RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000171735.1

Nisch-221, Transcript of Nischarin, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Nisch, Length 1,763 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nisch-221ENSMUST00000171735 Chac1Q8R3J5 223 aa12.04□□□□□ -0.48
Nisch-221ENSMUST00000171735 Rpl36-ps4A0A140T8U4 117 aa12.03□□□□□ -0.48
Nisch-221ENSMUST00000171735 SstP60041 116 aa12.03□□□□□ -0.48
Nisch-221ENSMUST00000171735 Gm16223Q8CBM3 117 aa12.03□□□□□ -0.48
Nisch-221ENSMUST00000171735 Josd1Q9DBJ6 202 aa12.03□□□□□ -0.48
Nisch-221ENSMUST00000171735 Ighv8-8A0A0A6YXQ0 119 aa12.02□□□□□ -0.48
Nisch-221ENSMUST00000171735 Emp2O88662 172 aa12.02□□□□□ -0.48
Nisch-221ENSMUST00000171735 Csn3P06796 181 aa12.02□□□□□ -0.48
Nisch-221ENSMUST00000171735 Gm21748Q3UE70 102 aa12.02□□□□□ -0.48
Nisch-221ENSMUST00000171735 BC048562Q80ZQ7 204 aa12.02□□□□□ -0.48
Nisch-221ENSMUST00000171735 FasnP19096 2504 aaKnown RBP12.02□□□□□ -0.49
Nisch-221ENSMUST00000171735 Igkv4-68A0A0B4J1I7 117 aa12.02□□□□□ -0.49
Nisch-221ENSMUST00000171735 A0A286YCQ8 80 aa12.02□□□□□ -0.49
Nisch-221ENSMUST00000171735 Gm10271F6WY25 52 aa12.02□□□□□ -0.49
Nisch-221ENSMUST00000171735 P0C913 63 aa12.02□□□□□ -0.49
Nisch-221ENSMUST00000171735 AamdcQ8R0P4 122 aa12.02□□□□□ -0.49
Nisch-221ENSMUST00000171735 Ifi27l2aQ8R412 90 aa12.02□□□□□ -0.49
Nisch-221ENSMUST00000171735 Tctex1d2Q9CQ66 144 aa12.02□□□□□ -0.49
Nisch-221ENSMUST00000171735 Trdv2-1A0A0G2JGB9 116 aa12.01□□□□□ -0.49
Nisch-221ENSMUST00000171735 Trappc1Q5NCF2 145 aa12.01□□□□□ -0.49
Nisch-221ENSMUST00000171735 Ndufc2Q9CQ54 120 aa12.01□□□□□ -0.49
Nisch-221ENSMUST00000171735 PmvkQ9D1G2 192 aa12.01□□□□□ -0.49
Nisch-221ENSMUST00000171735 Polr2kQ63871 58 aa12□□□□□ -0.49
Nisch-221ENSMUST00000171735 Dand5Q76LW6 185 aa12□□□□□ -0.49
Nisch-221ENSMUST00000171735 Foxi1Q922I5 372 aa12□□□□□ -0.49
Nisch-221ENSMUST00000171735 Gm5629P06327 117 aa12□□□□□ -0.49
Nisch-221ENSMUST00000171735 Gm6040Q4QY32 63 aa12□□□□□ -0.49
Nisch-221ENSMUST00000171735 Ighv8-12A0A0G2JDE1 119 aa11.99□□□□□ -0.49
Nisch-221ENSMUST00000171735 Ovol2Q8CIV7 274 aa11.99□□□□□ -0.49
Nisch-221ENSMUST00000171735 Nat8f4G5E8L3 226 aa11.98□□□□□ -0.49
Nisch-221ENSMUST00000171735 P06329 120 aa11.98□□□□□ -0.49
