RNA–Protein interactions for RNA: YOR179C

SYC1, Transcript of Subunit of the APT subcomplex of cleavage and polyadenylation factor, yeast

Gene SYC1, Length 567 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SYC1	YOR179C	SEC3	P33332	1336 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
SYC1	YOR179C	CHO2	P05374	869 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
SYC1	YOR179C	CHS3	P29465	1165 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SYC1	YOR179C	VPS8	P39702	1274 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SYC1	YOR179C	LAS21	P40367	830 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SYC1	YOR179C	RIC1	P40395	1056 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SYC1	YOR179C	YIL161W	P40449	235 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
SYC1	YOR179C	MNT3	P40549	630 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SYC1	YOR179C	IST3	P40565	148 aa	Predicted RBP	4.25	□□□□□ -1.73
SYC1	YOR179C	IMO32	P53219	342 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SYC1	YOR179C	CBK1	P53894	756 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SYC1	YOR179C	TMA64	Q04600	565 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
SYC1	YOR179C	ARG7	Q04728	441 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SYC1	YOR179C	SUT2	Q12286	268 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SYC1	YOR179C	YLR302C	O13544	120 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SYC1	YOR179C	KGD2	P19262	463 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
SYC1	YOR179C	PMA2	P19657	947 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SYC1	YOR179C	AAD3	P25612	363 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SYC1	YOR179C	YMC1	P32331	307 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SYC1	YOR179C	RPF2	P36160	344 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
SYC1	YOR179C	FUN12	P39730	1002 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
SYC1	YOR179C	CSL4	P53859	292 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
SYC1	YOR179C	APM1	Q00776	475 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
SYC1	YOR179C	REG1	Q00816	1014 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SYC1	YOR179C	AAT1	Q01802	451 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SYC1	YOR179C	SNO4	Q04902	237 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SYC1	YOR179C	GTB1	Q04924	702 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SYC1	YOR179C	TMA16	Q08687	178 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SYC1	YOR179C	HSP33	Q08914	237 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
SYC1	YOR179C	HSP32	Q08992	237 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SYC1	YOR179C	YDR056C	Q12025	205 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SYC1	YOR179C	ULA1	Q12059	462 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SYC1	YOR179C	LCB4	Q12246	624 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SYC1	YOR179C	COX1	P00401	534 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SYC1	YOR179C	ADE5,7	P07244	802 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
SYC1	YOR179C	RRP43	P25359	394 aa	Predicted RBP	4.23	□□□□□ -1.73
SYC1	YOR179C	ERC1	P38767	581 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SYC1	YOR179C	SAP1	P39955	897 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
SYC1	YOR179C	BUD16	P39988	312 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SYC1	YOR179C	DPH1	P40487	425 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
SYC1	YOR179C	OPT1	P40897	799 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SYC1	YOR179C	QRI1	P43123	477 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
SYC1	YOR179C	UBX6	P47049	396 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SYC1	YOR179C	NPA3	P47122	385 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SYC1	YOR179C	ASE1	P50275	885 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SYC1	YOR179C	RAD33	Q04231	177 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SYC1	YOR179C	PLM2	Q04383	521 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SYC1	YOR179C	MRI1	Q06489	411 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
SYC1	YOR179C	SWT1	Q12104	458 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SYC1	YOR179C	PRS5	Q12265	496 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
SYC1	YOR179C	YOL087C	Q99247	1116 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SYC1	YOR179C	AI5_ALPHA	Q9ZZX1	630 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SYC1	YOR179C	HEM1	P09950	548 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
SYC1	YOR179C	SPO16	P17122	198 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SYC1	YOR179C	RFA2	P26754	273 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
SYC1	YOR179C	YJL043W	P47053	257 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SYC1	YOR179C	MRK1	P50873	501 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SYC1	YOR179C	FMP30	Q02883	468 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SYC1	YOR179C	ERG27	Q12452	347 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
SYC1	YOR179C	Q0010	Q9ZZX9	128 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SYC1	YOR179C	YMR084W	A2P2R3	262 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SYC1	YOR179C	YML003W	P0CF16	290 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SYC1	YOR179C	LRE1	P25579	583 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
SYC1	YOR179C	ADY2	P25613	283 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SYC1	YOR179C	CBF2	P32504	956 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SYC1	YOR179C	PPZ2	P33329	710 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SYC1	YOR179C	MUD2	P36084	527 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
SYC1	YOR179C	PSD1	P39006	500 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SYC1	YOR179C	YEL068C	P39977	110 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SYC1	YOR179C	TMA108	P40462	946 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SYC1	YOR179C	HRD3	Q05787	833 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SYC1	YOR179C	ATG23	Q06671	453 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SYC1	YOR179C	FUM1	P08417	488 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
SYC1	YOR179C	ERG8	P24521	451 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SYC1	YOR179C	YJU2	P28320	278 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
SYC1	YOR179C	LAC1	P28496	418 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SYC1	YOR179C	RPC34	P32910	317 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SYC1	YOR179C	VBA2	P38358	474 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
SYC1	YOR179C	EXO1	P39875	702 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SYC1	YOR179C	PAC2	P39937	518 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SYC1	YOR179C	PFK26	P40433	827 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
SYC1	YOR179C	DJP1	P40564	432 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SYC1	YOR179C	TDA10	P42938	290 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SYC1	YOR179C	YDR109C	Q04585	715 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SYC1	YOR179C	CYK3	Q07533	885 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SYC1	YOR179C	YPL191C	Q08930	360 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SYC1	YOR179C	ENT1	Q12518	454 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SYC1	YOR179C	SES1	P07284	462 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
SYC1	YOR179C	AQY1	P0CD91	305 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SYC1	YOR179C	MRP20	P32387	263 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SYC1	YOR179C	HES1	P35843	434 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SYC1	YOR179C	GEX2	P36173	615 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SYC1	YOR179C	ERP2	P39704	215 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SYC1	YOR179C	YJR061W	P40355	935 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SYC1	YOR179C	VPS4	P52917	437 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SYC1	YOR179C	COG4	Q06096	861 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SYC1	YOR179C	SLK19	Q08581	821 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
SYC1	YOR179C	NUS1	Q12063	375 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SYC1	YOR179C	NBP2	Q12163	236 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SYC1	YOR179C	VCX1	Q99385	411 aa		4.19	□□□□□ -1.74

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