RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027667.12

Pkp1-201, Transcript of Plakophilin-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pkp1, Length 4,669 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Zfhx4Q9JJN2 3550 aa7.63□□□□□ -1.19
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Pkp1-201ENSMUST00000027667 Zfhx3Q61329 3726 aa7.59□□□□□ -1.19
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm21798J3QNU5 87 aa7.59□□□□□ -1.19
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm10643Q3URG9 111 aa7.59□□□□□ -1.19
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Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm20538F6Z9R1 75 aa6.89□□□□□ -1.31
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Pkp1-201ENSMUST00000027667 A930033H14RikG5E8X6 103 aa6.79□□□□□ -1.32
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Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm11939A2A592 99 aa6.5□□□□□ -1.37
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Pkp1-201ENSMUST00000027667 Dnah10D3YYQ8 4591 aa6.26□□□□□ -1.41
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Pkp1-201ENSMUST00000027667 Csmd3Q80T79 3707 aa6.1□□□□□ -1.43
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Pkp1-201ENSMUST00000027667 Krtap3-1A2A591 98 aa6.03□□□□□ -1.44
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Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm18596A0A1W2P860 280 aa5.91□□□□□ -1.46
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm19668J3QMD1 248 aa5.91□□□□□ -1.46
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Dnah11E9Q7N9 4488 aa5.9□□□□□ -1.46
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Dnah9B1AR51 4484 aa5.9□□□□□ -1.46
Pkp1-201ENSMUST00000027667 PrkdcP97313 4128 aa5.89□□□□□ -1.47
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Dync1h1Q9JHU4 4644 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mycbp2Q7TPH6 4711 aa5.85□□□□□ -1.47
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Dnah7bL7N1Y0 4068 aa5.85□□□□□ -1.47
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Dync2h1Q45VK7 4306 aa5.85□□□□□ -1.47
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Pkp1-201ENSMUST00000027667 ApobE9Q414 4505 aa5.79□□□□□ -1.48
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