RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000171735.1

Nisch-221, Transcript of Nischarin, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Nisch, Length 1,763 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nisch-221ENSMUST00000171735 Sec11aQ9R0P6 179 aa11.85□□□□□ -0.51
Nisch-221ENSMUST00000171735 Ighv6-7A0A0A6YWU3 119 aa11.84□□□□□ -0.51
Nisch-221ENSMUST00000171735 P18527 97 aa11.84□□□□□ -0.51
Nisch-221ENSMUST00000171735 Ndufs7Q9DC70 224 aa11.84□□□□□ -0.51
Nisch-221ENSMUST00000171735 AponG3X9D6 251 aa11.84□□□□□ -0.51
Nisch-221ENSMUST00000171735 Rpl39P62892 51 aa11.84□□□□□ -0.51
Nisch-221ENSMUST00000171735 Gnb1lQ9EQ15 326 aa11.84□□□□□ -0.51
Nisch-221ENSMUST00000171735 Higd2aQ9CQJ1 106 aa11.83□□□□□ -0.52
Nisch-221ENSMUST00000171735 PrkdcP97313 4128 aa11.83□□□□□ -0.52
Nisch-221ENSMUST00000171735 F11rO88792 300 aa11.82□□□□□ -0.52
Nisch-221ENSMUST00000171735 Ss18Q62280 418 aa11.82□□□□□ -0.52
Nisch-221ENSMUST00000171735 Ammecr1lQ8JZZ6 310 aa11.82□□□□□ -0.52
Nisch-221ENSMUST00000171735 Cysltr1Q99JA4 352 aa11.82□□□□□ -0.52
Nisch-221ENSMUST00000171735 Gm7257D3YX25 99 aa11.82□□□□□ -0.52
Nisch-221ENSMUST00000171735 Gata1P17679 413 aa11.82□□□□□ -0.52
Nisch-221ENSMUST00000171735 Hnrnpa3Q8BG05 379 aaKnown RBP11.82□□□□□ -0.52
Nisch-221ENSMUST00000171735 Snx22Q8C084 192 aa11.82□□□□□ -0.52
Nisch-221ENSMUST00000171735 Dad1P61804 113 aa11.81□□□□□ -0.52
Nisch-221ENSMUST00000171735 Ndufa3Q9CQ91 84 aa11.81□□□□□ -0.52
Nisch-221ENSMUST00000171735 Huwe1Q7TMY8 4377 aaKnown RBP11.8□□□□□ -0.52
Nisch-221ENSMUST00000171735 Trdv5A0A075B661 115 aa11.8□□□□□ -0.52
Nisch-221ENSMUST00000171735 Mustn1Q99JI1 82 aa11.8□□□□□ -0.52
Nisch-221ENSMUST00000171735 Atp5lQ9CPQ8 103 aa11.8□□□□□ -0.52
Nisch-221ENSMUST00000171735 P01837 106 aa11.79□□□□□ -0.52
Nisch-221ENSMUST00000171735 FcorP0DJI6 106 aa11.79□□□□□ -0.52
Nisch-221ENSMUST00000171735 Defa22Q8C1N8 93 aa11.79□□□□□ -0.52
Nisch-221ENSMUST00000171735 Higd1aQ9JLR9 95 aa11.79□□□□□ -0.52
Nisch-221ENSMUST00000171735 Tcrg-C1A0A075B5Z0 172 aa11.79□□□□□ -0.52
Nisch-221ENSMUST00000171735 Defa30E9QPZ2 93 aa11.79□□□□□ -0.52
Nisch-221ENSMUST00000171735 Tcrg-C3L7N479 172 aa11.79□□□□□ -0.52
Nisch-221ENSMUST00000171735 P01811 117 aa11.79□□□□□ -0.52
Nisch-221ENSMUST00000171735 P03985 172 aa11.79□□□□□ -0.52
Nisch-221ENSMUST00000171735 Fgf6P21658 208 aa11.79□□□□□ -0.52
Nisch-221ENSMUST00000171735 Eif4ebp1Q60876 117 aa11.79□□□□□ -0.52
Nisch-221ENSMUST00000171735 Vmn1r197Q8R265 298 aa11.79□□□□□ -0.52
Nisch-221ENSMUST00000171735 Brd3osA0A1B0GRB6 84 aa11.78□□□□□ -0.52
Nisch-221ENSMUST00000171735 Fam240aJ3QNP9 97 aa11.78□□□□□ -0.52
Nisch-221ENSMUST00000171735 Q5BN45 167 aa11.78□□□□□ -0.52
Nisch-221ENSMUST00000171735 Gm17472A0A075B683 117 aa11.77□□□□□ -0.52
Nisch-221ENSMUST00000171735 Ighv2-6-8A0A0A6YWY9 116 aa11.77□□□□□ -0.52
Nisch-221ENSMUST00000171735 Q9D727 114 aa11.77□□□□□ -0.52
Nisch-221ENSMUST00000171735 Igkv4-91A0A075B5L2 119 aa11.77□□□□□ -0.53
Nisch-221ENSMUST00000171735 Gm21693J3QK27 380 aa11.77□□□□□ -0.53
Nisch-221ENSMUST00000171735 Klk9Q32M27 251 aa11.77□□□□□ -0.53
Nisch-221ENSMUST00000171735 Igkv4-54A0A0G2JES9 117 aa11.76□□□□□ -0.53
Nisch-221ENSMUST00000171735 Trav13n-1A0A0G2JEU8 110 aa11.76□□□□□ -0.53
Nisch-221ENSMUST00000171735 Defa6P50704 93 aa11.76□□□□□ -0.53
Nisch-221ENSMUST00000171735 Tal2Q62282 108 aa11.76□□□□□ -0.53
Nisch-221ENSMUST00000171735 P84751 237 aa11.75□□□□□ -0.53
Nisch-221ENSMUST00000171735 Pradc1Q9D9N8 188 aa11.75□□□□□ -0.53
Nisch-221ENSMUST00000171735 Smim13E9Q942 88 aa11.74□□□□□ -0.53
Nisch-221ENSMUST00000171735 Atp5g3P56384 141 aa11.74□□□□□ -0.53
Nisch-221ENSMUST00000171735 Cks1brtQ3UNC9 96 aa11.74□□□□□ -0.53
Nisch-221ENSMUST00000171735 Gm1553Q66VB7 94 aa11.74□□□□□ -0.53
Nisch-221ENSMUST00000171735 Atp5g1Q9CR84 136 aa11.74□□□□□ -0.53
Nisch-221ENSMUST00000171735 Phlda3Q9WV95 125 aa11.74□□□□□ -0.53
Nisch-221ENSMUST00000171735 S100a8P27005 89 aa11.74□□□□□ -0.53
Nisch-221ENSMUST00000171735 Stab2Q8R4U0 2559 aa11.73□□□□□ -0.53
Nisch-221ENSMUST00000171735 Ighv1-11A0A0A6YWI9 117 aa11.73□□□□□ -0.53
Nisch-221ENSMUST00000171735 Igkv2-137A0A0B4J1H6 120 aa11.73□□□□□ -0.53
Nisch-221ENSMUST00000171735 Gm9887F6RFI0 207 aa11.73□□□□□ -0.53
Nisch-221ENSMUST00000171735 Smim1P0C8K7 78 aa11.73□□□□□ -0.53
Nisch-221ENSMUST00000171735 Gm10295Q8CCF3 114 aa11.73□□□□□ -0.53
Nisch-221ENSMUST00000171735 Tmem97Q8VD00 176 aa11.73□□□□□ -0.53
Nisch-221ENSMUST00000171735 Gpha2Q925Q5 128 aa11.73□□□□□ -0.53
Nisch-221ENSMUST00000171735 Erg28Q9ERY9 140 aa11.73□□□□□ -0.53
Nisch-221ENSMUST00000171735 Ighv1-59A0A0A6YXE0 117 aa11.72□□□□□ -0.53
