RNA–Protein interactions for RNA: YLR349W

YLR349W, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YLR349W, Length 507 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YLR349WYLR349W MRS6P32864 603 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
YLR349WYLR349W JNM1P36224 373 aa9.28□□□□□ -0.92
YLR349WYLR349W NCL1P38205 684 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
YLR349WYLR349W ZIM17P42844 174 aa9.28□□□□□ -0.92
YLR349WYLR349W NUP85P46673 744 aa9.28□□□□□ -0.92
YLR349WYLR349W SWC4P53201 476 aa9.28□□□□□ -0.92
YLR349WYLR349W YGR127WP53275 312 aa9.28□□□□□ -0.92
YLR349WYLR349W STP3Q05937 343 aa9.28□□□□□ -0.92
YLR349WYLR349W TRM8Q12009 286 aa9.28□□□□□ -0.92
YLR349WYLR349W COX5AP00424 153 aa9.27□□□□□ -0.93
YLR349WYLR349W BIT2P38346 545 aa9.27□□□□□ -0.93
YLR349WYLR349W ALR2P43553 858 aa9.27□□□□□ -0.93
YLR349WYLR349W MNN11P46985 422 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
YLR349WYLR349W YJL132WP47014 750 aa9.27□□□□□ -0.93
YLR349WYLR349W TCB2P48231 1178 aa9.27□□□□□ -0.93
YLR349WYLR349W BNI4P53858 892 aa9.27□□□□□ -0.93
YLR349WYLR349W TEP1P53916 434 aa9.27□□□□□ -0.93
YLR349WYLR349W YMR018WQ04364 514 aa9.27□□□□□ -0.93
YLR349WYLR349W ETT1Q08421 412 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
YLR349WYLR349W PGC1Q08959 321 aa9.27□□□□□ -0.93
YLR349WYLR349W EFG1Q3E705 233 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
YLR349WYLR349W YPR089WO13585 888 aa9.26□□□□□ -0.93
YLR349WYLR349W RNQ1P25367 405 aa9.26□□□□□ -0.93
YLR349WYLR349W NRP1P32770 719 aaKnown RBP RIP-Chip data9.26□□□□□ -0.93not detected
YLR349WYLR349W MIC60P36112 540 aa9.26□□□□□ -0.93
YLR349WYLR349W SRP72P38688 640 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
YLR349WYLR349W HXT8P40886 569 aa9.26□□□□□ -0.93
YLR349WYLR349W SIP4P46954 829 aa9.26□□□□□ -0.93
YLR349WYLR349W YNL143CP53908 130 aa9.26□□□□□ -0.93
YLR349WYLR349W UME1Q03010 460 aa9.26□□□□□ -0.93
YLR349WYLR349W VHS1Q03785 461 aa9.26□□□□□ -0.93
YLR349WYLR349W VPS68Q12016 184 aa9.26□□□□□ -0.93
YLR349WYLR349W FRE7Q12333 620 aa9.26□□□□□ -0.93
YLR349WYLR349W YOR338WQ99326 363 aa9.26□□□□□ -0.93
YLR349WYLR349W ERP2P39704 215 aa9.25□□□□□ -0.93
YLR349WYLR349W PCL10P53124 433 aa9.25□□□□□ -0.93
YLR349WYLR349W HST3P53687 447 aa9.25□□□□□ -0.93
YLR349WYLR349W YNL108CP53929 270 aa9.25□□□□□ -0.93
YLR349WYLR349W SEY1Q99287 776 aa9.25□□□□□ -0.93
YLR349WYLR349W HRP1Q99383 534 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
YLR349WYLR349W CYM1P32898 989 aa9.24□□□□□ -0.93
YLR349WYLR349W MPE1P35728 441 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
YLR349WYLR349W MSR1P38714 643 aa9.24□□□□□ -0.93
YLR349WYLR349W YHL041WP38730 149 aa9.24□□□□□ -0.93
YLR349WYLR349W SMF1P38925 575 aa9.24□□□□□ -0.93
YLR349WYLR349W TIM17P39515 158 aa9.24□□□□□ -0.93
YLR349WYLR349W VFA1P40080 203 aa9.24□□□□□ -0.93
YLR349WYLR349W MVP1P40959 511 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
YLR349WYLR349W ALK1P43633 760 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
YLR349WYLR349W ROK1P45818 564 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
YLR349WYLR349W TY4A-JP47023 414 aa9.24□□□□□ -0.93
