RNA–Protein interactions for RNA: YML014W

TRM9, Transcript of tRNA methyltransferase, yeast

Gene TRM9, Length 840 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TRM9	YML014W	GND2	P53319	492 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TRM9	YML014W	YDR344C	Q05510	147 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TRM9	YML014W	ENO1	P00924	437 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
TRM9	YML014W	ACO1	P19414	778 aa	Known RBP RIP-Chip data	12.82	□□□□□ -0.36	not detected
TRM9	YML014W	HRR25	P29295	494 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
TRM9	YML014W	GGA2	P38817	585 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
TRM9	YML014W	CRP1	P38845	465 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
TRM9	YML014W	BUD13	P46947	266 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
TRM9	YML014W	TEP1	P53916	434 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TRM9	YML014W	MRS2	Q01926	470 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TRM9	YML014W	BUD22	Q04347	519 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
TRM9	YML014W	CDC123	Q05791	360 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TRM9	YML014W	TRE2	Q08693	809 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TRM9	YML014W	NDD1	Q08887	554 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TRM9	YML014W	YLR053C	Q12026	108 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TRM9	YML014W	SST2	P11972	698 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
TRM9	YML014W	INO1	P11986	533 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TRM9	YML014W	ATP12	P22135	325 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TRM9	YML014W	RDH54	P38086	958 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TRM9	YML014W	LIN1	P38852	340 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
TRM9	YML014W	HEM14	P40012	539 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TRM9	YML014W	EFM6	P53970	246 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TRM9	YML014W	NHX1	Q04121	633 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TRM9	YML014W	RSC2	Q06488	889 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TRM9	YML014W	CMS1	Q07897	291 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
TRM9	YML014W	PEX15	Q08215	383 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TRM9	YML014W	PEX11	Q12462	236 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TRM9	YML014W	ARF2	P19146	181 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
TRM9	YML014W	MRPL8	P22353	238 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TRM9	YML014W	TFA2	P36145	328 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TRM9	YML014W	MRP21	P38175	177 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TRM9	YML014W	TIM13	P53299	105 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TRM9	YML014W	HST2	P53686	357 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TRM9	YML014W	YML119W	Q03208	357 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TRM9	YML014W	YDR109C	Q04585	715 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TRM9	YML014W	YSH1	Q06224	779 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
TRM9	YML014W	ADY3	Q07732	790 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TRM9	YML014W	KCS1	Q12494	1050 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TRM9	YML014W	BEM3	P32873	1128 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TRM9	YML014W	CAB3	P36076	571 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TRM9	YML014W	SEC28	P40509	296 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
TRM9	YML014W	TDA10	P42938	290 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TRM9	YML014W	CCT8	P47079	568 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
TRM9	YML014W	AMA1	P50082	593 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TRM9	YML014W	BIO4	P53630	237 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TRM9	YML014W	YNL058C	P53947	316 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TRM9	YML014W	TRS31	Q03337	283 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TRM9	YML014W	BUD20	Q08004	166 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
TRM9	YML014W	SLD7	Q08457	257 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TRM9	YML014W	CLP1	Q08685	445 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
TRM9	YML014W	SLP1	Q12232	587 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TRM9	YML014W	YPR117W	Q06116	2489 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TRM9	YML014W	REV1	P12689	985 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TRM9	YML014W	CLN1	P20437	546 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TRM9	YML014W	DAL81	P21657	970 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TRM9	YML014W	RAM1	P22007	431 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TRM9	YML014W	YSP3	P25036	478 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TRM9	YML014W	LIP5	P32875	414 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TRM9	YML014W	MAK5	P38112	773 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
TRM9	YML014W	SEO1	P39709	593 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TRM9	YML014W	RGI2	P40188	164 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TRM9	YML014W	YJL107C	P42947	387 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TRM9	YML014W	ARH1	P48360	493 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TRM9	YML014W	AIM14	P53109	570 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TRM9	YML014W	PEX8	P53248	589 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TRM9	YML014W	IPI3	P53877	555 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TRM9	YML014W	RPL34A	P87262	121 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
TRM9	YML014W	NUP100	Q02629	959 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TRM9	YML014W	GSF2	Q04697	403 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
TRM9	YML014W	YLR046C	Q12253	270 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TRM9	YML014W	PDH1	Q12428	516 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
TRM9	YML014W	SCH9	P11792	824 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.37
TRM9	YML014W	CTF13	P35203	478 aa		12.77	□□□□□ -0.37
TRM9	YML014W	POL12	P38121	705 aa	Predicted RBP	12.77	□□□□□ -0.37
TRM9	YML014W	YBR032W	P38223	100 aa		12.77	□□□□□ -0.37
TRM9	YML014W	PEP8	P40335	379 aa		12.77	□□□□□ -0.37
TRM9	YML014W	TFG1	P41895	735 aa	Predicted RBP	12.77	□□□□□ -0.37
TRM9	YML014W	SIP4	P46954	829 aa		12.77	□□□□□ -0.37
TRM9	YML014W	RCF2	P53721	224 aa		12.77	□□□□□ -0.37
TRM9	YML014W	REG1	Q00816	1014 aa		12.77	□□□□□ -0.37
TRM9	YML014W	TAF11	Q04226	346 aa		12.77	□□□□□ -0.37
TRM9	YML014W	RGS2	Q99188	309 aa		12.77	□□□□□ -0.37
TRM9	YML014W	KIN3	P22209	435 aa		12.76	□□□□□ -0.37
TRM9	YML014W	MSH2	P25847	964 aa		12.76	□□□□□ -0.37
TRM9	YML014W	CYM1	P32898	989 aa		12.76	□□□□□ -0.37
TRM9	YML014W	YHI9	P38765	294 aa		12.76	□□□□□ -0.37
TRM9	YML014W	DUN1	P39009	513 aa		12.76	□□□□□ -0.37
TRM9	YML014W	YJL206C	P39529	758 aa		12.76	□□□□□ -0.37
TRM9	YML014W	AIM23	P47015	356 aa		12.76	□□□□□ -0.37
TRM9	YML014W	TAF6	P53040	516 aa		12.76	□□□□□ -0.37
TRM9	YML014W	IMP4	P53941	290 aa	Known RBP	12.76	□□□□□ -0.37
TRM9	YML014W	ORC3	P54790	616 aa		12.76	□□□□□ -0.37
TRM9	YML014W	YVH1	Q02256	364 aa	Known RBP	12.76	□□□□□ -0.37
TRM9	YML014W	PML39	Q03760	334 aa		12.76	□□□□□ -0.37
TRM9	YML014W	YLR177W	Q06251	628 aa		12.76	□□□□□ -0.37
TRM9	YML014W	FLC1	Q08967	793 aa		12.76	□□□□□ -0.37
TRM9	YML014W	HSF1	P10961	833 aa		12.75	□□□□□ -0.37
TRM9	YML014W	SIR1	P21691	654 aa		12.75	□□□□□ -0.37
TRM9	YML014W	AMD2	P22580	549 aa		12.75	□□□□□ -0.37
TRM9	YML014W	GEX1	P25596	615 aa		12.75	□□□□□ -0.37

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