Nisch-221ENSMUST00000171735 Gm9508A0A1W2P7W0 230 aa11.72□□□□□ -0.53
Nisch-221ENSMUST00000171735 BC107364E9Q5A2 140 aa11.72□□□□□ -0.53
Nisch-221ENSMUST00000171735 OdaphJ3QNT8 126 aa11.72□□□□□ -0.53
Nisch-221ENSMUST00000171735 Gm10251J3QPM5 127 aa11.72□□□□□ -0.53
Nisch-221ENSMUST00000171735 PpdpfQ9CR37 115 aa11.72□□□□□ -0.53
Nisch-221ENSMUST00000171735 Gm17509Q9CZ61 145 aa11.72□□□□□ -0.53
Nisch-221ENSMUST00000171735 Gm16181B0V2H2 73 aa11.72□□□□□ -0.53
Nisch-221ENSMUST00000171735 Vamp8O70404 101 aa11.72□□□□□ -0.53
Nisch-221ENSMUST00000171735 Ppp1r32Q148A4 427 aa11.72□□□□□ -0.53
Nisch-221ENSMUST00000171735 Fam19a4Q7TPG5 135 aa11.72□□□□□ -0.53
Nisch-221ENSMUST00000171735 Trav4n-4A0A075B615 110 aa11.71□□□□□ -0.54
Nisch-221ENSMUST00000171735 Nat8b-psE0CYC6 232 aa11.71□□□□□ -0.54
Nisch-221ENSMUST00000171735 Gm10322F7D7I4 111 aa11.71□□□□□ -0.54
Nisch-221ENSMUST00000171735 Rpl36aP83882 106 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.54
Nisch-221ENSMUST00000171735 Zc2hc1bQ9D534 172 aa11.71□□□□□ -0.54
Nisch-221ENSMUST00000171735 Igkv4-72A0A0B4J1I4 117 aa11.7□□□□□ -0.54
Nisch-221ENSMUST00000171735 Ighv1-72P01751 139 aa11.7□□□□□ -0.54
Nisch-221ENSMUST00000171735 Ube2v1Q9CZY3 147 aa11.7□□□□□ -0.54
Nisch-221ENSMUST00000171735 Plac1Q9JI83 173 aa11.7□□□□□ -0.54
Nisch-221ENSMUST00000171735 LeprotO89013 131 aa11.69□□□□□ -0.54
Nisch-221ENSMUST00000171735 Ankrd39Q9D2X0 183 aa11.69□□□□□ -0.54
Nisch-221ENSMUST00000171735 CirbpP60824 172 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
Nisch-221ENSMUST00000171735 Foxi2Q3I5G5 311 aa11.69□□□□□ -0.54
Nisch-221ENSMUST00000171735 Gm904Q3V2L5 102 aa11.69□□□□□ -0.54
Nisch-221ENSMUST00000171735 BC106179Q8C9L1 186 aa11.69□□□□□ -0.54
Nisch-221ENSMUST00000171735 Tm4sf20Q9CQY8 226 aa11.69□□□□□ -0.54
Nisch-221ENSMUST00000171735 3110070M22RikQ9DAQ7 118 aa11.69□□□□□ -0.54
Nisch-221ENSMUST00000171735 Dnah17Q69Z23 4481 aa11.69□□□□□ -0.54
Nisch-221ENSMUST00000171735 Gm10647E9Q8X0 124 aa11.68□□□□□ -0.54
Nisch-221ENSMUST00000171735 AW011738F6S7Q2 159 aa11.68□□□□□ -0.54
Nisch-221ENSMUST00000171735 Gm28044L7N1X0 119 aa11.68□□□□□ -0.54
Nisch-221ENSMUST00000171735 Trav8-1A0A075B641 109 aa11.67□□□□□ -0.54
Nisch-221ENSMUST00000171735 G0s2Q61585 103 aa11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 47.4 ms