Nisch-221ENSMUST00000171735 8030423J24RikQ9CX45 142 aa11.98□□□□□ -0.49
Nisch-221ENSMUST00000171735 D730001G18RikA0A087WQU7 115 aa11.97□□□□□ -0.49
Nisch-221ENSMUST00000171735 Ceacam15A0A0B4J1L0 234 aa11.97□□□□□ -0.49
Nisch-221ENSMUST00000171735 Prss29Q99MS4 279 aa11.97□□□□□ -0.49
Nisch-221ENSMUST00000171735 Ighv1-5A0A0A6YWG2 117 aa11.97□□□□□ -0.49
Nisch-221ENSMUST00000171735 Gm17359A0A0G2JEB7 487 aa11.97□□□□□ -0.49
Nisch-221ENSMUST00000171735 Gm10490F6VBM2 120 aa11.97□□□□□ -0.49
Nisch-221ENSMUST00000171735 P01738 130 aa11.97□□□□□ -0.49
Nisch-221ENSMUST00000171735 Morn3Q8C5T4 241 aa11.97□□□□□ -0.49
Nisch-221ENSMUST00000171735 Tspo2Q9CRZ8 162 aa11.97□□□□□ -0.49
Nisch-221ENSMUST00000171735 Lyzl4Q9D925 145 aa11.97□□□□□ -0.49
Nisch-221ENSMUST00000171735 Ighv1-85A0A075B5Y6 117 aa11.96□□□□□ -0.49
Nisch-221ENSMUST00000171735 Cox17P56394 63 aa11.96□□□□□ -0.49
Nisch-221ENSMUST00000171735 Trav7d-3Q5R1I1 112 aa11.96□□□□□ -0.49
Nisch-221ENSMUST00000171735 Q99M08 65 aa11.95□□□□□ -0.5
Nisch-221ENSMUST00000171735 MrapQ9D159 127 aa11.95□□□□□ -0.5
Nisch-221ENSMUST00000171735 Defa35E9QLQ1 93 aa11.95□□□□□ -0.5
Nisch-221ENSMUST00000171735 CrxO54751 299 aa11.95□□□□□ -0.5
Nisch-221ENSMUST00000171735 Htr1dQ61224 374 aa11.95□□□□□ -0.5
Nisch-221ENSMUST00000171735 Gm14137Q8CE97 175 aa11.95□□□□□ -0.5
Nisch-221ENSMUST00000171735 Trav13d-1A0A075B606 110 aa11.94□□□□□ -0.5
Nisch-221ENSMUST00000171735 Gm10509O88255 85 aa11.94□□□□□ -0.5
Nisch-221ENSMUST00000171735 Fxyd5P97808 178 aa11.94□□□□□ -0.5
Nisch-221ENSMUST00000171735 Isg15Q64339 161 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
Nisch-221ENSMUST00000171735 Trbv13-1A0A0B4J1P8 112 aa11.93□□□□□ -0.5
Nisch-221ENSMUST00000171735 P01745 121 aa11.93□□□□□ -0.5
Nisch-221ENSMUST00000171735 BC025920Q3US60 128 aa11.93□□□□□ -0.5
Nisch-221ENSMUST00000171735 Gm10604Q3V0X7 143 aa11.93□□□□□ -0.5
Nisch-221ENSMUST00000171735 Spag11Q8K4N2 71 aa11.93□□□□□ -0.5
Nisch-221ENSMUST00000171735 Leap2Q91V13 76 aa11.93□□□□□ -0.5
Nisch-221ENSMUST00000171735 Tmem263Q9DAM7 115 aa11.93□□□□□ -0.5
Nisch-221ENSMUST00000171735 TcraP01849 138 aa11.92□□□□□ -0.5
Nisch-221ENSMUST00000171735 Ca1P13634 261 aa11.92□□□□□ -0.5
Nisch-221ENSMUST00000171735 Trav9n-2A0A0G2JDP3 113 aa11.92□□□□□ -0.5
Nisch-221ENSMUST00000171735 NpsP0C0P8 89 aa11.92□□□□□ -0.5
