Protein–RNA interactions for Protein: P50704

Defa6, Alpha-defensin 6/12, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa6P50704 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Defa6P50704 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Defa6P50704 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Defa6P50704 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Defa6P50704 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Defa6P50704 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Defa6P50704 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Defa6P50704 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Defa6P50704 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Defa6P50704 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Defa6P50704 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Defa6P50704 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Defa6P50704 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Defa6P50704 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Defa6P50704 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Defa6P50704 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Defa6P50704 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Defa6P50704 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Defa6P50704 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Defa6P50704 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Defa6P50704 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Defa6P50704 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Defa6P50704 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Defa6P50704 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Defa6P50704 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Defa6P50704 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Defa6P50704 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Defa6P50704 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Defa6P50704 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Defa6P50704 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Defa6P50704 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Defa6P50704 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Defa6P50704 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Defa6P50704 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Defa6P50704 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Defa6P50704 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Defa6P50704 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Defa6P50704 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Defa6P50704 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Defa6P50704 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Defa6P50704 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Defa6P50704 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Defa6P50704 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Defa6P50704 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Defa6P50704 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Defa6P50704 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Defa6P50704 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Defa6P50704 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Defa6P50704 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Defa6P50704 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Defa6P50704 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Defa6P50704 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Defa6P50704 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Defa6P50704 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Defa6P50704 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Defa6P50704 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Defa6P50704 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Defa6P50704 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Defa6P50704 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Defa6P50704 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Defa6P50704 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Defa6P50704 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Defa6P50704 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Defa6P50704 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Defa6P50704 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Defa6P50704 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Defa6P50704 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Defa6P50704 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Defa6P50704 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Defa6P50704 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Defa6P50704 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Defa6P50704 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Defa6P50704 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Defa6P50704 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Defa6P50704 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Defa6P50704 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Defa6P50704 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Defa6P50704 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Defa6P50704 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Defa6P50704 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Defa6P50704 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Defa6P50704 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Defa6P50704 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Defa6P50704 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Defa6P50704 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Defa6P50704 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Defa6P50704 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Defa6P50704 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Defa6P50704 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Defa6P50704 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Defa6P50704 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Defa6P50704 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Defa6P50704 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Defa6P50704 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Defa6P50704 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Defa6P50704 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Defa6P50704 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Defa6P50704 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Defa6P50704 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Defa6P50704 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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