RNA–Protein interactions for RNA: YML063W

RPS1B, Transcript of Ribosomal protein 10 (rp10) of the small (40S) subunit, yeast

Gene RPS1B, Length 768 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPS1B	YML063W	ORC4	P54791	529 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPS1B	YML063W	YAP6	Q03935	383 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPS1B	YML063W	DOT1	Q04089	582 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RPS1B	YML063W	ERB1	Q04660	807 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RPS1B	YML063W	STP4	Q07351	490 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPS1B	YML063W	APL5	Q08951	932 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RPS1B	YML063W	SGT2	Q12118	346 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RPS1B	YML063W	YOR022C	Q12204	715 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPS1B	YML063W	RRP36	Q12481	300 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RPS1B	YML063W	SNF2	P22082	1703 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPS1B	YML063W	ADE6	P38972	1358 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RPS1B	YML063W	YLR302C	O13544	120 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPS1B	YML063W	ADE3	P07245	946 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RPS1B	YML063W	FBP1	P09201	348 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPS1B	YML063W	CHS2	P14180	963 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPS1B	YML063W	MDH1	P17505	334 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.53	□□□□□ -1.68	not detected
RPS1B	YML063W	CLB3	P24870	427 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPS1B	YML063W	RRP7	P25368	297 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RPS1B	YML063W	IMG2	P25642	146 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RPS1B	YML063W	DAL80	P26343	269 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPS1B	YML063W	ARP2	P32381	391 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RPS1B	YML063W	MRP20	P32387	263 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPS1B	YML063W	CAB3	P36076	571 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPS1B	YML063W	MIC60	P36112	540 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPS1B	YML063W	LAS1	P36146	502 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RPS1B	YML063W	APE3	P37302	537 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RPS1B	YML063W	SMF1	P38925	575 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPS1B	YML063W	BFR1	P38934	470 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.53	□□□□□ -1.68	not detected
RPS1B	YML063W	LTP1	P40347	161 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPS1B	YML063W	MET28	P40573	187 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPS1B	YML063W	LCB2	P40970	561 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPS1B	YML063W	THI6	P41835	540 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPS1B	YML063W	SSU1	P41930	458 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPS1B	YML063W	AVT1	P47082	602 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPS1B	YML063W	AAD10	P47182	288 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPS1B	YML063W	TAF4	P50105	388 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPS1B	YML063W	ART5	P53244	586 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RPS1B	YML063W	ERV25	P54837	211 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RPS1B	YML063W	ADA2	Q02336	434 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPS1B	YML063W	NUS1	Q12063	375 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPS1B	YML063W	ATG11	Q12527	1178 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPS1B	YML063W	PSK1	P31374	1356 aa		4.53	□□□□□ -1.69
RPS1B	YML063W	TUB2	P02557	457 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
RPS1B	YML063W	SUI3	P09064	285 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
RPS1B	YML063W	HSF1	P10961	833 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RPS1B	YML063W	ERS1	P17261	260 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RPS1B	YML063W	CLC1	P17891	233 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RPS1B	YML063W	CPR2	P23285	205 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RPS1B	YML063W	PRP28	P23394	588 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RPS1B	YML063W	CLB1	P24868	471 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RPS1B	YML063W	SWI4	P25302	1093 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
RPS1B	YML063W	SED4	P25365	1065 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RPS1B	YML063W	POT1	P27796	417 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.52	□□□□□ -1.69	not detected
RPS1B	YML063W	SMI1	P32566	505 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RPS1B	YML063W	TFB1	P32776	642 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RPS1B	YML063W	LIP5	P32875	414 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RPS1B	YML063W	GCS1	P35197	352 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RPS1B	YML063W	KES1	P35844	434 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
RPS1B	YML063W	DAD2	P36162	133 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RPS1B	YML063W	CDS1	P38221	457 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RPS1B	YML063W	GDT1	P38301	280 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
RPS1B	YML063W	TDP1	P38319	544 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RPS1B	YML063W	LYS9	P38999	446 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RPS1B	YML063W	RGI2	P40188	164 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RPS1B	YML063W	PXA1	P41909	870 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RPS1B	YML063W	CIT3	P43635	486 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RPS1B	YML063W	TAH11	P47112	604 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RPS1B	YML063W	GCV2	P49095	1034 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RPS1B	YML063W	HFM1	P51979	1187 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RPS1B	YML063W	DUS1	P53759	423 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
RPS1B	YML063W	YPL107W	Q02873	248 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RPS1B	YML063W	FDC1	Q03034	503 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RPS1B	YML063W	CWC21	Q03375	135 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
RPS1B	YML063W	RAD33	Q04231	177 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RPS1B	YML063W	GAD1	Q04792	585 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RPS1B	YML063W	RSF1	Q05043	376 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RPS1B	YML063W	ADY4	Q05955	493 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RPS1B	YML063W	YPS7	Q06325	596 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RPS1B	YML063W	PUS7	Q08647	676 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
RPS1B	YML063W	APC5	Q08683	685 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RPS1B	YML063W	MRN1	Q08925	612 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.52	□□□□□ -1.69	not detected
RPS1B	YML063W	FRE6	Q12473	712 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RPS1B	YML063W	URA3	P03962	267 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RPS1B	YML063W	DFR1	P07807	211 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.51	□□□□□ -1.69	not detected
RPS1B	YML063W	CBS1	P14066	229 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RPS1B	YML063W	IME1	P21190	360 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RPS1B	YML063W	APN1	P22936	367 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RPS1B	YML063W	YCK1	P23291	538 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RPS1B	YML063W	PEP3	P27801	918 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RPS1B	YML063W	SWC3	P31376	625 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RPS1B	YML063W	SSE1	P32589	693 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
RPS1B	YML063W	GYP6	P32806	458 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RPS1B	YML063W	RIB7	P33312	244 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RPS1B	YML063W	UBP11	P36026	717 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RPS1B	YML063W	CST26	P38226	397 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RPS1B	YML063W	VID24	P38263	362 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RPS1B	YML063W	VPS45	P38932	577 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RPS1B	YML063W	MKT1	P40850	830 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
RPS1B	YML063W	GSM1	P42950	618 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RPS1B	YML063W	YFL054C	P43549	646 aa		4.51	□□□□□ -1.69

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