Protein–RNA interactions for Protein: G5E8L3

Nat8f4, MCG128680, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nat8f4G5E8L3 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nat8f4G5E8L3 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nat8f4G5E8L3 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Nat8f4G5E8L3 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nat8f4G5E8L3 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nat8f4G5E8L3 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nat8f4G5E8L3 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Nat8f4G5E8L3 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nat8f4G5E8L3 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nat8f4G5E8L3 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nat8f4G5E8L3 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nat8f4G5E8L3 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nat8f4G5E8L3 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nat8f4G5E8L3 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nat8f4G5E8L3 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nat8f4G5E8L3 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nat8f4G5E8L3 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nat8f4G5E8L3 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nat8f4G5E8L3 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nat8f4G5E8L3 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nat8f4G5E8L3 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nat8f4G5E8L3 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nat8f4G5E8L3 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nat8f4G5E8L3 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Nat8f4G5E8L3 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nat8f4G5E8L3 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Nat8f4G5E8L3 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nat8f4G5E8L3 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nat8f4G5E8L3 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Nat8f4G5E8L3 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nat8f4G5E8L3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nat8f4G5E8L3 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nat8f4G5E8L3 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nat8f4G5E8L3 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nat8f4G5E8L3 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nat8f4G5E8L3 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Nat8f4G5E8L3 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nat8f4G5E8L3 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nat8f4G5E8L3 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nat8f4G5E8L3 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nat8f4G5E8L3 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nat8f4G5E8L3 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nat8f4G5E8L3 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Nat8f4G5E8L3 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nat8f4G5E8L3 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nat8f4G5E8L3 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nat8f4G5E8L3 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nat8f4G5E8L3 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nat8f4G5E8L3 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nat8f4G5E8L3 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nat8f4G5E8L3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nat8f4G5E8L3 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Nat8f4G5E8L3 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nat8f4G5E8L3 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nat8f4G5E8L3 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nat8f4G5E8L3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nat8f4G5E8L3 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nat8f4G5E8L3 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nat8f4G5E8L3 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nat8f4G5E8L3 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nat8f4G5E8L3 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nat8f4G5E8L3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nat8f4G5E8L3 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nat8f4G5E8L3 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nat8f4G5E8L3 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nat8f4G5E8L3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nat8f4G5E8L3 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nat8f4G5E8L3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nat8f4G5E8L3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nat8f4G5E8L3 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nat8f4G5E8L3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nat8f4G5E8L3 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nat8f4G5E8L3 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nat8f4G5E8L3 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nat8f4G5E8L3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nat8f4G5E8L3 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nat8f4G5E8L3 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Nat8f4G5E8L3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Nat8f4G5E8L3 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nat8f4G5E8L3 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nat8f4G5E8L3 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nat8f4G5E8L3 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nat8f4G5E8L3 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nat8f4G5E8L3 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nat8f4G5E8L3 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nat8f4G5E8L3 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Nat8f4G5E8L3 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nat8f4G5E8L3 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nat8f4G5E8L3 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Nat8f4G5E8L3 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nat8f4G5E8L3 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nat8f4G5E8L3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nat8f4G5E8L3 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nat8f4G5E8L3 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nat8f4G5E8L3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nat8f4G5E8L3 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Nat8f4G5E8L3 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nat8f4G5E8L3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nat8f4G5E8L3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nat8f4G5E8L3 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms