Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
Csmd1Q923L3 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Csmd1Q923L3 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Csmd1Q923L3 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
Csmd1Q923L3 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Csmd1Q923L3 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Csmd1Q923L3 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Csmd1Q923L3 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Csmd1Q923L3 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Csmd1Q923L3 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Csmd1Q923L3 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Csmd1Q923L3 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Csmd1Q923L3 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Csmd1Q923L3 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Csmd1Q923L3 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Csmd1Q923L3 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Csmd1Q923L3 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Csmd1Q923L3 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Csmd1Q923L3 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Csmd1Q923L3 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Csmd1Q923L3 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Csmd1Q923L3 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Csmd1Q923L3 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Csmd1Q923L3 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Csmd1Q923L3 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Csmd1Q923L3 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Csmd1Q923L3 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Csmd1Q923L3 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Csmd1Q923L3 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Csmd1Q923L3 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Csmd1Q923L3 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Csmd1Q923L3 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Csmd1Q923L3 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Csmd1Q923L3 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Csmd1Q923L3 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Csmd1Q923L3 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Csmd1Q923L3 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Csmd1Q923L3 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Csmd1Q923L3 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Csmd1Q923L3 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Csmd1Q923L3 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Csmd1Q923L3 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Csmd1Q923L3 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Csmd1Q923L3 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Csmd1Q923L3 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Csmd1Q923L3 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Csmd1Q923L3 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Csmd1Q923L3 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Csmd1Q923L3 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Csmd1Q923L3 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Csmd1Q923L3 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Csmd1Q923L3 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Csmd1Q923L3 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Csmd1Q923L3 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Csmd1Q923L3 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Csmd1Q923L3 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Csmd1Q923L3 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Csmd1Q923L3 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Csmd1Q923L3 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Csmd1Q923L3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Csmd1Q923L3 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Csmd1Q923L3 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Csmd1Q923L3 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Csmd1Q923L3 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Csmd1Q923L3 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Csmd1Q923L3 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Csmd1Q923L3 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Csmd1Q923L3 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Csmd1Q923L3 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Csmd1Q923L3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Csmd1Q923L3 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Csmd1Q923L3 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Csmd1Q923L3 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Csmd1Q923L3 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Csmd1Q923L3 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Csmd1Q923L3 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Csmd1Q923L3 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Csmd1Q923L3 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Csmd1Q923L3 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Csmd1Q923L3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Csmd1Q923L3 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Csmd1Q923L3 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Csmd1Q923L3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Csmd1Q923L3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Csmd1Q923L3 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Csmd1Q923L3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Csmd1Q923L3 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Csmd1Q923L3 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Csmd1Q923L3 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Csmd1Q923L3 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Csmd1Q923L3 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Csmd1Q923L3 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Csmd1Q923L3 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Csmd1Q923L3 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Csmd1Q923L3 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Csmd1Q923L3 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Csmd1Q923L3 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Csmd1Q923L3 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Csmd1Q923L3 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Csmd1Q923L3 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
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