Protein–RNA interactions for Protein: A2AVA0

Svep1, Sushi, von Willebrand factor type A, EGF and pentraxin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Svep1A2AVA0 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
Svep1A2AVA0 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Svep1A2AVA0 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Svep1A2AVA0 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Svep1A2AVA0 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Svep1A2AVA0 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Svep1A2AVA0 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Svep1A2AVA0 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Svep1A2AVA0 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Svep1A2AVA0 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Svep1A2AVA0 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Svep1A2AVA0 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Svep1A2AVA0 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Svep1A2AVA0 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Svep1A2AVA0 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Svep1A2AVA0 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Svep1A2AVA0 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Svep1A2AVA0 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Svep1A2AVA0 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Svep1A2AVA0 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Svep1A2AVA0 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Svep1A2AVA0 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Svep1A2AVA0 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Svep1A2AVA0 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Svep1A2AVA0 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Svep1A2AVA0 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Svep1A2AVA0 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Svep1A2AVA0 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Svep1A2AVA0 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Svep1A2AVA0 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Svep1A2AVA0 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Svep1A2AVA0 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Svep1A2AVA0 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Svep1A2AVA0 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Svep1A2AVA0 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Svep1A2AVA0 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Svep1A2AVA0 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Svep1A2AVA0 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Svep1A2AVA0 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Svep1A2AVA0 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Svep1A2AVA0 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Svep1A2AVA0 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Svep1A2AVA0 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Svep1A2AVA0 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Svep1A2AVA0 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Svep1A2AVA0 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Svep1A2AVA0 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Svep1A2AVA0 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Svep1A2AVA0 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Svep1A2AVA0 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Svep1A2AVA0 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Svep1A2AVA0 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Svep1A2AVA0 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Svep1A2AVA0 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Svep1A2AVA0 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Svep1A2AVA0 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Svep1A2AVA0 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Svep1A2AVA0 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Svep1A2AVA0 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Svep1A2AVA0 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Svep1A2AVA0 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Svep1A2AVA0 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Svep1A2AVA0 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Svep1A2AVA0 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Svep1A2AVA0 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Svep1A2AVA0 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Svep1A2AVA0 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Svep1A2AVA0 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Svep1A2AVA0 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Svep1A2AVA0 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Svep1A2AVA0 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Svep1A2AVA0 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Svep1A2AVA0 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Svep1A2AVA0 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Svep1A2AVA0 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Svep1A2AVA0 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Svep1A2AVA0 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Svep1A2AVA0 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Svep1A2AVA0 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Svep1A2AVA0 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Svep1A2AVA0 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Svep1A2AVA0 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Svep1A2AVA0 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Svep1A2AVA0 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Svep1A2AVA0 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Svep1A2AVA0 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Svep1A2AVA0 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Svep1A2AVA0 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Svep1A2AVA0 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Svep1A2AVA0 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Svep1A2AVA0 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Svep1A2AVA0 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Svep1A2AVA0 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Svep1A2AVA0 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Svep1A2AVA0 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Svep1A2AVA0 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Svep1A2AVA0 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Svep1A2AVA0 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Svep1A2AVA0 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Svep1A2AVA0 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms