNF2	P53253	936 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NSE3	YDR288W	COP1	P53622	1201 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NSE3	YDR288W	YNR061C	P53747	219 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NSE3	YDR288W	YSA1	Q01976	231 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NSE3	YDR288W	YLR455W	Q06188	304 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NSE3	YDR288W	YBR126W-A	Q8TGU7	68 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NSE3	YDR288W	YER145C-A	A0A023PYF4	145 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NSE3	YDR288W	SPE2	P21182	396 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NSE3	YDR288W	VMA16	P23968	213 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NSE3	YDR288W	AGP2	P38090	596 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NSE3	YDR288W	MAL33	P38157	468 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NSE3	YDR288W	FLO5	P38894	1075 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NSE3	YDR288W	NOP16	P40007	231 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
NSE3	YDR288W	JHD1	P40034	492 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NSE3	YDR288W	YIL024C	P40543	189 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NSE3	YDR288W	DPB11	P47027	764 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
NSE3	YDR288W	BNA3	P47039	444 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
NSE3	YDR288W	INN1	P53901	409 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NSE3	YDR288W	STP1	Q00947	519 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NSE3	YDR288W	RIX7	Q07844	837 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
NSE3	YDR288W	GPA1	P08539	472 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NSE3	YDR288W	AAC3	P18238	307 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NSE3	YDR288W	TKL1	P23254	680 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
NSE3	YDR288W	AFG3	P39925	761 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NSE3	YDR288W	TPA1	P40032	644 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
NSE3	YDR288W	CFD1	P40558	293 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NSE3	YDR288W	RPN11	P43588	306 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
NSE3	YDR288W	YGL036W	P53185	909 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
NSE3	YDR288W	SWF1	Q04629	336 aa		4.89	□□□□□ -1.63

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