Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJN2

Zfhx4, Zinc finger homeobox protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 3,550 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfhx4Q9JJN2 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC37.96■■■■□ 3.67
Zfhx4Q9JJN2 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Zfhx4Q9JJN2 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Zfhx4Q9JJN2 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
Zfhx4Q9JJN2 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
Zfhx4Q9JJN2 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
Zfhx4Q9JJN2 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Zfhx4Q9JJN2 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Zfhx4Q9JJN2 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
Zfhx4Q9JJN2 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Zfhx4Q9JJN2 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
Zfhx4Q9JJN2 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
Zfhx4Q9JJN2 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Zfhx4Q9JJN2 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Zfhx4Q9JJN2 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Zfhx4Q9JJN2 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Zfhx4Q9JJN2 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Zfhx4Q9JJN2 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Zfhx4Q9JJN2 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Zfhx4Q9JJN2 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
Zfhx4Q9JJN2 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
Zfhx4Q9JJN2 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30■■■□□ 2.39
Zfhx4Q9JJN2 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Zfhx4Q9JJN2 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Zfhx4Q9JJN2 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Zfhx4Q9JJN2 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Zfhx4Q9JJN2 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Zfhx4Q9JJN2 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Zfhx4Q9JJN2 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Zfhx4Q9JJN2 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Zfhx4Q9JJN2 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Zfhx4Q9JJN2 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Zfhx4Q9JJN2 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Zfhx4Q9JJN2 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Zfhx4Q9JJN2 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Zfhx4Q9JJN2 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Zfhx4Q9JJN2 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Zfhx4Q9JJN2 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Zfhx4Q9JJN2 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Zfhx4Q9JJN2 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Zfhx4Q9JJN2 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Zfhx4Q9JJN2 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Zfhx4Q9JJN2 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Zfhx4Q9JJN2 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Zfhx4Q9JJN2 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Zfhx4Q9JJN2 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Zfhx4Q9JJN2 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Zfhx4Q9JJN2 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Zfhx4Q9JJN2 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Zfhx4Q9JJN2 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Zfhx4Q9JJN2 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Zfhx4Q9JJN2 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Zfhx4Q9JJN2 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Zfhx4Q9JJN2 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Zfhx4Q9JJN2 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Zfhx4Q9JJN2 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Zfhx4Q9JJN2 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Zfhx4Q9JJN2 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Zfhx4Q9JJN2 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Zfhx4Q9JJN2 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Zfhx4Q9JJN2 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Zfhx4Q9JJN2 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Zfhx4Q9JJN2 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Zfhx4Q9JJN2 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Zfhx4Q9JJN2 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Zfhx4Q9JJN2 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Zfhx4Q9JJN2 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Zfhx4Q9JJN2 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Zfhx4Q9JJN2 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Zfhx4Q9JJN2 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Zfhx4Q9JJN2 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Zfhx4Q9JJN2 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Zfhx4Q9JJN2 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Zfhx4Q9JJN2 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Zfhx4Q9JJN2 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Zfhx4Q9JJN2 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Zfhx4Q9JJN2 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Zfhx4Q9JJN2 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Zfhx4Q9JJN2 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Zfhx4Q9JJN2 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Zfhx4Q9JJN2 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Zfhx4Q9JJN2 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Zfhx4Q9JJN2 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Zfhx4Q9JJN2 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Zfhx4Q9JJN2 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Zfhx4Q9JJN2 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Zfhx4Q9JJN2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Zfhx4Q9JJN2 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Zfhx4Q9JJN2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Zfhx4Q9JJN2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Zfhx4Q9JJN2 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Zfhx4Q9JJN2 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Zfhx4Q9JJN2 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Zfhx4Q9JJN2 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Zfhx4Q9JJN2 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Zfhx4Q9JJN2 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Zfhx4Q9JJN2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Zfhx4Q9JJN2 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Zfhx4Q9JJN2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Zfhx4Q9JJN2 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
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