YLR349WYLR349W EGD1Q02642 157 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
YLR349WYLR349W RSM10Q03201 203 aa9.24□□□□□ -0.93
YLR349WYLR349W BSC6Q08280 497 aa9.24□□□□□ -0.93
YLR349WYLR349W MST1P07236 462 aa9.23□□□□□ -0.93
YLR349WYLR349W UBA1P22515 1024 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
YLR349WYLR349W PTP1P25044 335 aa9.23□□□□□ -0.93
YLR349WYLR349W DCC1P25559 380 aa9.23□□□□□ -0.93
YLR349WYLR349W MCM2P29469 868 aa9.23□□□□□ -0.93
YLR349WYLR349W AIM18P38884 321 aa9.23□□□□□ -0.93
YLR349WYLR349W TES1P41903 349 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
YLR349WYLR349W VPS9P54787 451 aa9.23□□□□□ -0.93
YLR349WYLR349W SSL1Q04673 461 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
YLR349WYLR349W GLE1Q12315 538 aa9.23□□□□□ -0.93
YLR349WYLR349W PNS1Q12412 539 aa9.23□□□□□ -0.93
YLR349WYLR349W RPL43AP0CX25 92 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
YLR349WYLR349W RPL43BP0CX26 92 aa9.22□□□□□ -0.93
YLR349WYLR349W SCL1P21243 252 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
YLR349WYLR349W YCR015CP25616 317 aa9.22□□□□□ -0.93
YLR349WYLR349W RFA2P26754 273 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
YLR349WYLR349W SPT16P32558 1035 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
YLR349WYLR349W TFA2P36145 328 aa9.22□□□□□ -0.93
YLR349WYLR349W PIM1P36775 1133 aa9.22□□□□□ -0.93
YLR349WYLR349W YBR259WP38338 688 aa9.22□□□□□ -0.93
YLR349WYLR349W OTU2P38747 307 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
YLR349WYLR349W YAL037WP39728 267 aa9.22□□□□□ -0.93
YLR349WYLR349W RVS167P39743 482 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
YLR349WYLR349W IST3P40565 148 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
YLR349WYLR349W SPG5P42933 373 aa9.22□□□□□ -0.93
YLR349WYLR349W FRE4P53746 719 aa9.22□□□□□ -0.93
YLR349WYLR349W SUR7P54003 302 aa9.22□□□□□ -0.93
YLR349WYLR349W EMI1Q04406 187 aa9.22□□□□□ -0.93
YLR349WYLR349W TPO1Q07824 586 aa9.22□□□□□ -0.93
YLR349WYLR349W PLB3Q08108 686 aa9.22□□□□□ -0.93
YLR349WYLR349W GPR1Q12361 961 aa9.22□□□□□ -0.93
YLR349WYLR349W PDC5P16467 563 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.94
YLR349WYLR349W MEI4P29467 408 aa9.21□□□□□ -0.94
YLR349WYLR349W LYP1P32487 611 aa9.21□□□□□ -0.94
YLR349WYLR349W PHO11P35842 467 aa9.21□□□□□ -0.94
YLR349WYLR349W ARA1P38115 344 aa9.21□□□□□ -0.94
YLR349WYLR349W IML3P38265 245 aa9.21□□□□□ -0.94
YLR349WYLR349W PHO12P38693 467 aa9.21□□□□□ -0.94
YLR349WYLR349W CCT6P39079 546 aa9.21□□□□□ -0.94
YLR349WYLR349W RPL34BP40525 121 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.94
YLR349WYLR349W MKT1P40850 830 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.94
YLR349WYLR349W STR3P53101 465 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.94
YLR349WYLR349W YGL108CP53139 140 aa9.21□□□□□ -0.94
YLR349WYLR349W HOS3Q02959 697 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.94
YLR349WYLR349W ENT5Q03769 411 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.94
YLR349WYLR349W IVY1Q04934 453 aa9.21□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 31.4 ms