RNA–Protein interactions for RNA: YFR049W

YMR31, Transcript of Mitochondrial ribosomal protein of the small subunit, yeast

Gene YMR31, Length 372 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YMR31	YFR049W	COX1	P00401	534 aa		2.82	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	SIR3	P06701	978 aa		2.82	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	SES1	P07284	462 aa	Known RBP	2.82	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	YML003W	P0CF16	290 aa		2.82	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	STE11	P23561	717 aa		2.82	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	HRR25	P29295	494 aa	Known RBP	2.82	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	CDC5	P32562	705 aa		2.82	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	VPH1	P32563	840 aa	Known RBP	2.82	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	SRB5	P32585	307 aa		2.82	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	TSA1	P34760	196 aa	Known RBP	2.82	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	PPS1	P38148	807 aa		2.82	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	APE4	P38821	490 aa		2.82	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	MPT5	P39016	859 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.82	□□□□□ -1.96	not detected
YMR31	YFR049W	BUD16	P39988	312 aa		2.82	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	YJL068C	P40363	299 aa		2.82	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	SEC24	P40482	926 aa	Known RBP	2.82	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	MAF1	P41910	395 aa		2.82	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	LYS4	P49367	693 aa	Predicted RBP	2.82	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	INP52	P50942	1183 aa		2.82	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	PHO23	P50947	330 aa		2.82	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	YGL036W	P53185	909 aa	Predicted RBP	2.82	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	YGR250C	P53316	781 aa	Known RBP	2.82	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	SPC98	P53540	846 aa		2.82	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	USA1	Q03714	838 aa		2.82	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	YDR109C	Q04585	715 aa		2.82	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	CRN1	Q06440	651 aa		2.82	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	ATG23	Q06671	453 aa		2.82	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	RIM20	Q12033	661 aa		2.82	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	RKI1	Q12189	258 aa		2.82	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	PGA3	Q12746	312 aa	Known RBP	2.82	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	YBR255C-A	Q3E776	120 aa		2.82	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	AI5_ALPHA	Q9ZZX1	630 aa		2.82	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	LAM4	P38800	1345 aa		2.82	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	CET1	O13297	549 aa	Predicted RBP	2.81	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	KAR3	P17119	729 aa		2.81	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	EST1	P17214	699 aa	Predicted RBP	2.81	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	CLB3	P24870	427 aa		2.81	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	CNE1	P27825	502 aa		2.81	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	GPI10	P30777	616 aa		2.81	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	TOA1	P32773	286 aa		2.81	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	SAS3	P34218	831 aa		2.81	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	LOT5	P34234	306 aa		2.81	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	UBP11	P36026	717 aa		2.81	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	UBP13	P38187	747 aa		2.81	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	PIH1	P38768	344 aa		2.81	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	YEL057C	P39983	233 aa		2.81	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	BUR6	P40096	142 aa		2.81	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	RGI2	P40188	164 aa		2.81	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	DJP1	P40564	432 aa		2.81	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	SSU1	P41930	458 aa		2.81	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	PMT6	P42934	759 aa		2.81	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	BUL1	P48524	976 aa		2.81	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	ART5	P53244	586 aa	Known RBP	2.81	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	SNF12	P53628	566 aa		2.81	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	ATG4	P53867	494 aa		2.81	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	ZDS2	P54786	942 aa		2.81	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	SSL2	Q00578	843 aa		2.81	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	YML119W	Q03208	357 aa		2.81	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	RMT2	Q03305	412 aa		2.81	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	YDR239C	Q03780	787 aa		2.81	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	BUD22	Q04347	519 aa	Known RBP	2.81	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	GTB1	Q04924	702 aa		2.81	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	YML053C	Q04978	212 aa		2.81	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	SWA2	Q06677	668 aa		2.81	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	CDA2	Q06703	312 aa		2.81	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	PSR1	Q07800	427 aa		2.81	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	PRS5	Q12265	496 aa	Known RBP	2.81	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	SPT7	P35177	1332 aa		2.81	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	YRF1-4	O13559	1382 aa		2.8	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	HSP82	P02829	709 aa	Known RBP	2.8	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	PPR1	P07272	904 aa	Predicted RBP	2.8	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	STE12	P13574	688 aa		2.8	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	STE4	P18851	423 aa		2.8	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	PRP6	P19735	899 aa	Predicted RBP	2.8	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	PWP1	P21304	576 aa	Known RBP	2.8	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	VMA16	P23968	213 aa		2.8	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	MNE1	P24720	663 aa		2.8	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	KES1	P35844	434 aa	Known RBP	2.8	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	RPF2	P36160	344 aa	Known RBP	2.8	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	GEX2	P36173	615 aa		2.8	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	APE3	P37302	537 aa	Known RBP	2.8	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	AGP2	P38090	596 aa		2.8	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	PCL5	P38794	229 aa		2.8	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	LRP1	P38801	184 aa	Known RBP	2.8	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	MAM1	P40065	302 aa		2.8	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	JEM1	P40358	645 aa		2.8	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	IRC8	P47046	822 aa		2.8	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	NPA3	P47122	385 aa		2.8	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	MSE1	P48525	536 aa		2.8	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	CTR1	P49573	406 aa		2.8	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	YGR066C	P53242	292 aa		2.8	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	OGG1	P53397	376 aa	Predicted RBP	2.8	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	RIA1	P53893	1110 aa		2.8	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	YAT1	P80235	687 aa		2.8	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	AAT1	Q01802	451 aa		2.8	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	MEH1	Q02205	184 aa		2.8	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	YMR206W	Q03695	313 aa		2.8	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	AIM32	Q04689	311 aa		2.8	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	VPS38	Q05919	439 aa		2.8	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	MRI1	Q06489	411 aa	Known RBP	2.8	□□□□□ -1.96

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