Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0V8

Timm17a, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim17-A, mousemouse

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timm17aQ9Z0V8 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Timm17aQ9Z0V8 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Timm17aQ9Z0V8 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Timm17aQ9Z0V8 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Timm17aQ9Z0V8 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Timm17aQ9Z0V8 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Timm17aQ9Z0V8 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Timm17aQ9Z0V8 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Timm17aQ9Z0V8 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Timm17aQ9Z0V8 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Timm17aQ9Z0V8 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Timm17aQ9Z0V8 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Timm17aQ9Z0V8 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Timm17aQ9Z0V8 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Timm17aQ9Z0V8 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Timm17aQ9Z0V8 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Timm17aQ9Z0V8 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Timm17aQ9Z0V8 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Timm17aQ9Z0V8 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Timm17aQ9Z0V8 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Timm17aQ9Z0V8 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Timm17aQ9Z0V8 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Timm17aQ9Z0V8 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Timm17aQ9Z0V8 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Timm17aQ9Z0V8 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Timm17aQ9Z0V8 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Timm17aQ9Z0V8 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Timm17aQ9Z0V8 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Timm17aQ9Z0V8 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Timm17aQ9Z0V8 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Timm17aQ9Z0V8 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Timm17aQ9Z0V8 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Timm17aQ9Z0V8 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Timm17aQ9Z0V8 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Timm17aQ9Z0V8 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Timm17aQ9Z0V8 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Timm17aQ9Z0V8 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Timm17aQ9Z0V8 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Timm17aQ9Z0V8 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Timm17aQ9Z0V8 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Timm17aQ9Z0V8 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Timm17aQ9Z0V8 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Timm17aQ9Z0V8 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Timm17aQ9Z0V8 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Timm17aQ9Z0V8 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Timm17aQ9Z0V8 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Timm17aQ9Z0V8 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Timm17aQ9Z0V8 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Timm17aQ9Z0V8 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Timm17aQ9Z0V8 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Timm17aQ9Z0V8 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Timm17aQ9Z0V8 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Timm17aQ9Z0V8 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Timm17aQ9Z0V8 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Timm17aQ9Z0V8 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Timm17aQ9Z0V8 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Timm17aQ9Z0V8 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Timm17aQ9Z0V8 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Timm17aQ9Z0V8 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Timm17aQ9Z0V8 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Timm17aQ9Z0V8 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Timm17aQ9Z0V8 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Timm17aQ9Z0V8 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Timm17aQ9Z0V8 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Timm17aQ9Z0V8 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Timm17aQ9Z0V8 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Timm17aQ9Z0V8 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Timm17aQ9Z0V8 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Timm17aQ9Z0V8 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Timm17aQ9Z0V8 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Timm17aQ9Z0V8 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Timm17aQ9Z0V8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Timm17aQ9Z0V8 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Timm17aQ9Z0V8 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Timm17aQ9Z0V8 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Timm17aQ9Z0V8 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Timm17aQ9Z0V8 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Timm17aQ9Z0V8 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Timm17aQ9Z0V8 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Timm17aQ9Z0V8 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Timm17aQ9Z0V8 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Timm17aQ9Z0V8 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Timm17aQ9Z0V8 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Timm17aQ9Z0V8 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Timm17aQ9Z0V8 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Timm17aQ9Z0V8 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Timm17aQ9Z0V8 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Timm17aQ9Z0V8 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Timm17aQ9Z0V8 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Timm17aQ9Z0V8 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Timm17aQ9Z0V8 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Timm17aQ9Z0V8 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Timm17aQ9Z0V8 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Timm17aQ9Z0V8 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Timm17aQ9Z0V8 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Timm17aQ9Z0V8 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Timm17aQ9Z0V8 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Timm17aQ9Z0V8 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Timm17aQ9Z0V8 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Timm17aQ9Z0V8 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.1 ms