Nisch-221ENSMUST00000171735 Gpx1P11352 201 aa11.92□□□□□ -0.5
Nisch-221ENSMUST00000171735 Mllt11P97783 90 aa11.92□□□□□ -0.5
Nisch-221ENSMUST00000171735 Pmis2Q497Q9 96 aa11.92□□□□□ -0.5
Nisch-221ENSMUST00000171735 Slc25a20Q9Z2Z6 301 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
Nisch-221ENSMUST00000171735 B230217C12RikE9Q3Z1 139 aa11.91□□□□□ -0.5
Nisch-221ENSMUST00000171735 Fgfbp3Q1HCM0 245 aa11.91□□□□□ -0.5
Nisch-221ENSMUST00000171735 4930596D02RikQ3V0H9 216 aa11.91□□□□□ -0.5
Nisch-221ENSMUST00000171735 Nop10Q9CQS2 64 aa11.91□□□□□ -0.5
Nisch-221ENSMUST00000171735 P01794 123 aa11.9□□□□□ -0.5
Nisch-221ENSMUST00000171735 Sslp1Q3UN54 99 aa11.9□□□□□ -0.5
Nisch-221ENSMUST00000171735 Trav7-2Q5R1I3 112 aa11.9□□□□□ -0.5
Nisch-221ENSMUST00000171735 March3Q8BRX9 218 aa11.9□□□□□ -0.51
Nisch-221ENSMUST00000171735 Gm16442D3YZG3 307 aa11.89□□□□□ -0.51
Nisch-221ENSMUST00000171735 TtrP07309 147 aa11.89□□□□□ -0.51
Nisch-221ENSMUST00000171735 Bud31Q6PGH1 103 aa11.89□□□□□ -0.51
Nisch-221ENSMUST00000171735 Tax1bp3Q9DBG9 124 aa11.89□□□□□ -0.51
Nisch-221ENSMUST00000171735 EsdQ9R0P3 282 aa11.89□□□□□ -0.51
Nisch-221ENSMUST00000171735 Q9DAA3 117 aa11.88□□□□□ -0.51
Nisch-221ENSMUST00000171735 Tex48Q9DA81 110 aa11.87□□□□□ -0.51
Nisch-221ENSMUST00000171735 Foxc1Q61572 553 aa11.87□□□□□ -0.51
Nisch-221ENSMUST00000171735 A530064D06RikQ8BNV8 229 aa11.87□□□□□ -0.51
Nisch-221ENSMUST00000171735 Ifitm1Q9D103 106 aa11.87□□□□□ -0.51
Nisch-221ENSMUST00000171735 HampQ9EQ21 83 aa11.87□□□□□ -0.51
Nisch-221ENSMUST00000171735 CtrlQ9ER05 264 aa11.87□□□□□ -0.51
Nisch-221ENSMUST00000171735 Dnah3Q8BW94 4083 aa11.86□□□□□ -0.51
Nisch-221ENSMUST00000171735 Csmd3Q80T79 3707 aa11.86□□□□□ -0.51
Nisch-221ENSMUST00000171735 Gm45521A0A1B0GRK0 198 aa11.86□□□□□ -0.51
Nisch-221ENSMUST00000171735 Ndufa1O35683 70 aa11.86□□□□□ -0.51
Nisch-221ENSMUST00000171735 Chchd7Q8K2Q5 85 aa11.86□□□□□ -0.51
Nisch-221ENSMUST00000171735 Timm17aQ9Z0V8 171 aa11.86□□□□□ -0.51
Nisch-221ENSMUST00000171735 Hbb-bsA8DUK4 147 aa11.85□□□□□ -0.51
Nisch-221ENSMUST00000171735 Hbb-b1P02088 147 aa11.85□□□□□ -0.51
Nisch-221ENSMUST00000171735 Tmem170bP86050 132 aa11.85□□□□□ -0.51
Nisch-221ENSMUST00000171735 Clec4b2Q67DU8 208 aa11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 50.2 ms