RNA–Protein interactions for RNA: YNL171C

YNL171C, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YNL171C, Length 369 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YNL171C	YNL171C	TY2A-C	P25383	438 aa		4.48	□□□□□ -1.69
YNL171C	YNL171C	CNS1	P33313	385 aa		4.48	□□□□□ -1.69
YNL171C	YNL171C	ASE1	P50275	885 aa		4.48	□□□□□ -1.69
YNL171C	YNL171C	CSL4	P53859	292 aa	Predicted RBP	4.48	□□□□□ -1.69
YNL171C	YNL171C	STP1	Q00947	519 aa		4.48	□□□□□ -1.69
YNL171C	YNL171C	TY2A-DR2	Q03483	438 aa		4.48	□□□□□ -1.69
YNL171C	YNL171C	VID22	Q05934	901 aa		4.48	□□□□□ -1.69
YNL171C	YNL171C	TFC6	Q06339	672 aa		4.48	□□□□□ -1.69
YNL171C	YNL171C	LEA1	Q08963	238 aa	Predicted RBP	4.48	□□□□□ -1.69
YNL171C	YNL171C	TRM8	Q12009	286 aa		4.48	□□□□□ -1.69
YNL171C	YNL171C	BAG7	Q12128	409 aa		4.48	□□□□□ -1.69
YNL171C	YNL171C	TY2A-B	Q12260	438 aa		4.48	□□□□□ -1.69
YNL171C	YNL171C	TY2A-OR2	Q12293	438 aa		4.48	□□□□□ -1.69
YNL171C	YNL171C	TY2A-DR1	Q12392	438 aa		4.48	□□□□□ -1.69
YNL171C	YNL171C	TY2A-OR1	Q12439	438 aa		4.48	□□□□□ -1.69
YNL171C	YNL171C	YLR111W	Q12528	110 aa		4.48	□□□□□ -1.69
YNL171C	YNL171C	TY2A-DR3	Q99303	438 aa		4.48	□□□□□ -1.69
YNL171C	YNL171C	IMD2	P38697	523 aa	Known RBP	4.47	□□□□□ -1.69
YNL171C	YNL171C	BNA1	P47096	177 aa		4.47	□□□□□ -1.69
YNL171C	YNL171C	MSY1	P48527	492 aa		4.47	□□□□□ -1.69
YNL171C	YNL171C	IMD3	P50095	523 aa	Known RBP	4.47	□□□□□ -1.69
YNL171C	YNL171C	PSP1	P50896	841 aa	Known RBP	4.47	□□□□□ -1.69
YNL171C	YNL171C	YRB30	P53107	440 aa	Predicted RBP	4.47	□□□□□ -1.69
YNL171C	YNL171C	RRT6	P53117	311 aa	Predicted RBP	4.47	□□□□□ -1.69
YNL171C	YNL171C	SNU56	Q03782	492 aa	Known RBP	4.47	□□□□□ -1.69
YNL171C	YNL171C	TMA16	Q08687	178 aa		4.47	□□□□□ -1.69
YNL171C	YNL171C	LYS21	Q12122	440 aa	Known RBP	4.47	□□□□□ -1.69
YNL171C	YNL171C	FRE7	Q12333	620 aa		4.47	□□□□□ -1.69
YNL171C	YNL171C	ERG27	Q12452	347 aa	Known RBP	4.47	□□□□□ -1.69
YNL171C	YNL171C	CET1	O13297	549 aa	Predicted RBP	4.46	□□□□□ -1.7
YNL171C	YNL171C	ILS1	P09436	1072 aa	Known RBP	4.46	□□□□□ -1.7
YNL171C	YNL171C	MAK32	P23060	363 aa		4.46	□□□□□ -1.7
YNL171C	YNL171C	RER1	P25560	188 aa		4.46	□□□□□ -1.7
YNL171C	YNL171C	SSH4	P32343	579 aa		4.46	□□□□□ -1.7
YNL171C	YNL171C	GSH1	P32477	678 aa		4.46	□□□□□ -1.7
YNL171C	YNL171C	RIC1	P40395	1056 aa		4.46	□□□□□ -1.7
YNL171C	YNL171C	NMD5	P46970	1048 aa		4.46	□□□□□ -1.7
YNL171C	YNL171C	SSP2	Q08646	371 aa		4.46	□□□□□ -1.7
YNL171C	YNL171C	YLR302C	O13544	120 aa		4.45	□□□□□ -1.7
YNL171C	YNL171C	RRN3	P36070	627 aa		4.45	□□□□□ -1.7
YNL171C	YNL171C	ULP2	P40537	1034 aa	Predicted RBP	4.45	□□□□□ -1.7
YNL171C	YNL171C	CIN1	P40987	1014 aa		4.45	□□□□□ -1.7
YNL171C	YNL171C	SNO3	P43544	222 aa		4.45	□□□□□ -1.7
YNL171C	YNL171C	IRC7	P43623	340 aa		4.45	□□□□□ -1.7
YNL171C	YNL171C	STB2	P46679	850 aa		4.45	□□□□□ -1.7
YNL171C	YNL171C	DCP2	P53550	970 aa	Known RBP	4.45	□□□□□ -1.7
YNL171C	YNL171C	ADE16	P54113	591 aa	Known RBP	4.45	□□□□□ -1.7
YNL171C	YNL171C	SWA2	Q06677	668 aa		4.45	□□□□□ -1.7
