RNA–Protein interactions for RNA: YJR138W

IML1, Transcript of GTPase-activating protein (GAP), subunit of SEA and Iml1p complexes, yeast

Gene IML1, Length 4,755 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
IML1	YJR138W	GID8	P40208	455 aa		1.24	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	ELO3	P40319	345 aa		1.24	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	ARG2	P40360	574 aa		1.24	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	IME4	P41833	600 aa		1.24	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	HOC1	P47124	396 aa		1.24	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	SRP1	Q02821	542 aa	Known RBP	1.24	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	ARP9	Q05123	467 aa		1.24	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	YLH47	Q06493	454 aa		1.24	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	LDB18	Q07887	179 aa		1.24	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	YOL019W	Q08157	551 aa		1.24	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	PUF2	Q12221	1075 aa	Known RBP RIP-Chip data	1.24	□□□□□ -2.21	not detected
IML1	YJR138W	SST2	P11972	698 aa	Known RBP	1.24	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	MET8	P15807	274 aa		1.24	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	RNQ1	P25367	405 aa		1.24	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	GID7	P25569	745 aa		1.24	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	CWP1	P28319	239 aa		1.24	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	TRK2	P28584	889 aa		1.24	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	MVD1	P32377	396 aa	Known RBP	1.24	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	EFB1	P32471	206 aa	Known RBP	1.24	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	SMI1	P32566	505 aa		1.24	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	YME2	P32843	850 aa		1.24	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	SFC1	P33303	322 aa		1.24	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	BYE1	P36106	594 aa		1.24	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	PCM1	P38628	557 aa	Known RBP	1.24	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	ORC6	P38826	435 aa		1.24	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	MNT3	P40549	630 aa		1.24	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	NOP15	P53927	220 aa	Predicted RBP	1.24	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	AQR1	P53943	586 aa		1.24	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	VHS1	Q03785	461 aa		1.24	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	TRM12	Q04235	462 aa		1.24	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	RAX1	Q08760	435 aa		1.24	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	YOR387C	Q08910	206 aa		1.24	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	YPL272C	Q08984	517 aa		1.24	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	YPR089W	O13585	888 aa		1.24	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	IME1	P21190	360 aa		1.24	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	BUB3	P26449	341 aa		1.24	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	MET22	P32179	357 aa		1.24	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	SRB2	P34162	210 aa		1.24	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	DOA1	P36037	715 aa		1.24	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	IRS4	P36115	615 aa	Known RBP	1.24	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	TRZ1	P36159	838 aa	Predicted RBP	1.24	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	MOH1	P38191	138 aa		1.24	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	YMR262W	P38430	313 aa		1.24	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	YHR045W	P38775	560 aa		1.24	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	GIC1	P38785	314 aa		1.24	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	SAD1	P43589	448 aa		1.24	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	CCT8	P47079	568 aa	Known RBP	1.24	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	MPS2	P53159	387 aa		1.24	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	PEX8	P53248	589 aa		1.24	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	STP3	Q05937	343 aa		1.24	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	PEX11	Q12462	236 aa		1.24	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	YOS9	Q99220	542 aa		1.24	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	RPL4A	P10664	362 aa	Known RBP	1.24	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	CWH43	P25618	953 aa		1.24	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	YIH1	P25637	258 aa		1.24	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	GUT2	P32191	649 aa		1.24	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	PRP39	P39682	629 aa	Known RBP	1.24	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	STL1	P39932	569 aa		1.24	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	YEL073C	P39974	107 aa		1.24	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	BPL1	P48445	690 aa	Predicted RBP	1.24	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	RFX1	P48743	811 aa		1.24	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	RPL4B	P49626	362 aa	Known RBP	1.24	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	COX18	P53239	316 aa		1.24	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	ALF1	P53904	254 aa		1.24	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	RNH1	Q04740	348 aa		1.24	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	REH1	Q06709	432 aa		1.24	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	AKR2	Q12013	749 aa		1.24	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	SPO24	Q3E752	67 aa		1.24	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	HRP1	Q99383	534 aa	Known RBP	1.24	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	GAL11	P19659	1081 aa		1.23	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	BAS1	P22035	811 aa		1.23	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	RPB10	P22139	70 aa		1.23	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	MRS6	P32864	603 aa	Known RBP	1.23	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	AGP2	P38090	596 aa		1.23	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	PPS1	P38148	807 aa		1.23	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	MAL33	P38157	468 aa		1.23	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	TFB2	Q02939	513 aa		1.23	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	GIR2	Q03768	265 aa	Predicted RBP	1.23	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	ATG16	Q03818	150 aa		1.23	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	COG8	Q04632	607 aa		1.23	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	GRE1	Q08969	168 aa		1.23	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	NEW1	Q08972	1196 aa	Known RBP	1.23	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	RRP42	Q12277	265 aa	Predicted RBP	1.23	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	YPR071W	Q12346	211 aa		1.23	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	RKM5	Q12367	367 aa		1.23	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	ARP7	Q12406	477 aa		1.23	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	IZH4	Q99393	312 aa		1.23	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	YER145C-A	A0A023PYF4	145 aa		1.23	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	RSR1	P13856	272 aa		1.23	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	CBS2	P14905	389 aa		1.23	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	URA4	P20051	364 aa		1.23	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	VPS1	P21576	704 aa	Known RBP	1.23	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	IMG1	P25626	169 aa		1.23	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	RAM2	P29703	316 aa		1.23	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	SPC110	P32380	944 aa		1.23	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	SEF1	P34228	1148 aa		1.23	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	YBP1	P38315	674 aa		1.23	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	CBR1	P38626	284 aa	Known RBP	1.23	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	RRP3	P38712	501 aa	Known RBP	1.23	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	QNS1	P38795	714 aa	Known RBP	1.23	□□□□□ -2.21

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