RNA–Protein interactions for RNA: YBR273C

UBX7, Transcript of UBX (ubiquitin regulatory X) domain-containing protein, yeast

Gene UBX7, Length 1,311 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
UBX7	YBR273C	PHO87	P25360	923 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	PRR1	P28708	518 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	ATP7	P30902	174 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	SMI1	P32566	505 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	RGT1	P32862	1170 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	RPT1	P33299	467 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	BUD2	P33314	1104 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	MRP8	P35719	219 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	LHS1	P36016	881 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	RRN3	P36070	627 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	ECM4	P36156	370 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	ABZ1	P37254	787 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	CAB2	P40506	365 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	RRN7	P40992	514 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	UTP8	P53276	713 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	TPO2	P53283	614 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	CUS2	P53830	285 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	ALG11	P53954	548 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	DOS2	P54858	310 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	PRO2	P54885	456 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	ELP3	Q02908	557 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	SPC2	Q04969	178 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	JIP5	Q06214	492 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	GGA1	Q06336	557 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	TMA46	Q12000	345 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	VIK1	Q12045	647 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	ATG34	Q12292	412 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	HSH49	Q99181	213 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	UBR2	Q07963	1872 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	COX4	P04037	155 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	RHO2	P06781	192 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	INO1	P11986	533 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	ATR1	P13090	542 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	GFD2	P25370	566 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	GID7	P25569	745 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	PMI40	P29952	429 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	ZIP1	P31111	875 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	TBS1	P38114	1094 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	SHE3	P38272	425 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	HSL7	P38274	827 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	BIT2	P38346	545 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	ARN1	P38731	627 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	UTP9	P38882	575 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	YDR089W	P38966	869 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	YAT2	P40017	923 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	FIR1	P40020	876 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	SNL1	P40548	159 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	REF2	P42073	533 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	NOP9	P47077	666 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	YTP1	P53584	459 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	YMR160W	Q03823	816 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	TIF35	Q04067	274 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	YDR444W	Q04093	687 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	ATG26	Q06321	1198 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	YPR097W	Q06839	1073 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	YOL019W	Q08157	551 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	TYW1	Q08960	810 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	TY3A-G	Q12173	290 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	IES3	Q12345	250 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	EFG1	Q3E705	233 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	TY3A-I	Q99219	290 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	NHA1	Q99271	985 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	YPR089W	O13585	888 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	ENO1	P00924	437 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	SAN1	P22470	610 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	VPS34	P22543	875 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	LRE1	P25579	583 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	VAC17	P25591	423 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	YCL068C	P25593	260 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	CSM1	P25651	190 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	YUR1	P26725	428 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	CYS3	P31373	394 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	NDI1	P32340	513 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	HXT3	P32466	567 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	AEP1	P32493	518 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	FRE1	P32791	686 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	ATG12	P38316	186 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	YHR182W	P38870	785 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	SHU2	P38957	223 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	SEC31	P38968	1273 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	PRM9	P39551	298 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	MEF2	P39677	819 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	NUP60	P39705	539 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	AVT2	P39981	480 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	IES5	P40060	125 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	YER186C	P40101	306 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	YFL012W	P43580	148 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	RRT5	P43607	289 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	PFD1	P46988	109 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	ASG7	P46993	209 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	VTC4	P47075	721 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	CCT8	P47079	568 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	ALT2	P52892	507 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	BUD32	P53323	261 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	DSL1	P53847	754 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	SLM2	P53955	656 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	ADE12	P80210	433 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	MET14	Q02196	202 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	SRL4	Q03085	281 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	SKY1	Q03656	742 aa		4.93	□□□□□ -1.62

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