YNL171C	YNL171C	THI3	Q07471	609 aa		4.45	□□□□□ -1.7
YNL171C	YNL171C	TOP1	P04786	769 aa		4.44	□□□□□ -1.7
YNL171C	YNL171C	SUI3	P09064	285 aa	Known RBP	4.44	□□□□□ -1.7
YNL171C	YNL171C	GUK1	P15454	187 aa	Known RBP	4.44	□□□□□ -1.7
YNL171C	YNL171C	MSS51	P32335	436 aa		4.44	□□□□□ -1.7
YNL171C	YNL171C	GEX2	P36173	615 aa		4.44	□□□□□ -1.7
YNL171C	YNL171C	YER010C	P40011	234 aa		4.44	□□□□□ -1.7
YNL171C	YNL171C	PFK26	P40433	827 aa	Known RBP	4.44	□□□□□ -1.7
YNL171C	YNL171C	ASG1	P40467	964 aa		4.44	□□□□□ -1.7
YNL171C	YNL171C	IDP3	P53982	420 aa	Known RBP	4.44	□□□□□ -1.7
YNL171C	YNL171C	ERG13	P54839	491 aa	Known RBP	4.44	□□□□□ -1.7
YNL171C	YNL171C	REG1	Q00816	1014 aa		4.44	□□□□□ -1.7
YNL171C	YNL171C	YMR018W	Q04364	514 aa		4.44	□□□□□ -1.7
YNL171C	YNL171C	YSP3	P25036	478 aa		4.43	□□□□□ -1.7
YNL171C	YNL171C	TFC3	P34111	1160 aa		4.43	□□□□□ -1.7
YNL171C	YNL171C	AXL2	P38928	823 aa		4.43	□□□□□ -1.7
YNL171C	YNL171C	ERV46	P39727	415 aa		4.43	□□□□□ -1.7
YNL171C	YNL171C	PHM8	P40025	321 aa		4.43	□□□□□ -1.7
YNL171C	YNL171C	UBP7	P40453	1071 aa		4.43	□□□□□ -1.7
YNL171C	YNL171C	ORC5	P50874	479 aa		4.43	□□□□□ -1.7
YNL171C	YNL171C	YPR003C	P53394	754 aa		4.43	□□□□□ -1.7
YNL171C	YNL171C	CRN1	Q06440	651 aa		4.43	□□□□□ -1.7
YNL171C	YNL171C	NEW1	Q08972	1196 aa	Known RBP	4.43	□□□□□ -1.7
YNL171C	YNL171C	SRB5	P32585	307 aa		4.42	□□□□□ -1.7
YNL171C	YNL171C	MEP2	P41948	499 aa		4.42	□□□□□ -1.7
YNL171C	YNL171C	CBK1	P53894	756 aa		4.42	□□□□□ -1.7
YNL171C	YNL171C	YPL068C	Q02749	293 aa		4.42	□□□□□ -1.7
YNL171C	YNL171C	RSC9	Q03124	581 aa		4.42	□□□□□ -1.7
YNL171C	YNL171C	FCP1	Q03254	732 aa		4.42	□□□□□ -1.7
YNL171C	YNL171C	NUS1	Q12063	375 aa		4.42	□□□□□ -1.7
YNL171C	YNL171C	PCT1	P13259	424 aa		4.41	□□□□□ -1.7
YNL171C	YNL171C	ERG8	P24521	451 aa		4.41	□□□□□ -1.7
YNL171C	YNL171C	CDC15	P27636	974 aa		4.41	□□□□□ -1.7
YNL171C	YNL171C	PSA1	P41940	361 aa	Known RBP	4.41	□□□□□ -1.7
YNL171C	YNL171C	VPS4	P52917	437 aa		4.41	□□□□□ -1.7
YNL171C	YNL171C	SNO4	Q04902	237 aa		4.41	□□□□□ -1.7
YNL171C	YNL171C	OPY2	Q06810	360 aa		4.41	□□□□□ -1.7
YNL171C	YNL171C	HSP33	Q08914	237 aa	Known RBP	4.41	□□□□□ -1.7
YNL171C	YNL171C	HSP32	Q08992	237 aa		4.41	□□□□□ -1.7
YNL171C	YNL171C	VCX1	Q99385	411 aa		4.41	□□□□□ -1.7
YNL171C	YNL171C	YMR085W	P0CF18	432 aa		4.4	□□□□□ -1.71
YNL171C	YNL171C	COQ3	P27680	312 aa		4.4	□□□□□ -1.71
YNL171C	YNL171C	ECM32	P32644	1121 aa	Known RBP	4.4	□□□□□ -1.71
YNL171C	YNL171C	LHS1	P36016	881 aa		4.4	□□□□□ -1.71
YNL171C	YNL171C	PSD1	P39006	500 aa		4.4	□□□□□ -1.71
YNL171C	YNL171C	MRX1	P40050	688 aa		4.4	□□□□□ -1.71
YNL171C	YNL171C	VID27	P40157	782 aa		4.4	□□□□□ -1.71
YNL171C	YNL171C	NBP2	Q12163	236 aa		4.4	□□□□□ -1.71
YNL171C	YNL171C	MRP2	P10663	115 aa	Predicted RBP	4.39	□□□□□ -1.71
YNL171C	YNL171C	MCM10	P32354	571 aa		4.39	□□□□□ -1.71
YNL171C	YNL171C	SOF1	P33750	489 aa	Known RBP	4.39	□□□□□ -1.71
YNL171C	YNL171C	NTR2	P36118	322 aa	Predicted RBP	4.39	□□□□□ -1.71

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 122.9 ms