Protein–RNA interactions for Protein: Q67DU8

Clec4b2, Antigen presenting cell lectin-like receptor A1, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec4b2Q67DU8 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Clec4b2Q67DU8 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Clec4b2Q67DU8 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Clec4b2Q67DU8 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Clec4b2Q67DU8 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Clec4b2Q67DU8 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Clec4b2Q67DU8 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Clec4b2Q67DU8 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Clec4b2Q67DU8 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Clec4b2Q67DU8 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Clec4b2Q67DU8 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clec4b2Q67DU8 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clec4b2Q67DU8 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clec4b2Q67DU8 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clec4b2Q67DU8 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clec4b2Q67DU8 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clec4b2Q67DU8 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clec4b2Q67DU8 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Clec4b2Q67DU8 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clec4b2Q67DU8 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clec4b2Q67DU8 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clec4b2Q67DU8 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Clec4b2Q67DU8 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Clec4b2Q67DU8 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clec4b2Q67DU8 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clec4b2Q67DU8 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Clec4b2Q67DU8 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Clec4b2Q67DU8 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Clec4b2Q67DU8 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Clec4b2Q67DU8 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clec4b2Q67DU8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clec4b2Q67DU8 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clec4b2Q67DU8 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Clec4b2Q67DU8 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Clec4b2Q67DU8 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clec4b2Q67DU8 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Clec4b2Q67DU8 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Clec4b2Q67DU8 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Clec4b2Q67DU8 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Clec4b2Q67DU8 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Clec4b2Q67DU8 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Clec4b2Q67DU8 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Clec4b2Q67DU8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Clec4b2Q67DU8 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Clec4b2Q67DU8 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Clec4b2Q67DU8 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Clec4b2Q67DU8 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Clec4b2Q67DU8 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Clec4b2Q67DU8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Clec4b2Q67DU8 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Clec4b2Q67DU8 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Clec4b2Q67DU8 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Clec4b2Q67DU8 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Clec4b2Q67DU8 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Clec4b2Q67DU8 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Clec4b2Q67DU8 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Clec4b2Q67DU8 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Clec4b2Q67DU8 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Clec4b2Q67DU8 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Clec4b2Q67DU8 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Clec4b2Q67DU8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Clec4b2Q67DU8 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Clec4b2Q67DU8 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Clec4b2Q67DU8 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Clec4b2Q67DU8 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Clec4b2Q67DU8 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Clec4b2Q67DU8 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Clec4b2Q67DU8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Clec4b2Q67DU8 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Clec4b2Q67DU8 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Clec4b2Q67DU8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Clec4b2Q67DU8 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clec4b2Q67DU8 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clec4b2Q67DU8 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Clec4b2Q67DU8 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Clec4b2Q67DU8 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clec4b2Q67DU8 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Clec4b2Q67DU8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Clec4b2Q67DU8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Clec4b2Q67DU8 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Clec4b2Q67DU8 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Clec4b2Q67DU8 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Clec4b2Q67DU8 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Clec4b2Q67DU8 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Clec4b2Q67DU8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Clec4b2Q67DU8 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clec4b2Q67DU8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clec4b2Q67DU8 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clec4b2Q67DU8 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clec4b2Q67DU8 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clec4b2Q67DU8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Clec4b2Q67DU8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Clec4b2Q67DU8 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Clec4b2Q67DU8 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Clec4b2Q67DU8 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Clec4b2Q67DU8 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Clec4b2Q67DU8 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Clec4b2Q67DU8 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Clec4b2Q67DU8 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Clec4b2Q67DU8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 129.4 ms