Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY8

Tm4sf20, Transmembrane 4 L6 family member 20, mousemouse

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Length 226 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm4sf20Q9CQY8 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Tm4sf20Q9CQY8 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tm4sf20Q9CQY8 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tm4sf20Q9CQY8 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tm4sf20Q9CQY8 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tm4sf20Q9CQY8 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tm4sf20Q9CQY8 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Tm4sf20Q9CQY8 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tm4sf20Q9CQY8 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tm4sf20Q9CQY8 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Tm4sf20Q9CQY8 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tm4sf20Q9CQY8 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tm4sf20Q9CQY8 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tm4sf20Q9CQY8 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tm4sf20Q9CQY8 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tm4sf20Q9CQY8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tm4sf20Q9CQY8 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tm4sf20Q9CQY8 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tm4sf20Q9CQY8 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tm4sf20Q9CQY8 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tm4sf20Q9CQY8 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tm4sf20Q9CQY8 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tm4sf20Q9CQY8 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tm4sf20Q9CQY8 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tm4sf20Q9CQY8 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Tm4sf20Q9CQY8 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tm4sf20Q9CQY8 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tm4sf20Q9CQY8 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Tm4sf20Q9CQY8 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tm4sf20Q9CQY8 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tm4sf20Q9CQY8 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Tm4sf20Q9CQY8 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Tm4sf20Q9CQY8 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tm4sf20Q9CQY8 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tm4sf20Q9CQY8 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tm4sf20Q9CQY8 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tm4sf20Q9CQY8 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tm4sf20Q9CQY8 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tm4sf20Q9CQY8 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tm4sf20Q9CQY8 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tm4sf20Q9CQY8 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tm4sf20Q9CQY8 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tm4sf20Q9CQY8 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tm4sf20Q9CQY8 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tm4sf20Q9CQY8 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Tm4sf20Q9CQY8 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tm4sf20Q9CQY8 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tm4sf20Q9CQY8 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tm4sf20Q9CQY8 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Tm4sf20Q9CQY8 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tm4sf20Q9CQY8 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tm4sf20Q9CQY8 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tm4sf20Q9CQY8 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tm4sf20Q9CQY8 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tm4sf20Q9CQY8 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tm4sf20Q9CQY8 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tm4sf20Q9CQY8 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tm4sf20Q9CQY8 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tm4sf20Q9CQY8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tm4sf20Q9CQY8 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tm4sf20Q9CQY8 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tm4sf20Q9CQY8 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tm4sf20Q9CQY8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tm4sf20Q9CQY8 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tm4sf20Q9CQY8 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tm4sf20Q9CQY8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tm4sf20Q9CQY8 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tm4sf20Q9CQY8 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tm4sf20Q9CQY8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Tm4sf20Q9CQY8 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tm4sf20Q9CQY8 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tm4sf20Q9CQY8 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tm4sf20Q9CQY8 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Tm4sf20Q9CQY8 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tm4sf20Q9CQY8 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Tm4sf20Q9CQY8 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tm4sf20Q9CQY8 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tm4sf20Q9CQY8 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tm4sf20Q9CQY8 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tm4sf20Q9CQY8 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tm4sf20Q9CQY8 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tm4sf20Q9CQY8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tm4sf20Q9CQY8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Tm4sf20Q9CQY8 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tm4sf20Q9CQY8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tm4sf20Q9CQY8 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tm4sf20Q9CQY8 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tm4sf20Q9CQY8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tm4sf20Q9CQY8 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tm4sf20Q9CQY8 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tm4sf20Q9CQY8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tm4sf20Q9CQY8 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tm4sf20Q9CQY8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tm4sf20Q9CQY8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tm4sf20Q9CQY8 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tm4sf20Q9CQY8 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tm4sf20Q9CQY8 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tm4sf20Q9CQY8 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tm4sf20Q9CQY8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tm4sf20Q9CQY8 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
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