RNA–Protein interactions for RNA: YBR273C

UBX7, Transcript of UBX (ubiquitin regulatory X) domain-containing protein, yeast

Gene UBX7, Length 1,311 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
UBX7	YBR273C	RSC8	P43609	557 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	SHE4	P51534	789 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	NOP19	P53317	196 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	YNL011C	P53980	444 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	YNL010W	P53981	241 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	KTR6	P54070	446 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	NAN1	Q02931	896 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	YDR179W-A	Q03983	463 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	RAD30	Q04049	632 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	HSP31	Q04432	237 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	AIM32	Q04689	311 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	GMC2	Q06201	188 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	HDA3	Q06623	655 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	YLR413W	Q06689	675 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	MET7	Q08645	548 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	MUM3	Q08750	479 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	COX6	P00427	148 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	CBP2	P03874	630 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	TPK1	P06244	397 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	SUI3	P09064	285 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	SBP1	P10080	294 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	FBA1	P14540	359 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	YCR090C	P25654	182 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	RPS5	P26783	225 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	PAH1	P32567	862 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	SSE2	P32590	693 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	GDA1	P32621	518 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	CSE1	P33307	960 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	HSP78	P33416	811 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	UTP11	P34247	250 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	MDJ1	P35191	511 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	SPC42	P36094	363 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	YBR241C	P38142	488 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	GOS1	P38736	223 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	CYC2	P38909	366 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	DSS1	P39112	969 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	NPT1	P39683	429 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	YEL028W	P39989	153 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	HPM1	P40481	377 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	AGP3	P43548	558 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	DIA3	P52290	468 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	PEX8	P53248	589 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	ASI2	P53895	289 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	YNL134C	P53912	376 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	LSM3	P57743	89 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	RNY1	Q02933	434 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	SVL3	Q03088	825 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	MMT1	Q03218	510 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	TFB3	Q03290	321 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	YDR109C	Q04585	715 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	ARP9	Q05123	467 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	HEL2	Q05580	639 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	GLO2	Q05584	274 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	FAR10	Q06001	478 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	SYT1	Q06836	1226 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	RCL1	Q08096	367 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	SLD7	Q08457	257 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	NBP2	Q12163	236 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	SAS5	Q99314	248 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	GAL80	P04387	435 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	BCY1	P07278	416 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	SNF4	P12904	322 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	HSP26	P15992	214 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.88	□□□□□ -1.63	not detected
UBX7	YBR273C	RPB4	P20433	221 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	TRX2	P22803	104 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	DBR1	P24309	405 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	RVS161	P25343	265 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	SPB1	P25582	841 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	BRF1	P29056	596 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	NPL6	P32832	435 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	ASK1	P35734	292 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	MRP21	P38175	177 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	YBR053C	P38235	358 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	IST2	P38250	946 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	FTH1	P38310	465 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	BSD2	P38356	321 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	HAT2	P39984	401 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	ARB1	P40024	610 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	ATM1	P40416	690 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	AIM20	P40451	204 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	VHR1	P40522	640 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	IMA5	P40884	581 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	SPR3	P41901	512 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	MAF1	P41910	395 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	ROK1	P45818	564 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	RPS10B	P46784	105 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	GCD14	P46959	383 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	BNA3	P47039	444 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	MTR3	P48240	250 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	AIF1	P52923	378 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	YGR054W	P53235	642 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	GPI1	P53306	609 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	YNL115C	P53925	644 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	SIW14	P53965	281 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	REX2	P54964	269 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	SKI8	Q02793	397 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	NHP10	Q03435	203 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	YDR239C	Q03780	787 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	CSN9	Q03981	162 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	FMP42	Q04991	504 aa		4.88	□□□□□ -1.63

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